為深入解析谷子TCP基因家族的功能,通過生物信息學(xué)方法對(duì)谷子TCP轉(zhuǎn)錄因子家族基因成員序列特征、基因結(jié)構(gòu)、染色體定位、系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系及表達(dá)模式進(jìn)行分析。結(jié)果表明:除第8染色體之外,從谷子基因組上其余8條染色體中共鑒定出26個(gè)TCP家族成員,并根據(jù)其在染色體的順序和位置先后進(jìn)行命名,其中分布在第3和第5染色體上的TCP家族成員數(shù)量最多,高達(dá)5個(gè)。不同家族成員其編碼的氨基酸殘基數(shù)目具有明顯差異,范圍為95 aa～451 aa。其中SiTCP21基因編碼氨基酸殘基數(shù)目最少為95個(gè)氨基酸;而SiTCP15最多為451個(gè)氨基酸殘基。26個(gè)TCP家族成員的蛋白結(jié)構(gòu)中均含有bHLH保守結(jié)構(gòu)域�；虮磉_(dá)分析結(jié)果表明,31%的成員在穗中的表達(dá)量明顯高于其他組織,因此推測(cè)該基因家族可能對(duì)谷子穗部生長發(fā)育的調(diào)控起關(guān)鍵作用。本研究對(duì)深入研究Si TCPs家族基因的功能奠定了基礎(chǔ),也為谷子生長發(fā)育的調(diào)控機(jī)制提供了新的思路。

【文章頁數(shù)】：9 頁

【文章目錄】：
1 結(jié)果與分析
    1.1 谷子SiTCP轉(zhuǎn)錄因子家族的鑒定與分類
    1.2 谷子SiTCP基因的染色體分布
    1.3 谷子與擬南芥TCP家族蛋白系統(tǒng)進(jìn)化樹分析
    1.4 谷子TCP家族基因結(jié)構(gòu)分析
    1.5 谷子TCP基因在不同組織中的表達(dá)模式
2 討論
3 材料與方法
    3.1 材料
    3.2 基因序列分析
    3.3 基因家族進(jìn)化分析
    3.4 基因結(jié)構(gòu)分析
    3.5 基因表達(dá)模式分析
作者貢獻(xiàn)



本文編號(hào)：3822353