大麥?zhǔn)且环N歷史悠久的栽培作物。隨著全球氣候的不斷變化,大麥產(chǎn)量的增加、品質(zhì)的提高受到了各種惡劣環(huán)境因素的制約。為了完成其正常的生命周期,大麥可通過體內(nèi)的轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控相關(guān)基因的表達(dá),來緩解環(huán)境因素造成的傷害。堿性螺旋環(huán)螺旋(bHLH,basic helix-loop-helix)轉(zhuǎn)錄因子是植物體內(nèi)成員眾多的轉(zhuǎn)錄因子,廣泛參與植物的生理生化、生物合成、新城代謝以及信號激素調(diào)節(jié)等過程。本研究利用生物信息學(xué)分析方法,從全基因組水平上篩選和鑒定了大麥bHLH基因,并對鑒定得到的大麥bHLH基因的結(jié)構(gòu)、系統(tǒng)進(jìn)化、蛋白互作關(guān)系進(jìn)行研究;隨機挑選22個大麥bHLH基因,結(jié)合qRT-PCR分子檢測技術(shù),探究其在大麥根、莖、葉、花序以及外源脫落酸(ABA)、赤霉素(GA)、鹽(NaCl)脅迫處理下的表達(dá)模式。本試驗獲得的結(jié)果如下:1.通過對大麥全基因組、蛋白組數(shù)據(jù)庫進(jìn)行搜索,共篩選鑒定得到103個大麥bHLH基因。根據(jù)其在染色體上的物理位置,命名為HvbHLH001-HvbHLH103。對其理化性質(zhì)進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn),大麥bHLH蛋白大多定位于細(xì)胞核內(nèi),且分子質(zhì)量和等電點差異較大。2.大麥與水稻、擬南芥的系統(tǒng)發(fā)...

【文章頁數(shù)】：73 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
    1.1 引言
    1.2 轉(zhuǎn)錄因子
        1.2.1 轉(zhuǎn)錄因子的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)
        1.2.2 轉(zhuǎn)錄因子的分類
    1.3 bHLH轉(zhuǎn)錄因子的概述
        1.3.1 bHLH轉(zhuǎn)錄因子家族的基本結(jié)構(gòu)及特點
        1.3.2 bHLH轉(zhuǎn)錄因子家族的分類
        1.3.3 bHLH轉(zhuǎn)錄因子家族的進(jìn)化
        1.3.4 植物體內(nèi)bHLH轉(zhuǎn)錄因子家族的二聚體
    1.4 植物bHLH轉(zhuǎn)錄因子家族的生物學(xué)功能
        1.4.1 bHLH家族參與調(diào)節(jié)植物生長發(fā)育
        1.4.2 bHLH家族參與調(diào)節(jié)植物光形態(tài)建成
        1.4.3 bHLH家族參與調(diào)節(jié)植物體內(nèi)活性成分的合成
        1.4.4 bHLH家族參與植物逆境脅迫過程
    1.5 本研究的目的及意義
第二章 材料與方法
    2.1 試驗材料及處理
    2.2 大麥bHLH轉(zhuǎn)錄因子家族的識別與鑒定
    2.3 大麥bHLH基因的染色體分布、基因結(jié)構(gòu)以及保守基序分析
    2.4 大麥bHLH基因的進(jìn)化分析
    2.5 大麥bHLH基因復(fù)制事件以及與水稻、玉米、高粱之間的共線性分析
    2.6 大麥bHLH基因本體論(GO)注釋以及蛋白互作網(wǎng)絡(luò)調(diào)控分析
    2.7 大麥bHLH基因前1.5kb區(qū)域中順式作用元件的分析
    2.8 大麥bHLH基因譜表達(dá)分析
    2.9 大麥bHLH基因的實時熒光定量PCR分析
        2.9.1 RNA提取和c DNA的制備
        2.9.2 實時熒光定量PCR
        2.9.3 數(shù)據(jù)分析
第三章 結(jié)果與分析
    3.1 大麥bHLH基因的鑒定及物理化學(xué)性質(zhì)分析
    3.2 大麥bHLH蛋白的序列比對及與DNA結(jié)合能力的分析
    3.3 大麥bHLH基因進(jìn)化關(guān)系、結(jié)構(gòu)、及保守基序分析
    3.4 大麥bHLH基因的復(fù)制事件及與其他物種的共線性分析
    3.5 大麥bHLH基因的本體論注釋分析
    3.6 大麥bHLH蛋白與大麥中其他蛋白互作關(guān)系的分析
    3.7 大麥bHLH基因的啟動子分析
    3.8 大麥bHLH基因的表達(dá)譜分析
    3.9 大麥bHLH基因的qRT-PCR驗證
第四章 討論
    4.1 大麥bHLH轉(zhuǎn)錄因子與其他作物間的差異
    4.2 大麥bHLH蛋白序列與進(jìn)化關(guān)系
    4.3 大麥bHLH的基因結(jié)構(gòu)與保守基序
    4.4 大麥bHLH基因復(fù)制及與水稻、玉米、高粱之間的共線性關(guān)系
    4.5 大麥bHLH基因的生物學(xué)功能
第五章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
個人簡歷



本文編號：3898977