基于固體核磁共振方法的蛋白質組裝體三維結構解析
發(fā)布時間:2023-11-10 19:12
蛋白質組裝體廣泛存在于生物體內,具有相關生物學功能或與人類的重要疾病密切相關。蛋白質組裝體分子量大,通常難以溶解和結晶,限制了常用的結構研究手段如X射線晶體學和液體NMR等在其高分辨三維結構解析中的應用。固體核磁共振技術(ssNMR)在難溶、非結晶樣品的三維結構解析中具有獨特的優(yōu)勢,尤其隨著固體NMR硬件包括高場磁體和高性能的探頭、固體NMR多維脈沖實驗技術和樣品制備技術特別是同位素標記技術的快速發(fā)展,固體NMR已經(jīng)成為了蛋白組裝體三維結構解析的重要手段。在樣品制備方法方面,強調了樣品制備條件的優(yōu)化對得到構象均一樣品的重要性,以及豐富的同位素標記方法的使用對固體NMR譜圖分辨率提高的重要作用。同時多種脈沖序列如質子驅動自旋擴散技術(PDSD),偶極輔助旋轉共振技術(DARR),質子輔助重偶技術(PAR)或轉移回波雙共振技術(TEDOR)等的建立和發(fā)展為結構約束條件收集提供了基本的技術方法。此外,固體NMR與其它實驗技術如掃描透射電鏡(STEM),冷凍電鏡(Cryo-EM)等和理論模擬方法的聯(lián)用能顯著地提高固體NMR的能力,從而能解析分子量更大、結構更復雜的蛋白質組裝體的三維結構。本文以...
【文章頁數(shù)】:9 頁
【文章目錄】:
1 引言
2 利用固體NMR技術獲得蛋白質結構約束信息
2.1 改善譜圖質量的方法
2.1.1 優(yōu)化樣品制備方法
2.1.2 優(yōu)化樣品同位素標記方法
2.1.3 其它方法
2.2 提取結構約束的方法
2.2.1 角度約束
2.2.2 距離約束
2.2.3 其它獲得距離約束的方法
3 固體NMR聯(lián)合其它技術解析蛋白質結構
4 固體NMR在蛋白質組裝體結構解析中的應用
4.1 Aβ淀粉樣蛋白纖維結構解析
4.2 T3SS針狀組裝體結構解析
6 總結與展望
本文編號:3862150
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【文章目錄】:
1 引言
2 利用固體NMR技術獲得蛋白質結構約束信息
2.1 改善譜圖質量的方法
2.1.1 優(yōu)化樣品制備方法
2.1.2 優(yōu)化樣品同位素標記方法
2.1.3 其它方法
2.2 提取結構約束的方法
2.2.1 角度約束
2.2.2 距離約束
2.2.3 其它獲得距離約束的方法
3 固體NMR聯(lián)合其它技術解析蛋白質結構
4 固體NMR在蛋白質組裝體結構解析中的應用
4.1 Aβ淀粉樣蛋白纖維結構解析
4.2 T3SS針狀組裝體結構解析
6 總結與展望
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