粟酒裂殖酵母中Ppr10蛋白的類PPR模體對(duì)線粒體蛋白影響的研究
發(fā)布時(shí)間:2022-02-15 02:06
線粒體擁有自身的基因組(mtDNA),在粟酒裂殖酵母(Schizosaccharomyces pombe,S.pombe)中,mtDNA編碼氧化磷酸化系統(tǒng)中的關(guān)鍵酶,因此mtDNA的正常表達(dá)對(duì)線粒體功能的發(fā)揮至關(guān)重要。PPR蛋白是一類主要調(diào)控細(xì)胞器基因表達(dá)的蛋白家族,粟酒裂殖酵母的Ppr10蛋白是PPR家族中的一員,主要參與mtDNA編碼的呼吸鏈蛋白的合成,與線粒體的功能緊密相關(guān)。PPR模體是由35個(gè)連續(xù)排列的氨基酸組成的重復(fù)單位,Ppr10具有兩個(gè)PPR模體,這兩個(gè)模體對(duì)Ppr10正常發(fā)揮功能必不可少。利用蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)軟件HHrep ID進(jìn)一步分析Ppr10的結(jié)構(gòu)發(fā)現(xiàn),該蛋白具有13個(gè)重復(fù)序列,這些序列均富含亮氨酸等疏水性氨基酸且不保守,與PPR模體特征相似,因此本文中將其命名為類PPR模體并對(duì)其功能進(jìn)行研究。首先構(gòu)建單個(gè)類PPR模體缺失菌并將其命名為ppr10?1-ppr10?13。表型研究結(jié)果表明,單個(gè)缺失類PPR模體1-7導(dǎo)致線粒體功能嚴(yán)重受損,而缺失類PPR模體8會(huì)部分影響線粒體功能或者影響不顯著,且單個(gè)缺失類PPR模體1-7和10導(dǎo)致細(xì)胞在穩(wěn)定期后期大量死亡。利用免疫印跡方...
【文章來(lái)源】:南京師范大學(xué)江蘇省211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:65 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
各類型PPR蛋白結(jié)構(gòu)示意圖[44]
第二章粟酒裂殖酵母中Ppr10類PPR模體缺失后表型的研究10圖2.1菌種構(gòu)建示意圖A:Ppr10蛋白結(jié)構(gòu)圖;B:菌株的構(gòu)建示意圖;MTS:線粒體定位序列;PPR模體在7號(hào)和8號(hào)類PPR模體的位置。Figure2.1SchematicdiagramofstrainconstructionA:Ppr10proteinstructure;B:Schematicdiagramofstrainconstruction;MTS:mitochondriallocalizationsequence;PPRmotifislocatedatNo.7andNo.8repeat.2.1.2所用試劑及耗材蛋白胨、葡萄糖、瓊脂粉、酵母粉、腺嘌呤、尿嘧啶、精氨酸、組氨酸均購(gòu)自上海生工生物公司,PrimerStar酶、連接酶、各種限制性內(nèi)切酶、鮭魚精、潮霉素和RNaseA購(gòu)自Sigma,引物合成及測(cè)序工作由上海生工生物公司完成,Tris、EDTA、NaOH、醋酸鈉、醋酸鋰及PEG購(gòu)于丁貝公司,常用試劑及分析純?cè)噭┵?gòu)自國(guó)藥試劑公司與上海生工生物公司。2.1.3培養(yǎng)基與試劑配制1.培養(yǎng)基(1)YES(YeastExtractwithsupplements)培養(yǎng)基(1L)葡萄糖(glucose)30g酵母粉(yeastextract)5g腺嘌呤(adenine)0.225g組氨酸(histidine)0.225g尿嘧啶(uracil)0.225g亮氨酸(leucine)0.225g
