為探明廣西北部灣星蟲動物的線粒體基因組遺傳變異和基因序列特征,采用高通量測序測定廣西北部灣5種常見星蟲動物的線粒體基因組,并對其基因序列特征、遺傳變異、系統(tǒng)進(jìn)化進(jìn)行分析。結(jié)果顯示,星蟲動物線粒體基因組具有典型的無脊椎動物線粒體基因組的特征,基因排列高度保守,特別是其13個蛋白質(zhì)編碼基因(PCGs)。此外,星蟲動物線粒體基因組的基因均編碼在H鏈上,并存在3個高度保守的基因排列區(qū)塊,與環(huán)節(jié)動物和螠蟲動物線粒體基因組特征較為相似。cox1、cox2和cob等3個基因進(jìn)化速率最慢、遺傳變異水平最低,適合作為星蟲動物種屬系統(tǒng)進(jìn)化研究以及不同種間生物條形碼構(gòu)建的分子標(biāo)記。nad6、nad4、nad5和nad2等4個基因的遺傳變異水平較高(大于60%),變異位點數(shù)量較多,適合作為星蟲動物種群遺傳多樣性研究的分子標(biāo)記。星蟲動物線粒體13個蛋白質(zhì)編碼基因的Ka/Ks比值均低于1(0.058 2—0.726 6),其中cox1、cox3和cob等3個基因的Ka/Ks比值最低(小于0.1),表明在星蟲動物線粒體遺傳進(jìn)化過程中,這3個蛋白質(zhì)編碼基因承受強(qiáng)烈的自然選擇壓力和功能束縛�；诰�粒體基因組蛋白質(zhì)編碼基...

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【文章目錄】：
0 引言
1 材料與方法
    1.1 樣品采集和鑒定
    1.2 基因組DNA提取和高通量測序
    1.3 線粒體基因組序列組裝和基因注釋
    1.4 線粒體基因組遺傳變異信息和系統(tǒng)進(jìn)化分析
2 結(jié)果與分析
    2.1 線粒體基因組基因序列特征
    2.2 線粒體基因組遺傳變異信息
    2.3 星蟲動物門系統(tǒng)進(jìn)化分析
3 討論
    3.1 星蟲動物線粒體基因組的基因序列特征
    3.2 星蟲動物線粒體基因組的遺傳變異
    3.3 星蟲動物的系統(tǒng)進(jìn)化
4 結(jié)論



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