寨卡病毒NS2A通過(guò)伴侶分子介導(dǎo)的自噬降解KPNA2的機(jī)制研究
發(fā)布時(shí)間:2023-12-09 09:56
寨卡病毒(ZIKA Virus,ZIKV)是一種主要通過(guò)伊蚊傳播的RNA病毒,屬于黃病毒科黃病毒屬中的成員。該病毒于1947年首次分離于烏干達(dá)地區(qū)的寨卡森林。ZIKV大多數(shù)感染者表現(xiàn)為無(wú)癥狀或僅有輕微癥狀,孕婦感染ZIKV可以將病毒傳播給胎兒,致使新生兒患有先天性嚴(yán)重小頭畸形和神經(jīng)系統(tǒng)缺陷,同時(shí)還可以引起早產(chǎn)或流產(chǎn)。成年人感染ZIKV會(huì)引起一種罕見(jiàn)的嚴(yán)重自身免疫性疾病-格林-巴利綜合征。在第一次有記載的太平洋島發(fā)生人感染ZIKV案例和近期南美ZIKV流行性感染暴發(fā)并迅速傳播至全球60多個(gè)國(guó)家之前,該病毒并未受到關(guān)注。最近在中美洲和南美洲爆發(fā)的疫情引起了公眾對(duì)ZIKV感染的廣泛關(guān)注,對(duì)ZIKV的研究也有一些新的進(jìn)展。然而,ZIKV與宿主細(xì)胞互作的機(jī)制尚未確定,針對(duì)ZIKV的疫苗或治療ZIKV感染的藥物尚未研制成功。在本實(shí)驗(yàn)室對(duì)KPNA6和ZIKV互作機(jī)制的研究中發(fā)現(xiàn),ZIKV感染宿主細(xì)胞可以引起核轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白KPNA6的表達(dá)升高,KPNA6基因敲除可以抑制ZIKV的復(fù)制。在應(yīng)用蛋白質(zhì)質(zhì)譜分析未感染和ZIKV感染樣品的實(shí)驗(yàn)中,篩選出ZIKV感染后降低的多個(gè)蛋白,其中,KPNA2在ZIKV感染后...
【文章頁(yè)數(shù)】:136 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
中文摘要
abstract
英文縮寫(xiě)詞表
引言
第一篇 文獻(xiàn)綜述
第1章 寨卡病毒研究進(jìn)展
1.1 ZIKV分子生物學(xué)及病毒學(xué)特征
1.1.1 ZIKV病毒學(xué)分類(lèi)
1.1.2 ZIKV形態(tài)結(jié)構(gòu)和理化特性
1.1.3 ZIKV基因組結(jié)構(gòu)及功能
1.2 ZIKV生命周期
1.3 ZIKV致病機(jī)制
1.3.1 ZIKV感染的趨向性
1.3.2 ZIKV感染導(dǎo)致細(xì)胞死亡的機(jī)制
1.3.3 宿主細(xì)胞限制因子干擾ZIKV病毒復(fù)制的機(jī)制
1.3.4 ZIKV的免疫逃避機(jī)制
1.4 ZIKV的預(yù)防與治療
第2章 核輸入蛋白
2.1 核定位信號(hào)
2.2 核運(yùn)輸體系
2.2.1 核孔復(fù)合物
2.2.2 核胞質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)體
2.2.3 Ran GTPase
2.3 經(jīng)典核蛋白導(dǎo)入的分子機(jī)制
2.4 核輸入蛋白KPNA的生物學(xué)功能
第3章 伴侶分子介導(dǎo)的自噬
3.1 CMA的發(fā)現(xiàn)
3.2 CMA的分子機(jī)制
3.2.1 貨物分子的選擇
3.2.2 HSC70 參與CMA通路
3.2.3 溶酶體受體LAMP2A的功能
3.3 CMA在生理學(xué)中的意義
3.4 CMA的臨床意義
3.4.1 CMA抵抗衰老的作用
3.4.2 CMA在神經(jīng)退行性疾病中的意義
3.4.3 CMA在癌癥中的意義
第二篇 研究?jī)?nèi)容
第1章 寨卡病毒對(duì)核輸入蛋白KPNA2的影響