第二章粟酒裂殖酵母中Ppr10類PPR模體缺失后表型的研究132.1.4引物序列表2.1本章所用引物Table2.1Primersusedinthischapter引物名稱引物序列ppr10-up-BamHICGCGGATCCATCTTTATAGCCCCAAAACTCppr10-13-U-dwTTTAATCTTAGATGCGAAGGTTTTTTCppr10-13-D-upGAAAAAACCTTCGCATCTAAGATTAAAACTCTGGATGAGATAGCS-13-dwTCGCTTATTTAGAAGTGGppr10-dw-SmaITCCCCCGGGATAGTTAAAGCATCTATAAACGACppr10-dw-cxCACCGTTAATTAACCCGGG2.1.5質(zhì)粒圖譜本章中所用的質(zhì)粒為Pppr10-ppr10,該質(zhì)粒由整合型質(zhì)粒pJK148改造而來(lái),該質(zhì)粒的啟動(dòng)子為ppr10基因的自身啟動(dòng)子,目的片段插入到BamHI和SmaI兩個(gè)酶切位點(diǎn)之間可將質(zhì)粒上的ppr10基因置換從而得到想要的質(zhì)粒。質(zhì)粒圖譜如圖2.2所示。圖2.2Pppr10-ppr10質(zhì)粒示意圖Figure2.2TheSchematicofPppr10-ppr10plasmidmap
本文編號(hào):3625697
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【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
各類型PPR蛋白結(jié)構(gòu)示意圖[44]
第二章粟酒裂殖酵母中Ppr10類PPR模體缺失后表型的研究10圖2.1菌種構(gòu)建示意圖A:Ppr10蛋白結(jié)構(gòu)圖;B:菌株的構(gòu)建示意圖;MTS:線粒體定位序列;PPR模體在7號(hào)和8號(hào)類PPR模體的位置。Figure2.1SchematicdiagramofstrainconstructionA:Ppr10proteinstructure;B:Schematicdiagramofstrainconstruction;MTS:mitochondriallocalizationsequence;PPRmotifislocatedatNo.7andNo.8repeat.2.1.2所用試劑及耗材蛋白胨、葡萄糖、瓊脂粉、酵母粉、腺嘌呤、尿嘧啶、精氨酸、組氨酸均購(gòu)自上海生工生物公司,PrimerStar酶、連接酶、各種限制性內(nèi)切酶、鮭魚精、潮霉素和RNaseA購(gòu)自Sigma,引物合成及測(cè)序工作由上海生工生物公司完成,Tris、EDTA、NaOH、醋酸鈉、醋酸鋰及PEG購(gòu)于丁貝公司,常用試劑及分析純?cè)噭┵?gòu)自國(guó)藥試劑公司與上海生工生物公司。2.1.3培養(yǎng)基與試劑配制1.培養(yǎng)基(1)YES(YeastExtractwithsupplements)培養(yǎng)基(1L)葡萄糖(glucose)30g酵母粉(yeastextract)5g腺嘌呤(adenine)0.225g組氨酸(histidine)0.225g尿嘧啶(uracil)0.225g亮氨酸(leucine)0.225g
第二章粟酒裂殖酵母中Ppr10類PPR模體缺失后表型的研究132.1.4引物序列表2.1本章所用引物Table2.1Primersusedinthischapter引物名稱引物序列ppr10-up-BamHICGCGGATCCATCTTTATAGCCCCAAAACTCppr10-13-U-dwTTTAATCTTAGATGCGAAGGTTTTTTCppr10-13-D-upGAAAAAACCTTCGCATCTAAGATTAAAACTCTGGATGAGATAGCS-13-dwTCGCTTATTTAGAAGTGGppr10-dw-SmaITCCCCCGGGATAGTTAAAGCATCTATAAACGACppr10-dw-cxCACCGTTAATTAACCCGGG2.1.5質(zhì)粒圖譜本章中所用的質(zhì)粒為Pppr10-ppr10,該質(zhì)粒由整合型質(zhì)粒pJK148改造而來(lái),該質(zhì)粒的啟動(dòng)子為ppr10基因的自身啟動(dòng)子,目的片段插入到BamHI和SmaI兩個(gè)酶切位點(diǎn)之間可將質(zhì)粒上的ppr10基因置換從而得到想要的質(zhì)粒。質(zhì)粒圖譜如圖2.2所示。圖2.2Pppr10-ppr10質(zhì)粒示意圖Figure2.2TheSchematicofPppr10-ppr10plasmidmap
本文編號(hào):3625697
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