新疆位于中國(guó)的西北部,長(zhǎng)期以來(lái)作為東西方聯(lián)系的樞紐。自漢代(公元前207-220年)以來(lái)在新疆開(kāi)辟的絲綢之路是聯(lián)系中外的紐帶,溝通東西方的橋梁。新疆地區(qū)的人群具有復(fù)雜的遺傳歷史�；诂F(xiàn)代新疆人群的遺傳學(xué)研究表明,該地區(qū)人群與歐亞大陸東部和西部人群都具有遺傳聯(lián)系。新疆早期人群的起源、遷徙及融合歷史一直是學(xué)術(shù)界研究的熱點(diǎn)。本論文以新疆東天山地區(qū)鐵器時(shí)期石人子溝遺址發(fā)掘出的古代個(gè)體為研究對(duì)象。通過(guò)對(duì)其全基因組進(jìn)行測(cè)序及遺傳分析,揭示該人群的遺傳組成,探討該地區(qū)人群的起源及混合歷史。我們從12個(gè)古代個(gè)體中成功獲取了10個(gè)個(gè)體的全基因組數(shù)據(jù),覆蓋度為0.04x到0.75x。其中5個(gè)樣本進(jìn)行¹4C測(cè)年,其年代全屬于鐵器時(shí)代(公元前200-100年)。經(jīng)性別鑒定,其中4例樣本為女性,其余6例為男性。我們對(duì)這些樣本的線粒體和Y染色體的單倍型類(lèi)群進(jìn)行了劃分,得到U4、U5、H、A、D4和G3共六種線粒體單倍型類(lèi)群,以及R1b和Q1a兩種Y染色體單倍型類(lèi)群。石人子溝古代人群在父系和母系遺傳方面均存在歐亞大陸東西部譜系的混合。石人子溝人群常染色體基因組數(shù)據(jù)的遺傳學(xué)分析同樣表明該人群在遺...

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【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖1.2樣本顳骨巖部剖面圖[44]1.3.2測(cè)序技術(shù)

[43]。顳骨巖部形狀的剖面圖見(jiàn)圖1.2。

圖3.2抽提后電泳檢驗(yàn)圖3.2.2DNA

PCR過(guò)程均需做空白對(duì)照，結(jié)果見(jiàn)圖3.2。圖3.2抽提后電泳檢驗(yàn)圖3.2.2古DNA建庫(kù)結(jié)果用脂糖凝膠電泳對(duì)DNA目標(biāo)片段進(jìn)行檢驗(yàn)，見(jiàn)圖3.3。圖3.3樣本建庫(kù)后電泳圖用Qubit2.0進(jìn)行DNA的定量測(cè)定，結(jié)果表明：本研究中的樣本均符合上機(jī)

圖3.5石人子溝古代個(gè)體DNA損傷模式

見(jiàn)圖3.4和圖3.5，符合古DNA序列的特征。同時(shí)片段長(zhǎng)度呈現(xiàn)正態(tài)分布，平均長(zhǎng)度均為60bp左右，也證明了樣本數(shù)據(jù)的真實(shí)性。實(shí)驗(yàn)過(guò)程中所有步驟嚴(yán)格遵守古DNA實(shí)驗(yàn)標(biāo)準(zhǔn)，并進(jìn)行重復(fù)驗(yàn)證，所有樣本的線粒體單倍型與所接觸過(guò)實(shí)驗(yàn)人員的線粒體單倍型對(duì)比并不相同，排除現(xiàn)代人的污染。mtDNA....

圖3.6石人子溝個(gè)體之間親緣關(guān)系的計(jì)算數(shù)值3.2.6線粒體和Y染色體單倍型類(lèi)群劃分10

10個(gè)樣本進(jìn)行了親緣關(guān)系鑒定。本研究通過(guò)計(jì)算不同個(gè)體間基因組的錯(cuò)配概率來(lái)進(jìn)行親緣關(guān)系的判定。如圖3.6所示：虛線表示給定關(guān)系（r）的預(yù)期成對(duì)錯(cuò)配率值。當(dāng)r=1時(shí)兩個(gè)樣本可被認(rèn)為來(lái)自同一個(gè)體，當(dāng)r=0被認(rèn)為兩個(gè)體間沒(méi)有任何關(guān)系，r=0.5為一級(jí)親緣關(guān)系，r=0.25....

本文編號(hào)：3890573