1.1 材料
1.1.1 細(xì)胞、病毒、試劑、抗體
1.1.2 主要儀器
1.2 方法
1.2.1 ZIKV病毒的繁殖
1.2.2 Western Blot檢測(cè)KPNA2 蛋白水平
1.2.3 RT-q PCR檢測(cè)KPNA2 m RNA水平
1.2.4 不同細(xì)胞系KPNA2蛋白水平的檢測(cè)
1.2.5 Western Blot檢測(cè)感染時(shí)間和感染復(fù)數(shù)對(duì)KPNA2 的影響
1.2.6 圖像處理及統(tǒng)計(jì)分析
1.3 結(jié)果
1.3.1 ZIKV感染對(duì)KPNA2 水平的影響
1.3.2 ZIKV感染時(shí)間和感染復(fù)數(shù)對(duì)KPNA2 的影響
1.4 討論
1.5 小結(jié)
第2章 核輸入蛋白KPNA2的降解途徑
2.1 材料
2.1.1 細(xì)胞、病毒、試劑、抗體、載體
2.1.2 主要儀器
2.2 方法
2.2.1 KPNA2蛋白降解部位的確定
2.2.2 細(xì)胞活力測(cè)定實(shí)驗(yàn)檢測(cè)MG132和NH4CL對(duì)細(xì)胞活力的影響
2.2.3 RT-q PCR檢測(cè)MG132和NH4CL對(duì) ZIKV感染的影響
2.2.4 KPNA2蛋白半衰期的檢測(cè)
2.2.5 免疫共沉淀檢測(cè)KPNA2泛素化水平
2.2.6 免疫共沉淀檢測(cè)KPNA2與LAMP2A相互作用
2.2.7 激光共聚焦檢測(cè)KPNA2與LAMP2A共定位
2.2.8 LAMP2A敲降細(xì)胞系的建立
2.2.9 細(xì)胞活力測(cè)定實(shí)驗(yàn)檢測(cè)LAMP2A敲降細(xì)胞的活力
2.2.10 檢測(cè)LAMP2A敲降細(xì)胞內(nèi)ZIKV感染對(duì)KPNA2 水平的影響
2.2.11 圖像處理及統(tǒng)計(jì)分析
2.3 結(jié)果
2.3.1 KPNA2蛋白降解部位的確定
2.3.2 ZIKV對(duì) KPNA2 半衰期的影響
2.3.3 ZIKV感染對(duì)KPNA2 泛素化水平的影響
2.3.4 免疫共沉淀對(duì)KPNA2與LAMP2A相互作用的檢測(cè)
2.3.5 激光共聚焦對(duì)KPNA2與LAMP2A相互作用的檢測(cè)
2.3.6 LAMP2A敲降對(duì)KPNA2 的影響
2.3.7 LAMP2A敲降對(duì)ZIKV病毒導(dǎo)致的KPNA2 降低的影響
2.4 討論
2.5 小結(jié)
第3章 ZIKV非結(jié)構(gòu)蛋白NS2A對(duì) KPNA2 降解作用機(jī)制
3.1 材料
3.1.1 細(xì)胞、病毒、試劑、抗體、載體
3.1.2 主要儀器
3.2 方法
3.2.1 寨卡病毒蛋白重組質(zhì)粒的構(gòu)建
3.2.2 Western Bolt檢測(cè)寨卡病毒蛋白對(duì)KPNA2 蛋白表達(dá)水平的影響
3.2.3 不同劑量NS2A對(duì) KPNA2 蛋白表達(dá)水平的影響
3.2.4 ZIKV NS2A與 KPNA2 之間相互作用的檢測(cè)
3.2.5 LAMP2A敲降對(duì)ZIKV NS2A和 KPNA2 相互作用的影響
3.2.6 細(xì)胞活力測(cè)定實(shí)驗(yàn)檢測(cè)NS2A質(zhì)粒轉(zhuǎn)染對(duì)HEK293 細(xì)胞的影響
3.2.7 ZIKV NS2A蛋白結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè)及質(zhì)粒構(gòu)建
3.2.8 ZIKV NS2A截短突變體對(duì)KPNA2 重組蛋白表達(dá)的影響
3.2.9 ZIKV NS2A點(diǎn)突變體的構(gòu)建
