新疆位于中國的西北部,長期以來作為東西方聯(lián)系的樞紐。自漢代(公元前207-220年)以來在新疆開辟的絲綢之路是聯(lián)系中外的紐帶,溝通東西方的橋梁。新疆地區(qū)的人群具有復(fù)雜的遺傳歷史�；诂F(xiàn)代新疆人群的遺傳學(xué)研究表明,該地區(qū)人群與歐亞大陸東部和西部人群都具有遺傳聯(lián)系。新疆早期人群的起源、遷徙及融合歷史一直是學(xué)術(shù)界研究的熱點(diǎn)。本論文以新疆東天山地區(qū)鐵器時(shí)期石人子溝遺址發(fā)掘出的古代個(gè)體為研究對象。通過對其全基因組進(jìn)行測序及遺傳分析,揭示該人群的遺傳組成,探討該地區(qū)人群的起源及混合歷史。我們從12個(gè)古代個(gè)體中成功獲取了10個(gè)個(gè)體的全基因組數(shù)據(jù),覆蓋度為0.04x到0.75x。其中5個(gè)樣本進(jìn)行¹4C測年,其年代全屬于鐵器時(shí)代(公元前200-100年)。經(jīng)性別鑒定,其中4例樣本為女性,其余6例為男性。我們對這些樣本的線粒體和Y染色體的單倍型類群進(jìn)行了劃分,得到U4、U5、H、A、D4和G3共六種線粒體單倍型類群,以及R1b和Q1a兩種Y染色體單倍型類群。石人子溝古代人群在父系和母系遺傳方面均存在歐亞大陸東西部譜系的混合。石人子溝人群常染色體基因組數(shù)據(jù)的遺傳學(xué)分析同樣表明該人群在遺...

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【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖1.2樣本顳骨巖部剖面圖[44]1.3.2測序技術(shù)

[43]。顳骨巖部形狀的剖面圖見圖1.2。

圖3.2抽提后電泳檢驗(yàn)圖3.2.2DNA

PCR過程均需做空白對照，結(jié)果見圖3.2。圖3.2抽提后電泳檢驗(yàn)圖3.2.2古DNA建庫結(jié)果用脂糖凝膠電泳對DNA目標(biāo)片段進(jìn)行檢驗(yàn)，見圖3.3。圖3.3樣本建庫后電泳圖用Qubit2.0進(jìn)行DNA的定量測定，結(jié)果表明：本研究中的樣本均符合上機(jī)

圖3.5石人子溝古代個(gè)體DNA損傷模式

見圖3.4和圖3.5，符合古DNA序列的特征。同時(shí)片段長度呈現(xiàn)正態(tài)分布，平均長度均為60bp左右，也證明了樣本數(shù)據(jù)的真實(shí)性。實(shí)驗(yàn)過程中所有步驟嚴(yán)格遵守古DNA實(shí)驗(yàn)標(biāo)準(zhǔn)，并進(jìn)行重復(fù)驗(yàn)證，所有樣本的線粒體單倍型與所接觸過實(shí)驗(yàn)人員的線粒體單倍型對比并不相同，排除現(xiàn)代人的污染。mtDNA....

圖3.6石人子溝個(gè)體之間親緣關(guān)系的計(jì)算數(shù)值3.2.6線粒體和Y染色體單倍型類群劃分10

10個(gè)樣本進(jìn)行了親緣關(guān)系鑒定。本研究通過計(jì)算不同個(gè)體間基因組的錯配概率來進(jìn)行親緣關(guān)系的判定。如圖3.6所示：虛線表示給定關(guān)系（r）的預(yù)期成對錯配率值。當(dāng)r=1時(shí)兩個(gè)樣本可被認(rèn)為來自同一個(gè)體，當(dāng)r=0被認(rèn)為兩個(gè)體間沒有任何關(guān)系，r=0.5為一級親緣關(guān)系，r=0.25....

本文編號：3890573