腸道微生物菌群結(jié)構(gòu)是腸道微生物與宿主及環(huán)境共同進(jìn)化的結(jié)果,了解鳥類腸道微生物結(jié)構(gòu),對(duì)探究鳥類生活史及健康狀態(tài)具有重要意義。本研究采用高通量測(cè)序方法,分析冬季、春季、夏季三個(gè)季節(jié)雜色山雀腸道微生物結(jié)構(gòu)差異并構(gòu)建雜色山雀核心菌群,探究雜色山雀腸道微生物組成與個(gè)體免疫力之間的關(guān)系。主要結(jié)果如下:(1)本研究共得到雜色山雀腸道微生物1010167條有效序列,按照97%相似性對(duì)非重復(fù)序列進(jìn)行OTU聚類,共得到3591個(gè)OTU的代表序列。Alpha多樣性顯示,不同季節(jié)間雜色山雀腸道微生物菌群多樣性和豐富度無顯著差異(F_2,21=1.01,P=0.38)。主坐標(biāo)分析和相似性分析顯示,雜色山雀冬季、春季和夏季的腸道微生物多樣性無顯著性差異。(2)研究共鑒定到37個(gè)門,85個(gè)綱,183個(gè)目,371個(gè)科,849個(gè)屬,1574個(gè)種。在門水平上,主要由厚壁菌門(Firmicutes),變形菌門(Proteobacteria)、放線菌門(Actinobacteria)、藍(lán)細(xì)菌門(Cyanobacteria)、擬桿菌門(Bacteroidetes)組成,核心菌屬包括乳桿菌屬(Lactobac...

【文章頁數(shù)】：44 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖3-1三個(gè)季節(jié)OTU韋恩圖

第3章研究結(jié)果14圖3-1三個(gè)季節(jié)OTU韋恩圖3.2.3測(cè)序深度分析繪制樣品稀釋曲線，如圖3-2。稀釋性曲線在測(cè)序量比較小時(shí)，隨著測(cè)序量的增加OTU的數(shù)量顯著增加，隨著測(cè)序量的逐漸增大，新增OTU的數(shù)量逐漸變緩，并趨于平坦，在樣品測(cè)序數(shù)據(jù)量達(dá)到30000條時(shí)，稀釋曲線趨于平坦，說....

圖3-224個(gè)樣品的稀釋性曲線

第3章研究結(jié)果14圖3-1三個(gè)季節(jié)OTU韋恩圖3.2.3測(cè)序深度分析繪制樣品稀釋曲線，如圖3-2。稀釋性曲線在測(cè)序量比較小時(shí)，隨著測(cè)序量的增加OTU的數(shù)量顯著增加，隨著測(cè)序量的逐漸增大，新增OTU的數(shù)量逐漸變緩，并趨于平坦，在樣品測(cè)序數(shù)據(jù)量達(dá)到30000條時(shí)，稀釋曲線趨于平坦，說....

圖3-324個(gè)樣品的Pan/Core曲線圖

第3章研究結(jié)果15隨著樣本量的逐漸增大，曲線趨于平緩，說明數(shù)據(jù)量已經(jīng)達(dá)到所需水平。Core曲線圖表明隨著樣本量的增大，核心OTU數(shù)目逐漸降低，當(dāng)樣本數(shù)量達(dá)到20時(shí)，其核心OTU數(shù)量為5，且隨著樣本數(shù)量的增加不再降低。圖3-324個(gè)樣品的Pan/Core曲線圖3.3不同季節(jié)雜色山雀....

圖3-4PCA分析

第3章研究結(jié)果17圖3-4PCA分析3.4雜色山雀腸道微生物組成3.4.1雜色山雀腸道微生物組成分析雜色山雀腸道微生物菌群組成，共得到3591個(gè)OTU，鑒定出37個(gè)門，85個(gè)綱，183個(gè)目，371個(gè)科，849個(gè)屬，1574個(gè)種。通過序列比對(duì)，冬、春、夏三個(gè)季節(jié)雜色山雀腸道微生物共....

本文編號(hào)：3900881