湖北興山大型子囊菌物種多樣性和分子系統(tǒng)學(xué)研究
發(fā)布時(shí)間:2022-11-05 10:06
對(duì)于特定地區(qū)進(jìn)行生物多樣性調(diào)查研究,是開(kāi)展生物多樣性保護(hù)、物種生存狀態(tài)評(píng)價(jià)和合理開(kāi)發(fā)利用物種資源的重要基礎(chǔ)性工作。大型子囊菌作為生物多樣性的重要組成類群之一,對(duì)于特定區(qū)域的系統(tǒng)性調(diào)查研究卻不多見(jiàn)。本研究對(duì)湖北省興山縣的大型子囊菌資源進(jìn)行實(shí)地調(diào)查和評(píng)估,并根據(jù)獲得的基因數(shù)據(jù)開(kāi)展分子系統(tǒng)學(xué)研究,初步探究其遺傳進(jìn)化關(guān)系。本研究在興山縣6個(gè)鄉(xiāng)鎮(zhèn)20個(gè)地點(diǎn)進(jìn)行調(diào)查和采集,橫跨春夏秋三季,覆蓋5種林型。采集共獲得416份標(biāo)本,隸屬于4綱5目21科51屬。鑒定到種的標(biāo)本共339份,隸屬于4綱5目20科48屬96種,并編寫興山縣大型子囊菌物種名錄,鑒定到屬、未鑒定到種的標(biāo)本有77份。發(fā)現(xiàn)湖北省新記錄40種;食用菌有10種,藥用菌10種,食藥兼用菌有4種,有毒菌有3種;土生、木生和蟲生物種分別有44、43和10種。物種組成分析發(fā)現(xiàn),物種數(shù)量最多的屬為盤菌屬Peziza,盤菌屬Peziza是該縣優(yōu)勢(shì)屬。對(duì)興山大型子囊菌地理分布分析發(fā)現(xiàn),興山縣大型子囊菌物種發(fā)生多集中于海拔800~1600 m、具有典型的亞熱帶常綠落葉闊葉混交林的區(qū)域,最具有代表性的地點(diǎn)是龍門河、萬(wàn)朝山和榛子鄉(xiāng)等生態(tài)林地。本次研究測(cè)序了所有...
【文章頁(yè)數(shù)】:88 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
符號(hào)說(shuō)明
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 大型子囊菌與生物多樣性
1.2 大型子囊菌物種多樣性研究進(jìn)展
1.3 大型子囊菌分子系統(tǒng)學(xué)研究進(jìn)展
1.4 湖北省大型子囊菌研究進(jìn)展
1.5 湖北省興山縣大型子囊菌生長(zhǎng)環(huán)境
1.6 大型子囊菌的遺傳多樣性
1.7 本研究的目的和技術(shù)路線
第二章 興山縣大型子囊菌物種多樣性
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.2 實(shí)驗(yàn)設(shè)備與儀器
2.2.1 野外調(diào)查所需試劑、儀器和工具
2.2.2 實(shí)驗(yàn)室觀察所需試劑、儀器或工具
2.3 實(shí)驗(yàn)方法
2.3.1 野外調(diào)查采集
2.3.2 標(biāo)本處理和保存
2.3.3 分類和鑒定
2.4 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.4.1 組成成分分析
2.4.2 湖北省新記錄種
2.4.3 物種經(jīng)濟(jì)價(jià)值
2.4.4 受威脅程度
2.4.5 興山縣地理分布
2.4.6 營(yíng)養(yǎng)類型
2.4.7 生長(zhǎng)季節(jié)
2.5 討論
第三章 興山縣大型子囊菌分子系統(tǒng)學(xué)研究
3.1 實(shí)驗(yàn)材料
3.2 實(shí)驗(yàn)設(shè)備與儀器
3.2.1 試劑
3.2.2 主要儀器
3.2.3 所需試劑及培養(yǎng)基
3.3 實(shí)驗(yàn)方法
3.3.1 提取基因組DNA方法
3.3.2 DNA質(zhì)量檢測(cè)方法
3.3.3 rDNA擴(kuò)增方法
3.3.4 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物質(zhì)量檢測(cè)
3.3.5 測(cè)序質(zhì)量鑒定方法
3.3.6 克隆測(cè)序方法
3.4 系統(tǒng)發(fā)育分析方法
3.4.1 序列拼接
3.4.2 序列比對(duì)
3.4.3 模糊比對(duì)序列處理
3.4.4 替換飽和檢驗(yàn)
3.4.5 進(jìn)化模型的選擇
3.4.6 建樹(shù)及軟件選擇方法
3.4.7 系統(tǒng)樹(shù)編輯和修飾
3.5 遺傳多樣性分析方法
3.6 研究結(jié)果
3.6.1 興山縣大型子囊菌系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)
3.6.2 興山縣盤菌屬系統(tǒng)發(fā)育學(xué)研究
3.6.3 甜盤菌遺傳多樣性研究
3.7 討論
3.7.1 興山縣大型子囊菌系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)