3.2.10 ZIKV NS2A點(diǎn)突變體對(duì)KPNA2 重組蛋白表達(dá)的影響
3.2.11 免疫共沉淀驗(yàn)證T100A點(diǎn)突變對(duì)NS2A與 KPNA2 之間相互作用的影響
3.2.12 T100A點(diǎn)突變對(duì)ZIKV病毒復(fù)制的影響
3.2.13 圖像處理及統(tǒng)計(jì)分析
3.3 結(jié)果
3.3.1 ZIKV病毒蛋白對(duì)KPNA2 表達(dá)水平的影響
3.3.2 ZIKV NS2A與 KPNA2 之間的相互作用
3.3.3 LAMP2A敲除對(duì)NS2A與 KPNA2 相互作用的影響
3.3.4 ZIKV NS2A截短突變體對(duì)KPNA2 重組蛋白表達(dá)的影響
3.3.5 ZIKV NS2A點(diǎn)突變體對(duì)KPNA2 重組蛋白表達(dá)的影響
3.3.6 NS2A點(diǎn)突變對(duì)NS2A與 KPNA2 相互作用的影響
3.3.7 NS2A點(diǎn)突變感染性克隆的構(gòu)建及點(diǎn)突變病毒株的拯救
3.3.8 NS2A點(diǎn)突變對(duì)ZIKV復(fù)制的影響
3.3.9 NS2A點(diǎn)突變對(duì)ZIKV感染的細(xì)胞中KPNA2 蛋白水平的影響
3.4 討論
3.5 小結(jié)
第4章 核輸入蛋白KPNA2對(duì)寨卡病毒復(fù)制的影響
4.1 材料
4.1.1 細(xì)胞、病毒、試劑、抗體、載體
4.1.2 主要儀器
4.2 方法
4.2.1 KPNA2點(diǎn)突變體的構(gòu)建
4.2.2 KPNA2 點(diǎn)突變對(duì)KPNA2 表達(dá)水平的影響
4.2.3 KPNA2 點(diǎn)突變對(duì)KPNA2和LAMP2A相互作用的影響
4.2.4 KPNA2 點(diǎn)突變對(duì)KPNA2和NS2A相互作用的影響
4.2.5 KPNA2 敲降對(duì)ZIKV病毒復(fù)制的影響
4.2.6 KPNA2敲降對(duì)細(xì)胞活力的影響
4.2.7 圖像處理及統(tǒng)計(jì)分析
4.3 結(jié)果
4.3.1 KPNA2 點(diǎn)突變對(duì)KPNA2 表達(dá)水平的影響
4.3.2 KPNA2 點(diǎn)突變對(duì)KPNA2和LAMP2A相互作用的影響
4.3.3 KPNA2 點(diǎn)突變對(duì)KPNA2和NS2A相互作用的影響
4.3.4 KPNA2 敲降對(duì)ZIKV病毒復(fù)制的影響
4.4 討論
4.5 小結(jié)
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
導(dǎo)師簡(jiǎn)介
作者簡(jiǎn)介
致謝
本文編號(hào):3871339
【文章頁(yè)數(shù)】:136 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
中文摘要
abstract
英文縮寫(xiě)詞表
引言
第一篇 文獻(xiàn)綜述
第1章 寨卡病毒研究進(jìn)展
1.1 ZIKV分子生物學(xué)及病毒學(xué)特征
1.1.1 ZIKV病毒學(xué)分類(lèi)
1.1.2 ZIKV形態(tài)結(jié)構(gòu)和理化特性
1.1.3 ZIKV基因組結(jié)構(gòu)及功能
1.2 ZIKV生命周期
1.3 ZIKV致病機(jī)制
1.3.1 ZIKV感染的趨向性
1.3.2 ZIKV感染導(dǎo)致細(xì)胞死亡的機(jī)制
1.3.3 宿主細(xì)胞限制因子干擾ZIKV病毒復(fù)制的機(jī)制
1.3.4 ZIKV的免疫逃避機(jī)制
1.4 ZIKV的預(yù)防與治療
第2章 核輸入蛋白
2.1 核定位信號(hào)
2.2 核運(yùn)輸體系
