隨著基因組學(xué)的不斷發(fā)展,絕大多數(shù)高等生物個體的全基因組序列信息已經(jīng)被獲知,然而在這些全基因組序列信息中，往往缺乏關(guān)于在同源染色體上以連鎖形式遺傳的單堿基到多堿基變異的順序的信息,這些信息通常被稱之為單倍體型;此外,大多數(shù)已經(jīng)被測序的物種在其參考基因組序列中都存在諸如太的結(jié)構(gòu)變異、重復(fù)序列等現(xiàn)有技術(shù)難以分析的區(qū)域的序列信息缺失。因此亟需建立一種簡單,快捷,經(jīng)濟的單倍體分型技術(shù)。該技術(shù)要不依賴于龐大的自動化分液設(shè)備,繁雜的實驗操作和大量的時間投入。所以基于單管的,虛擬物理分隔的,聯(lián)合標簽標記的長片段測序技術(shù)是最好的選擇。本論文研發(fā)了一種低成本的基于標簽共標記的單管長片段測序技術(shù)(stLFR),這一技術(shù)與二代測序平臺結(jié)合,彌補了二代測序技術(shù)讀長短的缺點,能間接獲得平均50kb的讀長,同時又擁有二代測序技術(shù)準確率高和成本低的優(yōu)點。本研究技術(shù)構(gòu)建的stlLFR文庫可以獲得超過8百萬條長度為20-300kb基因組DNA分子,這些長DNA分子中的每一條分子能被測序到的區(qū)域占總長度的20%。利用stLFR對人類基因組標準品DNA NA12878的序列進行分析，得到了高質(zhì)量的變異檢測結(jié)果。stLFR技術(shù)...

【文章頁數(shù)】：61 頁

【學(xué)位級別】：碩士

本文編號：3876973