為探討多花黃精幾丁質(zhì)誘導赤霉素應(yīng)答基因(chitin-inducible gibberellin-responsive,CIGR)在不同光處理下的的作用機制,采用全長驗證的方法獲得多花黃精CIGR基因的cDNA序列、gDNA序列,并對其進行生物信息學分析,再對CIGR蛋白進行亞細胞定位觀察,同時對不同光質(zhì)和光周期處理下CIGR基因的表達模式進行分析.結(jié)果顯示,多花黃精CIGR基因cDNA序列和gDNA全長序列一致,完整的開放閱讀框(ORF)長度為1 770 bp,共編碼589個氨基酸,CIGR基因無內(nèi)含子結(jié)構(gòu).生物信息學分析表明CIGR具有一個GRAS結(jié)構(gòu)域,屬于GRAS家族,是植物特有的轉(zhuǎn)錄因子,為堿性蛋白,無信號肽;Motif分析表明,CIGR蛋白在物種間比較保守,保守區(qū)主要位于中部至3′末端;氨基酸序列進化分析表明,多花黃精與石刁柏的CIGR親緣關(guān)系最近,同源性達81%.進一步亞細胞定位顯示CIGR蛋白定位于細胞核,與預(yù)測結(jié)果一致.實時熒光定量PCR(qPCR)結(jié)果顯示,多花黃精CIGR基因具有器官表達特異性,在葉中表達量最高.在不同光質(zhì)和光周期處理下,CIGR基因在藍光下表達量...

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 材料
    1.2 方法
        1.2.1 總D N A、R N A的提取及c D N A的合成
        1.2.2 CIGR基因的篩選與克隆
        1.2.3 多花黃精gDNA克隆
        1.2.4 生物信息學分析
        1.2.5 多花黃精CIGR蛋白亞細胞定位
        1.2.6 多花黃精的光質(zhì)及光周期處理
        1.2.7 多花黃精CIGR基因特異表達分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 多花黃精CIGR基因cDNA及gDNA序列的獲得及結(jié)構(gòu)
    2.2 CIGR蛋白基本理化性質(zhì)
    2.3 CIGR聚類分析
    2.4 CIGR蛋白保守結(jié)構(gòu)域
    2.5 多花黃精CIGR蛋白的亞細胞定位
    2.6 CIGR在多花黃精不同組織部位中的表達
    2.7 在不同光質(zhì)和光周期處理下多花黃精CIGR的表達
3 討論與結(jié)論
    3.1 多花黃精CIGR基因及其編碼蛋白特征
    3.2 CIGR基因可能受藍光和短光照周期調(diào)控及表達特性



本文編號：3815327