為了開發(fā)新型昆蟲抗菌肽資源,以黑水虻幼蟲為研究對(duì)象,采用RT-PCR技術(shù)從黑水虻幼蟲總RNA中擴(kuò)增到一個(gè)新型抗菌肽基因DLP-5,并利用在線生物軟件和工具分析了抗菌肽DLP-5的生物信息學(xué)特征。結(jié)果表明,DLP-5由40個(gè)氨基酸殘基組成,分子量為4 226.83 u,等電點(diǎn)為7.87,具有兩親性特征,其中N端為疏水性,C端為親水性,具有3個(gè)磷酸化位點(diǎn),無糖基化位點(diǎn)、信號(hào)肽序列和跨膜區(qū)。DLP-5的三級(jí)結(jié)構(gòu)包含1個(gè)N端的loop區(qū)、1個(gè)α螺旋和1對(duì)反向平行β折疊,構(gòu)成了防御素類抗菌肽典型的"環(huán)-螺旋-折疊"結(jié)構(gòu),說明DLP-5是一個(gè)新型的防御素類抗菌肽,可通過與微生物膜相互作用發(fā)揮其抗菌活性。

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 試驗(yàn)材料
    1.2 試驗(yàn)方法
        1.2.1 黑水虻抗菌肽基因的克隆
        1.2.2 黑水虻抗菌肽基因的生物信息學(xué)分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 黑水虻抗菌肽基因的克隆
    2.2 抗菌肽DLP-5的理化性質(zhì)
    2.3 抗菌肽DLP-5的跨膜區(qū)和信號(hào)肽分析
    2.4 抗菌肽DLP-5的疏水性分析
    2.5 抗菌肽DLP-5的糖基化位點(diǎn)和磷酸化位點(diǎn)分析
    2.6 抗菌肽DLP-5的高級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
3 討論



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