發(fā)布時間：2022-01-27 00:15

　　【目的】研究34株不同來源羅伊氏乳桿菌（Lactobacillus reuteri）基因多樣性及生境適應(yīng)性機制,了解該菌株在腸外生境及腸內(nèi)生境中適應(yīng)性的異同,為L. reuteri優(yōu)良菌株的開發(fā)提供理論基礎(chǔ)�！痉椒ā炕诙鷾y序平臺對11株源于發(fā)酵食品（酸馬奶、酸粥）的L. reuteri進(jìn)行測序,并應(yīng)用比較基因組學(xué)將其與發(fā)酵食品、酸面團(tuán)、食草動物L(fēng). reuteri分離株基因組進(jìn)行比較分析�！窘Y(jié)果】分離自酸馬奶、酸粥L. reuteri基因組大小平均為2.14 Mb,GC含量平均為38.77%,且同種來源分離株系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系距離較近。泛-核心基因集分別包含7242個、969個基因家族,其中酸馬奶分離株特異性基因最多為459個。功能注釋結(jié)果顯示不同來源菌株碳水化合物、氨基酸相關(guān)基因數(shù)量及種類差異較大,僅在發(fā)酵食品和食草動物株中發(fā)現(xiàn)抗生素耐藥性基因。注釋到的碳水化合物活性酶中僅出現(xiàn)在發(fā)酵食品與食草動物分離株的為GH3 （β-葡萄糖苷酶等）和GH43 （β-木糖苷酶等）,特有的分別為AA3 （纖維二糖脫氫酶等）和GH66 （葡萄糖轉(zhuǎn)移酶等）�！窘Y(jié)論】不同來源L. reuteri具有廣泛的基因... 

【文章來源】：微生物學(xué)報. 2020,60(05)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：12 頁

【部分圖文】：

泛-核心基因集變化趨勢圖(A)和附屬基因集在34株L.reuteri中的存在與缺失(B)

核心基因COG注釋結(jié)果

基于四類不同來源菌株核心基因構(gòu)建的Venn圖


本文編號：3611385