益生菌因其具有調(diào)節(jié)腸道微生態(tài)、調(diào)節(jié)免疫、抗炎和抗腫瘤等益生功能廣受消費者青睞,從而衍生出多種多樣的益生菌產(chǎn)品,如酸奶和益生菌OTC制劑,其全球消費量巨大。盡管有些益生菌菌株已被廣泛使用,但對菌株安全性,代謝能力差異,菌株之間復配的潛在互補性仍不夠清楚,尤其涉及到常見益生菌在不同疾病人群腸道中的相對豐度差異及潛在角色的系統(tǒng)性研究甚少,研究者和生產(chǎn)者難以精準開發(fā)和生產(chǎn)益生菌產(chǎn)品,消費者也缺乏足夠的依據(jù)去選擇產(chǎn)品。高通量測序技術(shù)的發(fā)展促進了益生菌基因組和腸道菌群測序的普及,特別是宏基因組關(guān)聯(lián)分析等方法對人類微生物群與許多非傳染性疾病(如肥胖、糖尿病、肝病,神經(jīng)退行性疾病甚至癌癥)關(guān)系的研究,顯示出腸道菌群具有成為新型益生菌來源庫的巨大潛力。豐富的已公開發(fā)表的疾病隊列腸道宏基因組測序數(shù)據(jù)、細菌基因組序列和先進的研究方法使得系統(tǒng)性地檢測常見益生菌的相對豐度和相互作用關(guān)系進而評估它們在腸道微生物群落中的角色以及比較它們的安全性和功能差異性及互補性成為可能。因此,本研究在疾病隊列的腸道細菌宏基因組數(shù)據(jù)和益生菌基因組數(shù)據(jù)的基礎上,進行數(shù)據(jù)挖掘,同時結(jié)合腸道細菌的大規(guī)模分離培養(yǎng)實驗和高通量單菌基因組測序...

【文章頁數(shù)】：102 頁

【學位級別】：博士

【部分圖文】：

圖３－３?ＡＣＶＤ隊列病例組與對照組的ｒｅａｄｓ分別對所有屬于咕ｍ沿和的菌株??的比對率??

向的可靠性，本研究將ＡＣＶＤ隊列的潔凈數(shù)據(jù)直接分別比對到ＭＴＰＳ的１５個菌（亞）種??的基因集上，采用非配對秩和檢驗方法，比較病例組與對照組ｒｅａｄｓ比對率的差異。結(jié)果??如圖３－２所示，ｎｓ表示病例組與對照組無顯著差異，＊＊＊＊表示病例組與對照組存在顯著??（尸＜０．００００１....

圖３－１０在類風濕性關(guān)節(jié)炎病例組或?qū)φ战M中顯著富集的菌種的共豐度網(wǎng)絡??－－

并將其與己發(fā)表［８４１的８株腸道細菌菌株的膽固醇降解能力進行初步比較。??３．２．１生長性能??由圖３－１１可知，嗜酸乳桿菌ＫＬＤＳ１．０卯１在接種后可迅速進入指數(shù)生長期，并在接種??后第２０?ｈ左右達到生長穩(wěn)定期。表明接種后第２０?ｈ可作為后續(xù)膽固醇降解能力實驗采集數(shù)??據(jù)的終....

圖３－１４?ＫＬＤＳ１．０９０１發(fā)酵液中膽固醇變化曲線??

?Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｔｅ＿ｐｒｏｔｅｇｅｎｓ??圖３－１０在類風濕性關(guān)節(jié)炎病例組或?qū)φ战M中顯著富集的菌種的共豐度網(wǎng)絡??Ｆｉｇｕｒｅ?３－１０?Ｃｏ－ａｂｕｎｄａｎｃｅ?ｎｅｔｗｏｒｋ?ｏｆ?ｓｐｅｃｉｅｓ?ｓｉｇｎｉｆｉｃａｎｔｌｙ?ｅｎｒｉｃｈｅｄ?ｉｎ?ＲＡ?ｏｒ?ｃｏｎ....

圖３－１７泛基因組指數(shù)與各個菌種內(nèi)ＡＡＩ?ｓｄ的相關(guān)性??

東北農(nóng)業(yè)大學工學博上學位論文??種內(nèi)分離來源數(shù)呈弱正相關(guān)［相關(guān)系數(shù)（ＣＣ）?０．５２６，Ｒ平方０．２２１］（圖３－１６）。ＰＩ與種內(nèi)??ＡＡＩ距離標準差呈弱正相關(guān)（ＡＡＩ?ｓｄ，?ＣＣ?０．５８１，Ｒ平方０．２８７）（圖３－１７）。ＰＩ與種內(nèi)基因??組個數(shù)呈弱正相關(guān)（ＣＣ?０．７....

本文編號：3910337