CCCH鋅指蛋白是真核生物中廣泛存在的一類轉錄調節(jié)因子,在植物生長發(fā)育及逆境脅迫應答中具有重要功能。本研究基于芝麻轉錄組數據,篩選并克隆到一個芝麻干旱應答相關的CCCH鋅指蛋白基因SiC3H1,并對其在不同非生物逆境脅迫下的表達變化進行了研究。測序結果表明,SiC3H1基因編碼序列長1 110 bp,編碼369個氨基酸。對其編碼蛋白進行序列分析發(fā)現,該蛋白含有2個CCCH型鋅指結構域。進化樹分析表明,SiC3H1與番茄和馬鈴薯中的同源基因相似度較高。啟動子序列分析顯示,SiC3H1啟動子區(qū)域含有參與防御和脅迫應答的元件、脫落酸應答元件和乙烯應答元件。實時熒光定量PCR分析表明,在滲透、高鹽、低溫、高溫和淹水5種逆境脅迫處理下,SiC3H1的表達量與對照相比均顯著升高。以上研究結果表明,SiC3H1參與了芝麻對多種逆境脅迫的應答反應,為今后進一步解析其功能提供了理論依據。

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【文章目錄】：
1 結果與分析
    1.1 Si C3H1的克隆與基本理化性質分析
    1.2 Si C3H1亞細胞定位分析
    1.3 Si C3H1保守結構域分析
    1.4 同源蛋白序列比對及進化分析
    1.5 Si C3H1基因啟動子序列分析
    1.6 Si C3H1響應逆境脅迫的表達分析
2 討論
3 材料與方法
    3.1 試驗材料
    3.2 材料處理及取樣
    3.3 RNA提取和基因定量表達分析
    3.4 Si C3H1基因的克隆
    3.5 生物信息學分析



本文編號：3749377