在漫長(zhǎng)的進(jìn)化過(guò)程中,宿主為了抵御病毒的入侵,進(jìn)化出各種防御機(jī)制;病毒為了存活,也進(jìn)化出逃避宿主防御的各種分子機(jī)制。CRISPR-Cas系統(tǒng)是原核生物（包括古菌和細(xì)菌）進(jìn)化出的,用來(lái)抵御外源遺傳元件（包括病毒和質(zhì)粒）入侵的獲得性免疫系統(tǒng)。但是,我們目前對(duì)這種共同進(jìn)化的關(guān)系及其分子機(jī)制的了解還十分貧乏。本項(xiàng)研究旨在揭示冰島硫化葉菌體內(nèi),Ⅲ-B亞型CRISPR-Cas系統(tǒng)Cmr-α干涉過(guò)程中,關(guān)鍵蛋白亞基Cmr2（Cas10家族蛋白）的兩個(gè)關(guān)鍵保守功能域（HD結(jié)構(gòu)域和Palm結(jié)構(gòu)域）對(duì)Cmr-α核酸干涉活性的影響。并進(jìn)一步系統(tǒng)定位古菌病毒SMV1和STSV2中逃逸或阻礙Ⅲ-B Cmr-α亞型抗病毒免疫的關(guān)鍵基因,從而幫助揭示古菌病毒與宿主共同進(jìn)化的過(guò)程中,是如何相互作用的。本研究實(shí)驗(yàn)結(jié)果如下:1.使用靶向冰島硫化葉菌基因組lac S基因并且能夠激活Cmr2的非特異性核酸干涉活性的mini CRISPR質(zhì)粒,探索在冰島硫化葉菌體內(nèi),其Ⅲ-B型Cmr-α復(fù)合物中Cmr2（Cas10）亞基的保守功能域HD結(jié)構(gòu)域、Palm結(jié)構(gòu)域?qū)怂岣缮孢^(guò)程的影響。結(jié)果發(fā)現(xiàn):Palm結(jié)構(gòu)域突變復(fù)合物仍然具有高效非特... 

【文章來(lái)源】：華中農(nóng)業(yè)大學(xué)湖北省211工程院校教育部直屬院校

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【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

生物的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)(Madiganetal2018)

古菌的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)（http://genome.ucsc.edu）

華中農(nóng)業(yè)大學(xué)2020屆碩士研究生學(xué)位論文14經(jīng)過(guò)全基因組測(cè)序分析，冰島硫化葉菌基因組由兩個(gè)CRISPRlocus組成，其中的repeat序列高度保守，一個(gè)含有114個(gè)“repeat-spacer”單位，一個(gè)含有92個(gè)“repeat-spacer”單位(Guoetal2011)。S.islandicusREY15A所編碼CRISPR-Cas免疫系統(tǒng)有3種不同的類(lèi)型，分別是一個(gè)I-A（Cascade）亞型和兩個(gè)III-B（Cmr-α和Cmr-β）亞型。在冰島硫化葉菌REY15A體內(nèi)，其包含的CRISPR-Cas體系的作用機(jī)理如下（圖1-4）(Jacksonetal2017)。圖1-4CRISPR-Cas系統(tǒng)的作用機(jī)制(Jacksonetal2017)。Fig.1-4MechanismoftheCRISPR-Cassystem(Jacksonetal2017).（1）免疫適應(yīng)（CRISPRadaptation）。質(zhì)粒與病毒等都屬于外源遺傳元件，


本文編號(hào)：3611743