多花黃精幾丁質(zhì)誘導(dǎo)赤霉素應(yīng)答基因(CIGR)克隆及其功能
發(fā)布時(shí)間:2023-05-13 04:44
為探討多花黃精幾丁質(zhì)誘導(dǎo)赤霉素應(yīng)答基因(chitin-inducible gibberellin-responsive,CIGR)在不同光處理下的的作用機(jī)制,采用全長(zhǎng)驗(yàn)證的方法獲得多花黃精CIGR基因的cDNA序列、gDNA序列,并對(duì)其進(jìn)行生物信息學(xué)分析,再對(duì)CIGR蛋白進(jìn)行亞細(xì)胞定位觀察,同時(shí)對(duì)不同光質(zhì)和光周期處理下CIGR基因的表達(dá)模式進(jìn)行分析.結(jié)果顯示,多花黃精CIGR基因cDNA序列和gDNA全長(zhǎng)序列一致,完整的開放閱讀框(ORF)長(zhǎng)度為1 770 bp,共編碼589個(gè)氨基酸,CIGR基因無內(nèi)含子結(jié)構(gòu).生物信息學(xué)分析表明CIGR具有一個(gè)GRAS結(jié)構(gòu)域,屬于GRAS家族,是植物特有的轉(zhuǎn)錄因子,為堿性蛋白,無信號(hào)肽;Motif分析表明,CIGR蛋白在物種間比較保守,保守區(qū)主要位于中部至3′末端;氨基酸序列進(jìn)化分析表明,多花黃精與石刁柏的CIGR親緣關(guān)系最近,同源性達(dá)81%.進(jìn)一步亞細(xì)胞定位顯示CIGR蛋白定位于細(xì)胞核,與預(yù)測(cè)結(jié)果一致.實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qPCR)結(jié)果顯示,多花黃精CIGR基因具有器官表達(dá)特異性,在葉中表達(dá)量最高.在不同光質(zhì)和光周期處理下,CIGR基因在藍(lán)光下表達(dá)量...
【文章頁數(shù)】:9 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 方法
1.2.1 總D N A、R N A的提取及c D N A的合成
1.2.2 CIGR基因的篩選與克隆
1.2.3 多花黃精gDNA克隆
1.2.4 生物信息學(xué)分析
1.2.5 多花黃精CIGR蛋白亞細(xì)胞定位
1.2.6 多花黃精的光質(zhì)及光周期處理
1.2.7 多花黃精CIGR基因特異表達(dá)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 多花黃精CIGR基因cDNA及gDNA序列的獲得及結(jié)構(gòu)
2.2 CIGR蛋白基本理化性質(zhì)
2.3 CIGR聚類分析
2.4 CIGR蛋白保守結(jié)構(gòu)域
2.5 多花黃精CIGR蛋白的亞細(xì)胞定位
2.6 CIGR在多花黃精不同組織部位中的表達(dá)
2.7 在不同光質(zhì)和光周期處理下多花黃精CIGR的表達(dá)
3 討論與結(jié)論
3.1 多花黃精CIGR基因及其編碼蛋白特征
3.2 CIGR基因可能受藍(lán)光和短光照周期調(diào)控及表達(dá)特性
本文編號(hào):3815327
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【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 方法
1.2.1 總D N A、R N A的提取及c D N A的合成
1.2.2 CIGR基因的篩選與克隆
1.2.3 多花黃精gDNA克隆
1.2.4 生物信息學(xué)分析
1.2.5 多花黃精CIGR蛋白亞細(xì)胞定位
1.2.6 多花黃精的光質(zhì)及光周期處理
1.2.7 多花黃精CIGR基因特異表達(dá)分析
2 結(jié)果與分析
2.1 多花黃精CIGR基因cDNA及gDNA序列的獲得及結(jié)構(gòu)
2.2 CIGR蛋白基本理化性質(zhì)
2.3 CIGR聚類分析
2.4 CIGR蛋白保守結(jié)構(gòu)域
2.5 多花黃精CIGR蛋白的亞細(xì)胞定位
2.6 CIGR在多花黃精不同組織部位中的表達(dá)
2.7 在不同光質(zhì)和光周期處理下多花黃精CIGR的表達(dá)
3 討論與結(jié)論
3.1 多花黃精CIGR基因及其編碼蛋白特征
3.2 CIGR基因可能受藍(lán)光和短光照周期調(diào)控及表達(dá)特性
本文編號(hào):3815327
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