芝麻CCCH鋅指蛋白基因SiC3H1的克隆及表達(dá)分析
發(fā)布時(shí)間:2023-02-25 23:17
CCCH鋅指蛋白是真核生物中廣泛存在的一類轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子,在植物生長發(fā)育及逆境脅迫應(yīng)答中具有重要功能。本研究基于芝麻轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),篩選并克隆到一個(gè)芝麻干旱應(yīng)答相關(guān)的CCCH鋅指蛋白基因SiC3H1,并對其在不同非生物逆境脅迫下的表達(dá)變化進(jìn)行了研究。測序結(jié)果表明,SiC3H1基因編碼序列長1 110 bp,編碼369個(gè)氨基酸。對其編碼蛋白進(jìn)行序列分析發(fā)現(xiàn),該蛋白含有2個(gè)CCCH型鋅指結(jié)構(gòu)域。進(jìn)化樹分析表明,SiC3H1與番茄和馬鈴薯中的同源基因相似度較高。啟動子序列分析顯示,SiC3H1啟動子區(qū)域含有參與防御和脅迫應(yīng)答的元件、脫落酸應(yīng)答元件和乙烯應(yīng)答元件。實(shí)時(shí)熒光定量PCR分析表明,在滲透、高鹽、低溫、高溫和淹水5種逆境脅迫處理下,SiC3H1的表達(dá)量與對照相比均顯著升高。以上研究結(jié)果表明,SiC3H1參與了芝麻對多種逆境脅迫的應(yīng)答反應(yīng),為今后進(jìn)一步解析其功能提供了理論依據(jù)。
【文章頁數(shù)】:7 頁
【文章目錄】:
1 結(jié)果與分析
1.1 Si C3H1的克隆與基本理化性質(zhì)分析
1.2 Si C3H1亞細(xì)胞定位分析
1.3 Si C3H1保守結(jié)構(gòu)域分析
1.4 同源蛋白序列比對及進(jìn)化分析
1.5 Si C3H1基因啟動子序列分析
1.6 Si C3H1響應(yīng)逆境脅迫的表達(dá)分析
2 討論
3 材料與方法
3.1 試驗(yàn)材料
3.2 材料處理及取樣
3.3 RNA提取和基因定量表達(dá)分析
3.4 Si C3H1基因的克隆
3.5 生物信息學(xué)分析
本文編號:3749377
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1 結(jié)果與分析
1.1 Si C3H1的克隆與基本理化性質(zhì)分析
1.2 Si C3H1亞細(xì)胞定位分析
1.3 Si C3H1保守結(jié)構(gòu)域分析
1.4 同源蛋白序列比對及進(jìn)化分析
1.5 Si C3H1基因啟動子序列分析
1.6 Si C3H1響應(yīng)逆境脅迫的表達(dá)分析
2 討論
3 材料與方法
3.1 試驗(yàn)材料
3.2 材料處理及取樣
3.3 RNA提取和基因定量表達(dá)分析
3.4 Si C3H1基因的克隆
3.5 生物信息學(xué)分析
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