3.7.2 興山縣盤菌屬系統(tǒng)發(fā)育學(xué)研究
3.7.3 甜盤菌遺傳多樣性研究
第四章 全文總結(jié)
附圖
參考文獻(xiàn)
在讀期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文及研究成果
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]西藏馬鞍菌屬小志[J]. 徐阿生. 菌物系統(tǒng). 2002(02)
[2]廣東省大型真菌概況[J]. 章衛(wèi)民,李泰輝,宋斌. 生態(tài)科學(xué). 2001(04)
[3]DNA序列在植物系統(tǒng)學(xué)研究中的應(yīng)用[J]. 田欣,李德銖. 云南植物研究. 2002(02)
[4]木材腐朽菌在森林生態(tài)系統(tǒng)中的功能[J]. 魏玉蓮,戴玉成. 應(yīng)用生態(tài)學(xué)報(bào). 2004(10)
[5]興山縣天保工程資源監(jiān)測(cè)及實(shí)施對(duì)策探討[J]. 陳光羽,彭洪林. 湖北林業(yè)科技. 2006(06)
[6]叢赤殼科部分屬之間的系統(tǒng)學(xué)關(guān)系(英文)[J]. 張向民,莊文穎. 菌物學(xué)報(bào). 2006(01)
[7]蟲草及相關(guān)真菌的次生代謝產(chǎn)物及其活性[J]. 胡豐林,李增智. 菌物學(xué)報(bào). 2007(04)
[8]大型真菌標(biāo)本的采集與制作[J]. 謝鑫. 生物學(xué)教學(xué). 2005(04)
[9]宜昌市野生真菌資源調(diào)查初報(bào)[J]. 譚愛(ài)華,焦海濤,劉世玲. 食用菌學(xué)報(bào). 2006(01)
[10]湖北省后河自然保護(hù)區(qū)的多孔菌(英文)[J]. 李娟,魏玉蓮,戴玉成. 菌物研究. 2007(04)
博士論文
[1]中國(guó)南方4省區(qū)圓盤菌科分類研究[D]. 任艷玲.廣西大學(xué) 2014
[2]中國(guó)炭角菌科幾個(gè)屬的分類與分子系統(tǒng)學(xué)研究[D]. 馬海霞.吉林農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
碩士論文
[1]遼寧仙人洞國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)大型真菌多樣性研究[D]. 張清洋.吉林農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[2]海棠山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)大型真菌物種多樣性和生態(tài)系統(tǒng)多樣性研究[D]. 徐濟(jì)責(zé).吉林農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[3]湖北省大型真菌資源初步研究[D]. 徐江.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[4]遼寧關(guān)門山國(guó)家森林公園楓葉林大型真菌多樣性研究[D]. 陳俊良.吉林農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
本文編號(hào):3702409
【文章頁(yè)數(shù)】:88 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
符號(hào)說(shuō)明
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 大型子囊菌與生物多樣性
1.2 大型子囊菌物種多樣性研究進(jìn)展
1.3 大型子囊菌分子系統(tǒng)學(xué)研究進(jìn)展
1.4 湖北省大型子囊菌研究進(jìn)展
1.5 湖北省興山縣大型子囊菌生長(zhǎng)環(huán)境
1.6 大型子囊菌的遺傳多樣性
1.7 本研究的目的和技術(shù)路線
第二章 興山縣大型子囊菌物種多樣性
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.2 實(shí)驗(yàn)設(shè)備與儀器
2.2.1 野外調(diào)查所需試劑、儀器和工具
2.2.2 實(shí)驗(yàn)室觀察所需試劑、儀器或工具
2.3 實(shí)驗(yàn)方法
2.3.1 野外調(diào)查采集
2.3.2 標(biāo)本處理和保存
2.3.3 分類和鑒定
2.4 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.4.1 組成成分分析
2.4.2 湖北省新記錄種
2.4.3 物種經(jīng)濟(jì)價(jià)值
2.4.4 受威脅程度
2.4.5 興山縣地理分布
2.4.6 營(yíng)養(yǎng)類型
2.4.7 生長(zhǎng)季節(jié)