2.2.1 核孔復(fù)合物
2.2.2 核胞質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)體
2.2.3 Ran GTPase
2.3 經(jīng)典核蛋白導(dǎo)入的分子機(jī)制
2.4 核輸入蛋白KPNA的生物學(xué)功能
第3章 伴侶分子介導(dǎo)的自噬
3.1 CMA的發(fā)現(xiàn)
3.2 CMA的分子機(jī)制
3.2.1 貨物分子的選擇
3.2.2 HSC70 參與CMA通路
3.2.3 溶酶體受體LAMP2A的功能
3.3 CMA在生理學(xué)中的意義
3.4 CMA的臨床意義
3.4.1 CMA抵抗衰老的作用
3.4.2 CMA在神經(jīng)退行性疾病中的意義
3.4.3 CMA在癌癥中的意義
第二篇 研究?jī)?nèi)容
第1章 寨卡病毒對(duì)核輸入蛋白KPNA2的影響
1.1 材料
1.1.1 細(xì)胞、病毒、試劑、抗體
1.1.2 主要儀器
1.2 方法
1.2.1 ZIKV病毒的繁殖
1.2.2 Western Blot檢測(cè)KPNA2 蛋白水平
1.2.3 RT-q PCR檢測(cè)KPNA2 m RNA水平
1.2.4 不同細(xì)胞系KPNA2蛋白水平的檢測(cè)
1.2.5 Western Blot檢測(cè)感染時(shí)間和感染復(fù)數(shù)對(duì)KPNA2 的影響
1.2.6 圖像處理及統(tǒng)計(jì)分析
1.3 結(jié)果
1.3.1 ZIKV感染對(duì)KPNA2 水平的影響
1.3.2 ZIKV感染時(shí)間和感染復(fù)數(shù)對(duì)KPNA2 的影響
1.4 討論
1.5 小結(jié)
第2章 核輸入蛋白KPNA2的降解途徑
2.1 材料
2.1.1 細(xì)胞、病毒、試劑、抗體、載體
2.1.2 主要儀器
2.2 方法
2.2.1 KPNA2蛋白降解部位的確定
2.2.2 細(xì)胞活力測(cè)定實(shí)驗(yàn)檢測(cè)MG132和NH4CL對(duì)細(xì)胞活力的影響
2.2.3 RT-q PCR檢測(cè)MG132和NH4CL對(duì) ZIKV感染的影響
2.2.4 KPNA2蛋白半衰期的檢測(cè)
2.2.5 免疫共沉淀檢測(cè)KPNA2泛素化水平
2.2.6 免疫共沉淀檢測(cè)KPNA2與LAMP2A相互作用
2.2.7 激光共聚焦檢測(cè)KPNA2與LAMP2A共定位
2.2.8 LAMP2A敲降細(xì)胞系的建立
2.2.9 細(xì)胞活力測(cè)定實(shí)驗(yàn)檢測(cè)LAMP2A敲降細(xì)胞的活力
2.2.10 檢測(cè)LAMP2A敲降細(xì)胞內(nèi)ZIKV感染對(duì)KPNA2 水平的影響
2.2.11 圖像處理及統(tǒng)計(jì)分析
2.3 結(jié)果
2.3.1 KPNA2蛋白降解部位的確定
2.3.2 ZIKV對(duì) KPNA2 半衰期的影響
2.3.3 ZIKV感染對(duì)KPNA2 泛素化水平的影響
2.3.4 免疫共沉淀對(duì)KPNA2與LAMP2A相互作用的檢測(cè)
2.3.5 激光共聚焦對(duì)KPNA2與LAMP2A相互作用的檢測(cè)
2.3.6 LAMP2A敲降對(duì)KPNA2 的影響
2.3.7 LAMP2A敲降對(duì)ZIKV病毒導(dǎo)致的KPNA2 降低的影響
2.4 討論
2.5 小結(jié)
第3章 ZIKV非結(jié)構(gòu)蛋白NS2A對(duì) KPNA2 降解作用機(jī)制
3.1 材料
3.1.1 細(xì)胞、病毒、試劑、抗體、載體
3.1.2 主要儀器
3.2 方法
3.2.1 寨卡病毒蛋白重組質(zhì)粒的構(gòu)建
3.2.2 Western Bolt檢測(cè)寨卡病毒蛋白對(duì)KPNA2 蛋白表達(dá)水平的影響
