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蕓薹屬物種(B.napus,B.rapa,B.oleracea)CAMTA4基因家族的鑒定與進(jìn)化分析

發(fā)布時(shí)間:2022-12-18 09:58
  鈣調(diào)蛋白在植物的生理代謝中起著重要作用,而鈣調(diào)蛋白的轉(zhuǎn)錄翻譯過(guò)程需要CAMTA的參與。為研究蕓薹屬植物中CAMTA4位點(diǎn)的分子進(jìn)化,本研究利用生物信息學(xué)的方法,分析了甘藍(lán)型油菜、白菜和甘藍(lán)的CAMTA4家族核苷酸序列的基本特征和基因結(jié)構(gòu)、蛋白序列的基本特征和功能域,以及它們的系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系。結(jié)果顯示,這3個(gè)物種的CAMTA4都具有CAMTA保守的結(jié)構(gòu)域,且它們的進(jìn)化符合禹氏三角理論和三倍化學(xué)說(shuō)。本研究明確了甘藍(lán)型油菜、白菜和甘藍(lán)CAMTA4位點(diǎn)的進(jìn)化歷程,并且為研究蕓薹屬植物CAMTA的功能提供了生物信息學(xué)參考。 

【文章頁(yè)數(shù)】:8 頁(yè)

【文章目錄】:
1 結(jié)果與分析
    1.1 蕓薹屬CAMTA4家族的鑒定
    1.2 蕓薹屬CAMTA4家族核苷酸序列的基本特征
    1.3 蕓薹屬CAMTA4家族氨基酸序列的基本特征
    1.4 蕓薹屬CAMTA4家族蛋白序列功能域分析
    1.5 蕓薹屬CAMTA4家族的染色體定位
    1.6 蕓薹屬CAMTA4家族的基因結(jié)構(gòu)和系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系
2 討論
3 材料與方法
    3.1 實(shí)驗(yàn)材料
    3.2 蕓薹屬CAMTA4家族的鑒定及序列基本特征分析
    3.3 蕓薹屬CAMTA4家族蛋白序列功能域分析及染色體定位
    3.4 蕓薹屬CAMTA4家族的基因結(jié)構(gòu)及系統(tǒng)發(fā)生樹(shù)的繪制
作者貢獻(xiàn)


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]蕓薹屬物種(B.napus,B.rapa,B.oleracea,B.juncea,B.nigra)MYB28家族的分子進(jìn)化[J]. 陸俊杏,白輝揚(yáng),張濤.  分子植物育種. 2017(02)
[2]蕓薹屬物種基因組進(jìn)化及比較基因組學(xué)研究進(jìn)展[J]. 周燦,付東輝,周慶紅.  基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2014(05)
[3]蕓薹屬物種(B.napus,B.oleracea,B.rapa)MAPK1家族的克隆、進(jìn)化和表達(dá)特征[J]. 陸俊杏,盧坤,朱斌,彭茜,陸奇豐,曲存民,殷家明,李加納,梁穎,柴友榮.  中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(16)
[4]逆境脅迫下ABA與鈣信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑之間的相互調(diào)控機(jī)制[J]. 孫芳,夏新莉,尹偉倫.  基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2009(02)



本文編號(hào):3721849

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