目的:RC(renal cancer,腎癌)的全球發(fā)病率每年都在增加,占所有成人惡性腫瘤的約3%,其中ccRCC(renal cell clear cell carcinoma,腎透明細胞癌)是腎癌中發(fā)病率最高的一種亞型,占所有腎癌的75%,隨著ceRNA(competing endogenousRNA,內(nèi)源競爭性RNA)假說的提出,mRNA-miRNA-lncRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)在癌癥基因表達中的作用目前正被廣泛認可,這種內(nèi)源性調(diào)控網(wǎng)絡(luò)在腫瘤的篩查、預防及治療中有著重要的意義,本研究旨在通過生物信息學技術(shù)整合GEO數(shù)據(jù)庫中的三個數(shù)據(jù)集,找到腎透明細胞癌中的mRNA-miRNA-lncRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò),為從基因?qū)W領(lǐng)域研究腎透明細胞癌的篩查、預防、治療提供更多新的且有價值的靶點。方法:通過R語言篩選腎透明細胞癌和正常腎組織在三個GEO數(shù)據(jù)集(GSE781GSE6433 GSE11151)中分別表現(xiàn)為上調(diào)和下調(diào)的DEGs(differentially expressed genes,差異性表達基因)。利用FUNRICH軟件及KOBAS網(wǎng)站對篩選出DEGs進行GO、KEGG以及PANTEHER通路分...

【文章頁數(shù)】：46 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
中文摘要
英文摘要
(一)前言
(二)材料與方法
    1.數(shù)據(jù)收集
    2.篩選差異性表達基因 DEGs
    3.DEGs的功能富集分析
    4.蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建以及中樞基因的篩選
    5.預測有意義的HubDEGs上游的miRNA
    6.預測關(guān)鍵miRNA上游的lncRNA
    7.lncRAN與mRNA的相關(guān)性分析
(三)結(jié)果
    1.篩選與腎透明細胞癌相關(guān)的差異性表達基因
    2.對顯著上調(diào)和下調(diào)的差異性表達基因進行功能富集分析
    3.蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建以及中樞基因的篩選
    4.預測上述14個中樞基因上游的miRNA并篩選出關(guān)鍵miRNA
    5.關(guān)鍵lncRNA的篩選
    6.驗證關(guān)鍵lncRNA與靶基因的相關(guān)性
    7.腎透明細胞癌相關(guān)的關(guān)鍵mRNA-miRNA-lncRNA調(diào)控軸的構(gòu)建
(四)討論
(五)參考文獻
綜述 腎透明細胞癌相關(guān)內(nèi)源競爭性RNA假說(competing endogenous RNAs,ceRNAs)的研究進展
    參考文獻
攻讀學位期間發(fā)表論文情況
致謝



本文編號：3855407