樟葉越桔CYP450基因片段克隆與家族分析
發(fā)布時間:2022-02-23 02:08
廣泛存在于生物體內(nèi)的CYP450具有參與多種內(nèi)源物質(zhì)的新陳代謝和解除外源化學(xué)物質(zhì)毒害作用的功能。本研究基于RNA-Seq數(shù)據(jù),應(yīng)用RT-PCR技術(shù)首次從樟葉越桔中克隆獲得21個CYP450基因cDNA片段。應(yīng)用生物信息學(xué)技術(shù)對21個樟葉越桔CYP450基因進行相似性分析、功能注釋、家族分類以及聚類分析,除2個基因的家族分類不明確外,其余所有基因被分屬于10個不同的CYP450家族中,分別為:CYP71、CYP72、CYP76、CYP81、CYP82、CYP86、CYP94、CYP97、CYP734和CYP735。推測有10個基因參與脂肪族、芳香族碳的羥基化,4個基因參與植物激素細胞分裂素的合成與降解,3個基因參與脂肪酸的羥基化,2個基因參與萜類化合物的合成。而KEGG分析結(jié)果顯示2個基因家族未知的樟葉越桔CYP450基因可能參與了K00327途徑。21個樟葉越桔CYP450基因能成功地與24個擬南芥CYP450基因聚類到一起。值得關(guān)注的是有2個樟葉越桔CYP450基因CL75.Contig12A(9)和Unigene225702A(14)被歸...
【文章來源】:分子植物育種. 2020,18(02)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:11 頁
【文章目錄】:
1 結(jié)果與分析
1.1 總RNA提取
1.2 樟葉越桔CYP450基因與引物設(shè)計
1.3 樟葉越桔CYP450基因克隆
1.4 序列同源性比對與分析
1.5 樟葉越桔CYP450基因功能注釋與家族分類
1.6 樟葉越桔CYP450家族聚類分析
2 討論
3 材料與方法
3.1 實驗材料
3.2 總RNA提取
3.3 樟葉越桔CYP450基因挖掘與引物設(shè)計
3.4 樟葉越桔CYP450基因克隆
3.5 序列分析與家族聚類
作者貢獻
【參考文獻】:
期刊論文
[1]青海湖裸鯉CYP17a2基因的克隆及表達分析[J]. 張霞,衛(wèi)福磊,張婭,衛(wèi)唯,朱福祥,王玉晴,栗瑞紅,韓步鷹,劉小紅,千康康,吳君,朱世海,李長忠. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2018(05)
[2]刺五加P450基因時空表達差異及與皂苷含量的相關(guān)性分析[J]. 吳鵬,谷俊濤,修樂山,邢朝斌. 河北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2014(03)
[3]家蠶細胞色素P450基因的研究進展[J]. 艾均文,薛宏,何行健,孟繁利,朱勇,向仲懷. 昆蟲學(xué)報. 2011(08)
[4]甜菊醇糖苷生物合成途徑關(guān)鍵酶基因KA13H的克隆及序列分析[J]. 郭書巧,束紅梅,鄭卿,倪萬潮. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2010(05)
[5]植物細胞色素P450基因與功能研究進展[J]. 賀麗虹,趙淑娟,胡之璧. 藥物生物技術(shù). 2008(02)
[6]細胞色素P450基因及其在植物改良中的應(yīng)用[J]. 楊致榮,毛雪,楊致芬,李潤植. 遺傳. 2003(02)
本文編號:3640652
【文章來源】:分子植物育種. 2020,18(02)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:11 頁
【文章目錄】:
1 結(jié)果與分析
1.1 總RNA提取
1.2 樟葉越桔CYP450基因與引物設(shè)計
1.3 樟葉越桔CYP450基因克隆
1.4 序列同源性比對與分析
1.5 樟葉越桔CYP450基因功能注釋與家族分類
1.6 樟葉越桔CYP450家族聚類分析
2 討論
3 材料與方法
3.1 實驗材料
3.2 總RNA提取
3.3 樟葉越桔CYP450基因挖掘與引物設(shè)計
3.4 樟葉越桔CYP450基因克隆
3.5 序列分析與家族聚類
作者貢獻
【參考文獻】:
期刊論文
[1]青海湖裸鯉CYP17a2基因的克隆及表達分析[J]. 張霞,衛(wèi)福磊,張婭,衛(wèi)唯,朱福祥,王玉晴,栗瑞紅,韓步鷹,劉小紅,千康康,吳君,朱世海,李長忠. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2018(05)
[2]刺五加P450基因時空表達差異及與皂苷含量的相關(guān)性分析[J]. 吳鵬,谷俊濤,修樂山,邢朝斌. 河北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2014(03)
[3]家蠶細胞色素P450基因的研究進展[J]. 艾均文,薛宏,何行健,孟繁利,朱勇,向仲懷. 昆蟲學(xué)報. 2011(08)
[4]甜菊醇糖苷生物合成途徑關(guān)鍵酶基因KA13H的克隆及序列分析[J]. 郭書巧,束紅梅,鄭卿,倪萬潮. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2010(05)
[5]植物細胞色素P450基因與功能研究進展[J]. 賀麗虹,趙淑娟,胡之璧. 藥物生物技術(shù). 2008(02)
[6]細胞色素P450基因及其在植物改良中的應(yīng)用[J]. 楊致榮,毛雪,楊致芬,李潤植. 遺傳. 2003(02)
本文編號:3640652
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