染色質(zhì)轉(zhuǎn)座酶可及性測序（assay for transposase-accessible chromatin with high-throughput sequencing,ATAC-seq）誕生于2013年,具有比脫氧核糖核酸酶I超敏感位點測序（deoxyribonuclease I hypersensitive site sequencing, DNase-seq）和微球菌核酸酶敏感位點測序（micrococcal nuclease sequencing, MNase-seq）更快速、靈敏、簡便的優(yōu)點,是目前分析全基因組范圍染色質(zhì)開放區(qū)域的熱點技術(shù)。通過該技術(shù)能獲得染色質(zhì)開放區(qū)域的相關(guān)信息,從而映射出轉(zhuǎn)錄因子等調(diào)控蛋白的結(jié)合區(qū)域和核小體定位等信息,對于研究表觀遺傳分子機(jī)制具有重要意義。本文比較了5種獲取染色質(zhì)開放區(qū)域技術(shù)的優(yōu)缺點,重點介紹了ATAC-seq的原理和主要流程,描述了利用ATAC-seq技術(shù)研究染色質(zhì)開放區(qū)域的發(fā)展概況以及ATAC-seq的相關(guān)應(yīng)用,期望對真核生物全基因組水平的染色質(zhì)開放區(qū)域研究、順式調(diào)控元件鑒定以及遺傳調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的解析等提供借鑒。 

【文章來源】：遺傳. 2020,42(04)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：14 頁

【部分圖文】：

轉(zhuǎn)座及擴(kuò)增過程示意圖

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]下一代測序技術(shù)在干細(xì)胞轉(zhuǎn)錄調(diào)控研究中的應(yīng)用[J]. 劉亞軍,張峰,劉宏德,孫嘯.  遺傳. 2017(08)



本文編號：3625389