隨著生物醫(yī)學(xué)大數(shù)據(jù)的發(fā)展以及人們對(duì)心肌梗死(Myocardial Infarction,MI)的日益重視,MI的相關(guān)研究也日益增多。因此,有必要建立相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)以整合MI的相關(guān)研究,為相關(guān)科研人員和醫(yī)療工作者提供有價(jià)值的研究資源。課題主要分為三個(gè)部分。第一部分,我們構(gòu)建了 MI風(fēng)險(xiǎn)知識(shí)庫(kù)MIRKB(MIRisk Knowledge Base,http://sysbio.org.cn/MIRKB/),該數(shù)據(jù)庫(kù)包括從 4504 篇原始文獻(xiàn)挖掘到的8738條記錄,涉及1924個(gè)單因素、163個(gè)組合因素以及197個(gè)風(fēng)險(xiǎn)模型。第二部分,我們構(gòu)建了 MI基因數(shù)據(jù)庫(kù)MIGD(MI Gene Database,http://sysbio.org.cn/MIGD/),通過文獻(xiàn)挖掘和基因表達(dá)譜芯片分析,一共收集到852個(gè)基因,包括692個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因,148個(gè)非編碼RNA以及12個(gè)其他類別基因。第三部分,基于MIGD數(shù)據(jù)庫(kù)中的數(shù)據(jù),通過生物信息學(xué)分析探討MI的分子發(fā)病機(jī)制。研究發(fā)現(xiàn),MI相關(guān)基因主要富集在細(xì)胞過程調(diào)節(jié)、大分子代謝調(diào)節(jié)等生物過程和類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎、細(xì)胞因子與細(xì)胞因子受體等信號(hào)通路上。我們構(gòu)建了...

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【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖１．１?ＭＩ相關(guān)文獻(xiàn)增長(zhǎng)趨勢(shì)圖??為了開展Ｍ丨的相關(guān)研究，我們決定構(gòu)建兩個(gè)ＭＩ知識(shí)庫(kù)，一個(gè)用于收集ＭＩ相??關(guān)風(fēng)險(xiǎn)因素以及風(fēng)險(xiǎn)模型

心肌梗死知識(shí)庫(kù)構(gòu)建及應(yīng)用?第１章引言??進(jìn)行標(biāo)題檢索，共檢索到７４２２３篇與ＭＩ相關(guān)的文獻(xiàn)。由圖１．１可知，整體上ＭＩ相??關(guān)文獻(xiàn)的數(shù)目逐年遞增，呈指數(shù)增長(zhǎng)趨勢(shì)。２０００年新發(fā)表的ＭＩ相關(guān)文獻(xiàn)大約有１５００??篇，在２０１９年新發(fā)表的文獻(xiàn)數(shù)目己超過３０００篇。面對(duì)如此龐大的數(shù)據(jù)信....

圖１．２本課題工作流程安排??表１．１?ＭＩＲＫＢ數(shù)據(jù)庫(kù)與ＭＩＧＤ數(shù)據(jù)庫(kù)的比較??數(shù)據(jù)庫(kù)?構(gòu)建目的?內(nèi)容層面

??１￣??］??Ｉ?Ｉ?Ｉ?Ｉ?Ｉ?Ｉ?！???ｍｉＲＤＢ?Ｉ??ｉ??！?—？?ｍｉＲＮＡ－ｍＲＮＡ?＜?ｍｉＲＴａｒＢａｓｅ??ｍｉＲＮＡ?｜??分?醫(yī)生臨?環(huán)生社?ｊ?ＴａｒｇｅｔＳｃａｎ??子學(xué)理床?境活會(huì)?！???！??因圖因因因習(xí)心?｜???匕力目舊＿撕丨！?＾獲取....

圖２．２數(shù)據(jù)庫(kù)架構(gòu)圖??Ｆａｃｔｏｒ：描述因素信息的數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)，包括因素編號(hào)（ＦＩＤ）、名字（Ｎａｍｅ）、分??類（Ｃｌａｓｓｉｆｉｃａｔｉｏｎ）、子分類（Ｓｕｂｃｌａｓｓｉｆｉｃａｔｉｏｎ）以及描述（Ｄｅｓｃｒｉｐｔｉｏｎ）

Ｏｂｊｅｃｔｉｖｅ?Ｓａｍｐｌｅ?ｎｕｍｂｅｒ??ｓｔａｔｉｓｔｉｃｓ?Ｇｅｎｄｅｒ??．?．?Ｒｅｇｉｏｎ??Ｌｏａｃｌｕｓｉｏｎ??ＨＢＨＨＨＦ?Ｒａｃｅ??．?Ｄｉｓｅａｓｅ?ｈｉｓｔｏｒｙ??Ｌｅｓｉｏｎｓ?ｒａｎｇｅ?ｔＰＫ??Ｔｒｅａｔｍｅｎｔ?ｈｉｓｔｏｒ＼ｒ??Ｉ....

圖２．３系統(tǒng)功能模塊圖??

??５個(gè)模塊為數(shù)據(jù)下載模塊，為用戶提供數(shù)據(jù)共享服務(wù)。第６模塊為用戶幫助模塊，若??用戶對(duì)數(shù)據(jù)庫(kù)的使用存在疑惑，可通過第６模塊了解數(shù)據(jù)庫(kù)的使用方法。第７個(gè)模塊??為管理系統(tǒng)模塊，對(duì)數(shù)據(jù)庫(kù)的日程工作進(jìn)行更新與維護(hù)；還包括對(duì)用戶提交的數(shù)據(jù)進(jìn)??行審核，將通過審核的數(shù)據(jù)載入到數(shù)據(jù)庫(kù)中，供....

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