嗜根考克氏菌雙組分信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)系統(tǒng)的生物信息學(xué)分析
發(fā)布時(shí)間:2022-12-04 08:19
雙組分信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)系統(tǒng)(two-component system, TCS)是細(xì)菌感知和響應(yīng)環(huán)境的普遍機(jī)制,由組氨酸激酶(histidine kinase, HK)和應(yīng)答調(diào)控蛋白(response regulator, RR)組成,它們能夠使機(jī)體根據(jù)環(huán)境條件的改變做出適當(dāng)?shù)募?xì)胞反應(yīng)。嗜根考克氏菌(Kocuria rhizophila)是一種抗生素活性測(cè)試的常用質(zhì)量控制菌株,但目前有關(guān)它的TCS研究尚不多見(jiàn)。為研究TCSs在細(xì)菌生存適應(yīng)中的潛在作用,采用生物信息學(xué)的方法對(duì)已完成基因組測(cè)序的8個(gè)嗜根考克氏菌菌株的TCSs進(jìn)行數(shù)量統(tǒng)計(jì)、結(jié)構(gòu)分析以及功能預(yù)測(cè)。研究結(jié)果顯示,嗜根考克氏菌中共存在13種TCSs,且HKs和RRs都是模塊化蛋白質(zhì),參與外界壓力應(yīng)答、細(xì)胞壁合成、酶活性、物質(zhì)代謝與運(yùn)輸?shù)壬顒?dòng)。本研究關(guān)于TCSs的研究將有助于系統(tǒng)的理解嗜根考克氏菌以及相關(guān)物種,為構(gòu)建該菌的TCS調(diào)控網(wǎng)絡(luò)提供依據(jù),并可推動(dòng)其在工業(yè)上的應(yīng)用。
【文章頁(yè)數(shù)】:8 頁(yè)
【文章目錄】:
1 結(jié)果與分析
1.1 嗜根考克氏菌的基因組信息
1.2 嗜根考克氏菌中的TCS分布
1.3 嗜根考克氏菌HKs和RRs的結(jié)構(gòu)組成和分布
1.4 嗜根考克氏菌TCSs的功能預(yù)測(cè)
2 討論
3 材料與方法
3.1 基因組序列來(lái)源
3.2 HKs和RRs的鑒定及結(jié)構(gòu)分析
3.3 HKs和RRs的功能預(yù)測(cè)
作者貢獻(xiàn)
本文編號(hào):3707909
【文章頁(yè)數(shù)】:8 頁(yè)
【文章目錄】:
1 結(jié)果與分析
1.1 嗜根考克氏菌的基因組信息
1.2 嗜根考克氏菌中的TCS分布
1.3 嗜根考克氏菌HKs和RRs的結(jié)構(gòu)組成和分布
1.4 嗜根考克氏菌TCSs的功能預(yù)測(cè)
2 討論
3 材料與方法
3.1 基因組序列來(lái)源
3.2 HKs和RRs的鑒定及結(jié)構(gòu)分析
3.3 HKs和RRs的功能預(yù)測(cè)
作者貢獻(xiàn)
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