山欄稻是海南獨(dú)有的地方旱稻,具有豐富的抗旱基因資源。本研究以海南山欄稻品種白沙糯為材料,利用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)研究在模擬干旱脅迫后其轉(zhuǎn)錄組水平的變化。主要結(jié)果如下:山欄稻白沙糯干旱脅迫后有2 791個(gè)基因差異表達(dá),差異表達(dá)基因中有184個(gè)轉(zhuǎn)錄因子在干旱脅迫后顯著上調(diào),包含了Znf、AP2/ERF、MYB、NAC、bZIP等抗旱轉(zhuǎn)錄因子,其中Znf家族轉(zhuǎn)錄因子所占數(shù)量最多。表達(dá)分析顯示一些未注釋的基因,如Os01g0910800隨著脅迫時(shí)間的延長(zhǎng),表達(dá)水平逐漸上升且倍數(shù)明顯。該研究獲得的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)和數(shù)字基因表達(dá)譜,為山欄稻抗旱機(jī)理的研究提供了信息資源,并為進(jìn)一步解析山欄稻的抗旱機(jī)理奠定基礎(chǔ)。

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 材料
    1.2 方法
        1.2.1 植物材料培育
        1.2.2 建庫(kù)和轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
        1.2.3 數(shù)據(jù)過濾、重新序列組裝以及unigenes的功能注釋
        1.2.4 CDS預(yù)測(cè)基因和表達(dá)水平分析
        1.2.5 差異表達(dá)unigenes的驗(yàn)證和表達(dá)分析
2 結(jié)果
    2.1 轉(zhuǎn)錄組拼接質(zhì)量分析及參考序列比對(duì)
    2.2 SNP與InDel
    2.3 基因表達(dá)對(duì)比
    2.4 差異基因GO富集分析和KEGG富集分析
    2.5 差異基因轉(zhuǎn)錄因子對(duì)比
    2.6 差異表達(dá)基因驗(yàn)證
    2.7 干旱脅迫相關(guān)差異基因不同脅迫時(shí)段的表達(dá)檢測(cè)
3 討論
4 結(jié)論



本文編號(hào)：3824523