基于CRISPR/Cas9技術改造釀酒酵母合成D-阿洛糖的研究
發(fā)布時間:2022-12-17 14:35
近年來,D-阿洛糖(D-Allose)由于其具防止肥胖、抗氧化、抗高血壓、抗腫瘤以及抗癌癥功能,而受到越來越多的關注。目前,以Izumoring酶法指導生產D-阿洛糖的研究較為廣泛。相比于以D-阿洛酮糖為底物,利用D-果糖為原料,經D-阿洛酮糖3-差向異構酶(D-psicose 3-epimerase,DPE)和L-鼠李糖異構酶(L-rhamnose isomerase,LRI)作用生產高附加值D-阿洛糖,將成為更加認可的生產路線。釀酒酵母一直被美國FDA(Food and Drug Administration)認為是GRAS(Generally Recognized As Safe)生產菌株,具備安全無致病性、遺傳背景清晰、培養(yǎng)簡單和繁殖迅速等優(yōu)勢,因此以釀酒酵母為宿主生產D-阿洛糖在確保食品安全性等方面具有相當大的優(yōu)勢。由于釀酒酵母體內的己糖激酶同工酶2(Hexokinase isoenzyme 2,HXK2)可以將果糖磷酸化果糖-6-磷酸,因此有必要將其缺陷而構建果糖低消耗宿主菌株,從而提高D-阿洛糖的產量。具體研究方法和結果如下:(1)釀酒酵母中高效CRISPR/Cas9基因...
【文章頁數】:87 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
英文縮略詞表
第一章 緒論
1.1 功能性稀有糖
1.1.1 稀有糖概述
1.1.2 Izumoring策略
1.1.3 非Izumoring策略
1.2 D-阿洛糖的概述
1.2.1 D-阿洛糖物理化學特性
1.2.2 D-阿洛糖的生理學功能
1.2.3 D-阿洛糖的生物合成
1.3 CRISPR/Cas9 系統(tǒng)的概述
1.3.1 CRISPR/Cas系統(tǒng)的發(fā)現
1.3.2 CRISPR/Cas系統(tǒng)的分類及作用機制
1.3.3 CRISPR/Cas9 系統(tǒng)在釀酒酵母中的應用
1.4 論文的研究意義以及主要研究內容
1.4.1 課題研究意義
1.4.2 主要研究內容
1.4.3 研究技術路線
第二章 釀酒酵母中高效CRISPR/Cas9 基因編輯系統(tǒng)的構建
2.1 引言
2.2 材料與設備
2.2.1 菌株和質粒
2.2.2 主要儀器和設備
2.2.3 主要試劑
2.2.4 培養(yǎng)基與溶液
2.3 實驗方法
2.3.1 rDNA整合型Cas9 表達質粒的構建
2.3.2 rDNA整合型Cas9 表達菌株的構建
2.3.3 靶向ade2 位點的gRNA表達質粒的構建
2.3.4 靶向ade2 位點的Cas9/gRNA共表達游離型質粒的構建
2.3.5 ade2 位點雙鏈斷裂修復donorDNA構建
2.3.6 釀酒酵母ade2缺失菌株的構建
2.4 結果討論
2.4.1 釀酒酵母rDNA整合型Cas9 表達菌株的構建
2.4.2 donor-tll2 表達盒的構建
2.4.3 rDNA整合型Cas9 介導的釀酒酵母ade2 基因缺失菌的構建
2.4.4 游離型Cas9 系統(tǒng)介導的釀酒酵母ade2 基因缺失菌的構建
2.4.5 不同敲除系統(tǒng)對ade2基因編輯效率的影響
2.5 本章小結
第三章 基于CRISPR/Cas9 構建釀酒酵母果糖低消耗宿主菌
3.1 引言
3.2 材料與設備
3.2.1 菌株和質粒
3.2.2 儀器和設備
3.2.3 試劑
3.2.4 培養(yǎng)基與溶液
3.3 實驗方法
3.3.1 p YES2-CG-?hxk2 敲除質粒的構建
3.3.2 donor-hxk2 的構建
3.3.3 釀酒酵母hxk2基因敲除菌的構建
3.3.4 菌株BY4741-?hxk2的果糖發(fā)酵培養(yǎng)
3.3.5 果糖含量的測定
3.3.6 數據處理
3.4 結果討論
