蛋白質(zhì)序列的不同特征提取方式對(duì)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分類有很大的影響。為更好地表達(dá)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)信息,基于特征融合思想構(gòu)建特征向量,并使用一種基于多核支持向量機(jī)的方法,以多個(gè)核函數(shù)的線性加權(quán)代替?zhèn)鹘y(tǒng)的單一核函數(shù),在對(duì)多類特征進(jìn)行整合后構(gòu)造SimpleMKL分類模型;利用梯度下降法迭代求解核函數(shù)的權(quán)值系數(shù),并校準(zhǔn)核函數(shù)參數(shù)和不同特征表達(dá)的融合效果。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,該方法提高了蛋白質(zhì)二級(jí)結(jié)構(gòu)分類精度,在分類精度方面有明顯優(yōu)勢(shì),有助于準(zhǔn)確預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu)。

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【文章目錄】：
1 蛋白質(zhì)序列的特征提取
2 多核SVM分類模型
3 實(shí)驗(yàn)
    3.1 實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)
    3.2 實(shí)驗(yàn)環(huán)境
    3.3 參數(shù)設(shè)置
    3.4 評(píng)價(jià)指標(biāo)
    3.5 實(shí)驗(yàn)結(jié)果分析
4 結(jié)語(yǔ)



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