3.2.3 不同劑量NS2A對(duì) KPNA2 蛋白表達(dá)水平的影響
3.2.4 ZIKV NS2A與 KPNA2 之間相互作用的檢測(cè)
3.2.5 LAMP2A敲降對(duì)ZIKV NS2A和 KPNA2 相互作用的影響
3.2.6 細(xì)胞活力測(cè)定實(shí)驗(yàn)檢測(cè)NS2A質(zhì)粒轉(zhuǎn)染對(duì)HEK293 細(xì)胞的影響
3.2.7 ZIKV NS2A蛋白結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè)及質(zhì)粒構(gòu)建
3.2.8 ZIKV NS2A截短突變體對(duì)KPNA2 重組蛋白表達(dá)的影響
3.2.9 ZIKV NS2A點(diǎn)突變體的構(gòu)建
3.2.10 ZIKV NS2A點(diǎn)突變體對(duì)KPNA2 重組蛋白表達(dá)的影響
3.2.11 免疫共沉淀驗(yàn)證T100A點(diǎn)突變對(duì)NS2A與 KPNA2 之間相互作用的影響
3.2.12 T100A點(diǎn)突變對(duì)ZIKV病毒復(fù)制的影響
3.2.13 圖像處理及統(tǒng)計(jì)分析
3.3 結(jié)果
3.3.1 ZIKV病毒蛋白對(duì)KPNA2 表達(dá)水平的影響
3.3.2 ZIKV NS2A與 KPNA2 之間的相互作用
3.3.3 LAMP2A敲除對(duì)NS2A與 KPNA2 相互作用的影響
3.3.4 ZIKV NS2A截短突變體對(duì)KPNA2 重組蛋白表達(dá)的影響
3.3.5 ZIKV NS2A點(diǎn)突變體對(duì)KPNA2 重組蛋白表達(dá)的影響
3.3.6 NS2A點(diǎn)突變對(duì)NS2A與 KPNA2 相互作用的影響
3.3.7 NS2A點(diǎn)突變感染性克隆的構(gòu)建及點(diǎn)突變病毒株的拯救
3.3.8 NS2A點(diǎn)突變對(duì)ZIKV復(fù)制的影響
3.3.9 NS2A點(diǎn)突變對(duì)ZIKV感染的細(xì)胞中KPNA2 蛋白水平的影響
3.4 討論
3.5 小結(jié)
第4章 核輸入蛋白KPNA2對(duì)寨卡病毒復(fù)制的影響
4.1 材料
4.1.1 細(xì)胞、病毒、試劑、抗體、載體
4.1.2 主要儀器
4.2 方法
4.2.1 KPNA2點(diǎn)突變體的構(gòu)建
4.2.2 KPNA2 點(diǎn)突變對(duì)KPNA2 表達(dá)水平的影響
4.2.3 KPNA2 點(diǎn)突變對(duì)KPNA2和LAMP2A相互作用的影響
4.2.4 KPNA2 點(diǎn)突變對(duì)KPNA2和NS2A相互作用的影響
4.2.5 KPNA2 敲降對(duì)ZIKV病毒復(fù)制的影響
4.2.6 KPNA2敲降對(duì)細(xì)胞活力的影響
4.2.7 圖像處理及統(tǒng)計(jì)分析
4.3 結(jié)果
4.3.1 KPNA2 點(diǎn)突變對(duì)KPNA2 表達(dá)水平的影響
4.3.2 KPNA2 點(diǎn)突變對(duì)KPNA2和LAMP2A相互作用的影響
4.3.3 KPNA2 點(diǎn)突變對(duì)KPNA2和NS2A相互作用的影響
4.3.4 KPNA2 敲降對(duì)ZIKV病毒復(fù)制的影響
4.4 討論
4.5 小結(jié)
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
導(dǎo)師簡(jiǎn)介
作者簡(jiǎn)介
致謝
本文編號(hào):3871339
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