3.4.1 敲除質粒p YES2-CG-?hxk2 的構建
3.4.2 donor-hxk2 的構建
3.4.3 釀酒酵母hxk2基因敲除菌的構建
3.4.4 菌株BY4741-?hxk2的生長特性
3.4.5 菌株BY4741-?hxk2對果糖利用
3.5 本章小結
第四章 D-阿洛糖的生物合成
4.1 引言
4.2 材料與設備
4.2.1 菌株和質粒
4.2.2 主要儀器和設備
4.2.3 主要試劑
4.2.4 培養(yǎng)基與溶液
4.3 實驗方法
4.3.1 D-阿洛酮糖/D-阿洛糖為唯一碳源培養(yǎng)釀酒酵母
4.3.2 dep和 lri基因串聯表達盒的構建
4.3.3 D-阿洛糖生產菌株的構建
4.3.4 改造菌株Y1的搖瓶發(fā)酵
4.3.5 糖的測定
4.4 結果討論
4.4.1 釀酒酵母對D-阿洛酮糖的利用
4.4.2 釀酒酵母對D-阿洛糖的利用
4.4.3 dep和 lri基因串聯表達盒的構建
4.4.4 D-阿洛糖生產菌株的構建
4.4.5 釀酒酵母菌株Y1的搖瓶發(fā)酵
4.5 本章小結
結論與展望
結論
展望
本論文創(chuàng)新點
參考文獻
攻讀碩士學位期間取得的研究成果
致謝
附件
【參考文獻】:
期刊論文
[1]D-阿洛酮糖的功能及其生物合成研究進展[J]. 沈雪梅,王靖,張媛,王小艷,丁子元,李義,陳博,佟毅. 生物工程學報. 2018(09)
[2]CRISPR/Cas9介導的高產谷胱甘肽原養(yǎng)型酵母工程菌的構建[J]. 周文龍,唐亮,成凱,劉忞之,楊燕,王偉. 生物工程學報. 2017(12)
[3]釀酒酵母rDNA的結構及其介導整合影響因素研究進展[J]. 孫恒一,臧曉南,張學成. 武漢大學學報(理學版). 2014(01)
[4]CRISPR/Cas系統(tǒng):RNA靶向的基因組定向編輯新技術[J]. 李君,張毅,陳坤玲,單奇?zhèn)?王延鵬,梁振,高彩霞. 遺傳. 2013(11)
[5]CRISPR-Cas系統(tǒng)與細菌和噬菌體的共進化[J]. 李鐵民,杜波. 遺傳. 2011(03)
博士論文
[1]D-阿洛酮糖3-差向異構酶的高效表達、酶學性質及分子改造[D]. 張文立.江南大學 2017
碩士論文
[1]馬克斯克魯維酵母D-阿洛酮糖-3-差向異構酶基因工程菌的構建[D]. 朱星星.合肥工業(yè)大學 2018
[2]釀酒酵母孢子固定化酶催化D-葡萄糖合成D-阿洛酮糖的研究[D]. 李毅.江南大學 2015
本文編號:3720103
【文章頁數】:87 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
英文縮略詞表
第一章 緒論
1.1 功能性稀有糖
1.1.1 稀有糖概述
1.1.2 Izumoring策略
1.1.3 非Izumoring策略
1.2 D-阿洛糖的概述
1.2.1 D-阿洛糖物理化學特性
1.2.2 D-阿洛糖的生理學功能
1.2.3 D-阿洛糖的生物合成
1.3 CRISPR/Cas9 系統(tǒng)的概述
1.3.1 CRISPR/Cas系統(tǒng)的發(fā)現
1.3.2 CRISPR/Cas系統(tǒng)的分類及作用機制
1.3.3 CRISPR/Cas9 系統(tǒng)在釀酒酵母中的應用
1.4 論文的研究意義以及主要研究內容
1.4.1 課題研究意義
1.4.2 主要研究內容
1.4.3 研究技術路線
第二章 釀酒酵母中高效CRISPR/Cas9 基因編輯系統(tǒng)的構建
2.1 引言
2.2 材料與設備
2.2.1 菌株和質粒
2.2.2 主要儀器和設備
2.2.3 主要試劑
2.2.4 培養(yǎng)基與溶液
2.3 實驗方法
2.3.1 rDNA整合型Cas9 表達質粒的構建
2.3.2 rDNA整合型Cas9 表達菌株的構建
2.3.3 靶向ade2 位點的gRNA表達質粒的構建
2.3.4 靶向ade2 位點的Cas9/gRNA共表達游離型質粒的構建
