基于固體核磁共振方法的蛋白質(zhì)組裝體三維結(jié)構(gòu)解析
發(fā)布時間:2023-11-10 19:12
蛋白質(zhì)組裝體廣泛存在于生物體內(nèi),具有相關(guān)生物學(xué)功能或與人類的重要疾病密切相關(guān)。蛋白質(zhì)組裝體分子量大,通常難以溶解和結(jié)晶,限制了常用的結(jié)構(gòu)研究手段如X射線晶體學(xué)和液體NMR等在其高分辨三維結(jié)構(gòu)解析中的應(yīng)用。固體核磁共振技術(shù)(ssNMR)在難溶、非結(jié)晶樣品的三維結(jié)構(gòu)解析中具有獨特的優(yōu)勢,尤其隨著固體NMR硬件包括高場磁體和高性能的探頭、固體NMR多維脈沖實驗技術(shù)和樣品制備技術(shù)特別是同位素標(biāo)記技術(shù)的快速發(fā)展,固體NMR已經(jīng)成為了蛋白組裝體三維結(jié)構(gòu)解析的重要手段。在樣品制備方法方面,強(qiáng)調(diào)了樣品制備條件的優(yōu)化對得到構(gòu)象均一樣品的重要性,以及豐富的同位素標(biāo)記方法的使用對固體NMR譜圖分辨率提高的重要作用。同時多種脈沖序列如質(zhì)子驅(qū)動自旋擴(kuò)散技術(shù)(PDSD),偶極輔助旋轉(zhuǎn)共振技術(shù)(DARR),質(zhì)子輔助重偶技術(shù)(PAR)或轉(zhuǎn)移回波雙共振技術(shù)(TEDOR)等的建立和發(fā)展為結(jié)構(gòu)約束條件收集提供了基本的技術(shù)方法。此外,固體NMR與其它實驗技術(shù)如掃描透射電鏡(STEM),冷凍電鏡(Cryo-EM)等和理論模擬方法的聯(lián)用能顯著地提高固體NMR的能力,從而能解析分子量更大、結(jié)構(gòu)更復(fù)雜的蛋白質(zhì)組裝體的三維結(jié)構(gòu)。本文以...
【文章頁數(shù)】:9 頁
【文章目錄】:
1 引言
2 利用固體NMR技術(shù)獲得蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)約束信息
2.1 改善譜圖質(zhì)量的方法
2.1.1 優(yōu)化樣品制備方法
2.1.2 優(yōu)化樣品同位素標(biāo)記方法
2.1.3 其它方法
2.2 提取結(jié)構(gòu)約束的方法
2.2.1 角度約束
2.2.2 距離約束
2.2.3 其它獲得距離約束的方法
3 固體NMR聯(lián)合其它技術(shù)解析蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)
4 固體NMR在蛋白質(zhì)組裝體結(jié)構(gòu)解析中的應(yīng)用
4.1 Aβ淀粉樣蛋白纖維結(jié)構(gòu)解析
4.2 T3SS針狀組裝體結(jié)構(gòu)解析
6 總結(jié)與展望
本文編號:3862150
【文章頁數(shù)】:9 頁
【文章目錄】:
1 引言
2 利用固體NMR技術(shù)獲得蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)約束信息
2.1 改善譜圖質(zhì)量的方法
2.1.1 優(yōu)化樣品制備方法
2.1.2 優(yōu)化樣品同位素標(biāo)記方法
2.1.3 其它方法
2.2 提取結(jié)構(gòu)約束的方法
2.2.1 角度約束
2.2.2 距離約束
2.2.3 其它獲得距離約束的方法
3 固體NMR聯(lián)合其它技術(shù)解析蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)
4 固體NMR在蛋白質(zhì)組裝體結(jié)構(gòu)解析中的應(yīng)用
4.1 Aβ淀粉樣蛋白纖維結(jié)構(gòu)解析
4.2 T3SS針狀組裝體結(jié)構(gòu)解析
6 總結(jié)與展望
本文編號:3862150
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