柯薩奇病毒A6型VP1蛋白的生物信息學(xué)分析
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更多相關(guān)文章: 柯薩奇病毒A組型 VP蛋白 生物學(xué)信息 B細(xì)胞表位 理化性質(zhì)
【摘要】:目的:預(yù)測柯薩奇病毒A組6型(Coxsackievirus A6,CVA6)的衣殼蛋白VP1的基本理化性質(zhì)、結(jié)構(gòu)功能及線性B細(xì)胞表位。方法:應(yīng)用Bioedit軟件、Sub Loc、Target P和生物信息學(xué)資源門戶Ex PASy中的多種在線工具對CVA6 VP1的氨基酸序列進(jìn)行分析。結(jié)果:CVA6 VP1為一親水性蛋白,其相對分子量為33.6 k D,等電點為7.92,含有24個可能的磷酸化位點,沒有信號肽、跨膜區(qū)和可能的脂;稽c;其二級結(jié)構(gòu)中以無規(guī)則卷曲居多,有48.52%的氨基酸殘基暴露于溶液界面;該分子內(nèi)存在多個潛在的線性B細(xì)胞表位,其中的155~165位氨基酸殘基區(qū)域的抗原指數(shù)最高。結(jié)論:成功預(yù)測到CVA6 VP1的基本理化性質(zhì)、結(jié)構(gòu)功能特征及可能的線性B細(xì)胞表位,為該蛋白的進(jìn)一步研究及疫苗和免疫診斷試劑的研制打下基礎(chǔ)。
【作者單位】: 桂林醫(yī)學(xué)院第二附屬醫(yī)院檢驗科;桂林醫(yī)學(xué)院藥學(xué)院;桂林醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院兒科;華中科技大學(xué)同濟(jì)醫(yī)學(xué)院免疫學(xué)系;
【關(guān)鍵詞】: 柯薩奇病毒A組型 VP蛋白 生物學(xué)信息 B細(xì)胞表位 理化性質(zhì)
【基金】:國家自然科學(xué)基金項目(81460304,81360248) 廣西自然科學(xué)基金(2015GXNSFDA139020) 廣西壯族自治區(qū)衛(wèi)生廳科研課題(Z2014298)
【分類號】:R373.23
【正文快照】: 手足口病(Hand,foot and mouth disease,HFMD)是兒童常見傳染病,其病原包括柯薩奇病毒(Cox-sackievirus,CV)、埃柯病毒和新型人腸道病毒(Hu-man enterovirus,HEV)的各部分成員,EV71型和CVA組(CVA)16型為最常見[1,2]。然而,近年其他HEV感染病例有增多趨勢[3];CVA6型在多個國家
【相似文獻(xiàn)】
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,本文編號:833525
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