2.3.5 ade2 位點雙鏈斷裂修復donorDNA構建
2.3.6 釀酒酵母ade2缺失菌株的構建
2.4 結果討論
2.4.1 釀酒酵母rDNA整合型Cas9 表達菌株的構建
2.4.2 donor-tll2 表達盒的構建
2.4.3 rDNA整合型Cas9 介導的釀酒酵母ade2 基因缺失菌的構建
2.4.4 游離型Cas9 系統(tǒng)介導的釀酒酵母ade2 基因缺失菌的構建
2.4.5 不同敲除系統(tǒng)對ade2基因編輯效率的影響
2.5 本章小結
第三章 基于CRISPR/Cas9 構建釀酒酵母果糖低消耗宿主菌
3.1 引言
3.2 材料與設備
3.2.1 菌株和質粒
3.2.2 儀器和設備
3.2.3 試劑
3.2.4 培養(yǎng)基與溶液
3.3 實驗方法
3.3.1 p YES2-CG-?hxk2 敲除質粒的構建
3.3.2 donor-hxk2 的構建
3.3.3 釀酒酵母hxk2基因敲除菌的構建
3.3.4 菌株BY4741-?hxk2的果糖發(fā)酵培養(yǎng)
3.3.5 果糖含量的測定
3.3.6 數據處理
3.4 結果討論
3.4.1 敲除質粒p YES2-CG-?hxk2 的構建
3.4.2 donor-hxk2 的構建
3.4.3 釀酒酵母hxk2基因敲除菌的構建
3.4.4 菌株BY4741-?hxk2的生長特性
3.4.5 菌株BY4741-?hxk2對果糖利用
3.5 本章小結
第四章 D-阿洛糖的生物合成
4.1 引言
4.2 材料與設備
4.2.1 菌株和質粒
4.2.2 主要儀器和設備
4.2.3 主要試劑
4.2.4 培養(yǎng)基與溶液
4.3 實驗方法
4.3.1 D-阿洛酮糖/D-阿洛糖為唯一碳源培養(yǎng)釀酒酵母
4.3.2 dep和 lri基因串聯表達盒的構建
4.3.3 D-阿洛糖生產菌株的構建
4.3.4 改造菌株Y1的搖瓶發(fā)酵
4.3.5 糖的測定
4.4 結果討論
4.4.1 釀酒酵母對D-阿洛酮糖的利用
4.4.2 釀酒酵母對D-阿洛糖的利用
4.4.3 dep和 lri基因串聯表達盒的構建
4.4.4 D-阿洛糖生產菌株的構建
4.4.5 釀酒酵母菌株Y1的搖瓶發(fā)酵
4.5 本章小結
結論與展望
結論
展望
本論文創(chuàng)新點
參考文獻
攻讀碩士學位期間取得的研究成果
致謝
附件
【參考文獻】:
期刊論文
[1]D-阿洛酮糖的功能及其生物合成研究進展[J]. 沈雪梅,王靖,張媛,王小艷,丁子元,李義,陳博,佟毅. 生物工程學報. 2018(09)
[2]CRISPR/Cas9介導的高產谷胱甘肽原養(yǎng)型酵母工程菌的構建[J]. 周文龍,唐亮,成凱,劉忞之,楊燕,王偉. 生物工程學報. 2017(12)
[3]釀酒酵母rDNA的結構及其介導整合影響因素研究進展[J]. 孫恒一,臧曉南,張學成. 武漢大學學報(理學版). 2014(01)
[4]CRISPR/Cas系統(tǒng):RNA靶向的基因組定向編輯新技術[J]. 李君,張毅,陳坤玲,單奇?zhèn)?王延鵬,梁振,高彩霞. 遺傳. 2013(11)
[5]CRISPR-Cas系統(tǒng)與細菌和噬菌體的共進化[J]. 李鐵民,杜波. 遺傳. 2011(03)
博士論文
[1]D-阿洛酮糖3-差向異構酶的高效表達、酶學性質及分子改造[D]. 張文立.江南大學 2017
碩士論文
[1]馬克斯克魯維酵母D-阿洛酮糖-3-差向異構酶基因工程菌的構建[D]. 朱星星.合肥工業(yè)大學 2018
[2]釀酒酵母孢子固定化酶催化D-葡萄糖合成D-阿洛酮糖的研究[D]. 李毅.江南大學 2015
本文編號:3720103
本文鏈接:http://sikaile.net/projectlw/swxlw/3720103.html
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