2.5 討論
第三章 興山縣大型子囊菌分子系統(tǒng)學(xué)研究
3.1 實(shí)驗(yàn)材料
3.2 實(shí)驗(yàn)設(shè)備與儀器
3.2.1 試劑
3.2.2 主要儀器
3.2.3 所需試劑及培養(yǎng)基
3.3 實(shí)驗(yàn)方法
3.3.1 提取基因組DNA方法
3.3.2 DNA質(zhì)量檢測(cè)方法
3.3.3 rDNA擴(kuò)增方法
3.3.4 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物質(zhì)量檢測(cè)
3.3.5 測(cè)序質(zhì)量鑒定方法
3.3.6 克隆測(cè)序方法
3.4 系統(tǒng)發(fā)育分析方法
3.4.1 序列拼接
3.4.2 序列比對(duì)
3.4.3 模糊比對(duì)序列處理
3.4.4 替換飽和檢驗(yàn)
3.4.5 進(jìn)化模型的選擇
3.4.6 建樹(shù)及軟件選擇方法
3.4.7 系統(tǒng)樹(shù)編輯和修飾
3.5 遺傳多樣性分析方法
3.6 研究結(jié)果
3.6.1 興山縣大型子囊菌系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)
3.6.2 興山縣盤菌屬系統(tǒng)發(fā)育學(xué)研究
3.6.3 甜盤菌遺傳多樣性研究
3.7 討論
3.7.1 興山縣大型子囊菌系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)
3.7.2 興山縣盤菌屬系統(tǒng)發(fā)育學(xué)研究
3.7.3 甜盤菌遺傳多樣性研究
第四章 全文總結(jié)
附圖
參考文獻(xiàn)
在讀期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文及研究成果
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]西藏馬鞍菌屬小志[J]. 徐阿生. 菌物系統(tǒng). 2002(02)
[2]廣東省大型真菌概況[J]. 章衛(wèi)民,李泰輝,宋斌. 生態(tài)科學(xué). 2001(04)
[3]DNA序列在植物系統(tǒng)學(xué)研究中的應(yīng)用[J]. 田欣,李德銖. 云南植物研究. 2002(02)
[4]木材腐朽菌在森林生態(tài)系統(tǒng)中的功能[J]. 魏玉蓮,戴玉成. 應(yīng)用生態(tài)學(xué)報(bào). 2004(10)
[5]興山縣天保工程資源監(jiān)測(cè)及實(shí)施對(duì)策探討[J]. 陳光羽,彭洪林. 湖北林業(yè)科技. 2006(06)
[6]叢赤殼科部分屬之間的系統(tǒng)學(xué)關(guān)系(英文)[J]. 張向民,莊文穎. 菌物學(xué)報(bào). 2006(01)
[7]蟲草及相關(guān)真菌的次生代謝產(chǎn)物及其活性[J]. 胡豐林,李增智. 菌物學(xué)報(bào). 2007(04)
[8]大型真菌標(biāo)本的采集與制作[J]. 謝鑫. 生物學(xué)教學(xué). 2005(04)
[9]宜昌市野生真菌資源調(diào)查初報(bào)[J]. 譚愛(ài)華,焦海濤,劉世玲. 食用菌學(xué)報(bào). 2006(01)
[10]湖北省后河自然保護(hù)區(qū)的多孔菌(英文)[J]. 李娟,魏玉蓮,戴玉成. 菌物研究. 2007(04)
博士論文
[1]中國(guó)南方4省區(qū)圓盤菌科分類研究[D]. 任艷玲.廣西大學(xué) 2014
[2]中國(guó)炭角菌科幾個(gè)屬的分類與分子系統(tǒng)學(xué)研究[D]. 馬海霞.吉林農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
碩士論文
[1]遼寧仙人洞國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)大型真菌多樣性研究[D]. 張清洋.吉林農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[2]海棠山國(guó)家級(jí)自然保護(hù)區(qū)大型真菌物種多樣性和生態(tài)系統(tǒng)多樣性研究[D]. 徐濟(jì)責(zé).吉林農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[3]湖北省大型真菌資源初步研究[D]. 徐江.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[4]遼寧關(guān)門山國(guó)家森林公園楓葉林大型真菌多樣性研究[D]. 陳俊良.吉林農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
本文編號(hào):3702409
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