發(fā)布時間：2024-04-08 20:26

　　北極熊是生活在北冰洋附近的海上哺乳動物,主要以環(huán)斑豹為食,適應(yīng)北極終年寒冷的氣候。棕熊是與北極熊有較近遺傳關(guān)系的另一個物種,它們在分布范圍、行態(tài)、行為以及生理都有著明顯的不同�；蚪涣魇峭ㄟ^雜交或者回交將等位基因從一個物種流向另一個分離物種的基因庫中�；蚪涣鲝V泛存在于哺乳動物中,對于物種的進化與適應(yīng)起著重要的作用,比如犬屬物種之間的基因交流產(chǎn)生新的物種,促進犬屬的進化;牛屬之間的基因交流對于它們適應(yīng)高原環(huán)境以及馴化起著關(guān)鍵作用。而北極熊與ABC棕熊(生活在阿拉斯加Admiralty,Baranof和Chichagof三個島嶼的一種棕熊)在之前的研究中都存在著基因交流,然而對于它們之間基因交流的方向以及基因交流對于它們適應(yīng)當?shù)丨h(huán)境卻沒有很好的研究。北極熊與棕熊是在更新世分化的兩個物種,在更新世存在多次冰期與間冰期的交替,它們是如何適應(yīng)氣候的變化以及在分離后存在一系列的混合對適應(yīng)是否有影響?基于這樣的背景,我們通過gphocs分析群體歷史并通過PCAdmix、Dxy、rIBD等方法尋找到8個區(qū)域長度大于100 kb的基因交流的區(qū)域,從群體歷史的分析以及對基因交流區(qū)域構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,我們發(fā)...

【文章頁數(shù)】：59 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖３．１北極熊與棕熊的分歧時間??

８１．５２％。所有數(shù)據(jù)的深度都大于１４Ｘ?（附表）。經(jīng)過嚴格的過濾條件，總的４３??個個體一共鑒定得到約７２．１４Ｍ的ＳＮＰ位點。??３．?２北極熊與棕熊的分歧時間與遷移率??通過Ｇ－ＰｈｏＣＳ對北極熊與ＡＢＣ棕熊進行群體歷史分析，由于北極熊與棕??熊這兩個物種就以往的研究來看，....

圖３．?３?ＰＣＡｄｍｉｘ獲得７個基因交流區(qū)域??１５??

１Ａ?２Ａ?３Ａ?４Ａ?５Ａ?６Ａ?７Ａ?８Ａ?９Ａ??ｈａｐｌｏｔｙｐｅ??圖３．?２?ＡＢＣ棕熊所含祖先比例??ｓｃａｆｆｏｌｄ?１１?ｓｃａｆｆｏｌｄ?１９??圍圍???ｓ

圖３．?２?ＡＢＣ棕熊所含祖先比例??ｓｃａｆｆｏｌｄ?１１?ｓｃａｆｆｏｌｄ?１９??圍圍???ｓｃａｆｆｏｌｄ２０?????

?ｓｃａｆｆｏｌｄ?１８７??圍關(guān)??圖３．?３?ＰＣＡｄｍｉｘ獲得７個基因交流區(qū)域??１５??

圖３．?７?ＡＢＣ棟熊到北極熊基因交流區(qū)域的系統(tǒng)發(fā)育樹??３．?６?ＡＢＣ棕熊兩條單倍型不同的祖先比例??除了上述提到的北極熊與棕熊的雙向基因流以外，我們還發(fā)現(xiàn)ＡＢＣ棕熊的??

ｓｃａｆｆｏｌｄ８３?ｓｃａｆｆｏｌｄ?１８７??圖３．?６北極熊到ＡＢＣ棕熊基因交流區(qū)域的系統(tǒng)發(fā)育樹??１９??

本文編號：3948767