煙草DGAT基因家族全基因組鑒定與分析
發(fā)布時間:2022-01-24 16:57
二酰甘油;D(zhuǎn)移酶(DGAT)是三酰甘油合成的關(guān)鍵酶和唯一限速酶。在煙草中鑒定DGAT基因?qū)τ谘芯坑椭x途徑和創(chuàng)造具有附加值的新型油料作物具有重要意義。本研究從煙草基因組鑒定DGAT家族基因,并對序列特性、基因結(jié)構(gòu)、亞細胞定位、進化模式、表達模式等進行分析。結(jié)果表明,共獲得25個煙草DGAT家族蛋白,其平均氨基酸長度為485,大部分為堿性蛋白和親水性蛋白,有13個DGAT蛋白定位到8條連鎖群上;有16個蛋白定位到內(nèi)質(zhì)網(wǎng),6個定位葉綠體,3個定位到胞外;煙草DGAT蛋白包含典型的WSDGAT結(jié)構(gòu)域和LPLAT結(jié)構(gòu)域;系統(tǒng)發(fā)育樹將DGAT家族分為DGAT1、DGAT2、DGAT3和WSD等4個類群,但煙草DGAT僅劃分到DGAT2和WSD兩個類群;不同煙草DGAT基因的時空表達特性有所差異,并表現(xiàn)出一定的組織特異性,主要集中在衰老葉片和花器官中大量表達。
【文章來源】:中國煙草科學. 2020,41(01)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:8 頁
【部分圖文】:
DGAT基因家族系統(tǒng)發(fā)育樹
基因結(jié)構(gòu)分析結(jié)果顯示(圖2b),聚成一簇的基因結(jié)構(gòu)相似,WSD亞型基因序列平均外顯子數(shù)目為6.24個,范圍為2~8個,DGAT亞型基因序列平均外顯子數(shù)目為11.25個,范圍為5~14個。WSD亞型基因外顯子數(shù)目相對較少,基因序列相對較短。這在一定程度上也反映了基因的進化關(guān)系。2.6 基因表達分析
基因表達分析結(jié)果顯示(圖3),不同基因的表達模式有所差異,并表現(xiàn)出一定的組織特異性;騈t DGAT1~Nt DGAT8的表達模式類似,在未開放花蕾、已開放花蕾、花頂端和花等花器官以及莖生葉中的表達量均較低,在早期、早中期、中后期、后期衰老葉、成熟葉等葉片以及幼芽中的表達量均較高,在種子、幼葉、子葉、莖尖等幼嫩組織以及上部莖中的表達量中等。但其中基因Nt DGAT1、Nt DGAT2、Nt DGAT3和Nt DGAT5在下部莖、成熟根、幼根中的表達量較高,而基因Nt DGAT4、Nt DGAT6、Nt DGAT7和Nt DGAT8在這些組織中的表達量中等;騈t WSD13、NtWSD14和NtWSD15除了在種子、幼葉和莖尖的表達量較低外,在其余組織中的表達情況與Nt DGAT1、Nt DGAT2、Nt DGAT3和Nt DGAT5的表達模式基本一致;騈tWSD16和NtWSD17在幼芽、子葉、幼葉和莖端的表達量較高,在花和幼根中的表達量較低,在其余組織中的表達量趨于中等。基因NtWSD1~NtWSD12的表達模式相似,并且與基因Nt DGAT1~Nt DGAT8的表達模式相反,在未開放花蕾、已開放花蕾、花頂端和花等花器官以及莖生葉中的表達量均較高,在早期、早中期、中后期、后期衰老葉、成熟葉以及幼芽中的表達量均較低,在種子、幼葉、子葉、莖尖等幼嫩組織以及上部莖中的表達量中等?傮w來看,DGAT家族基因主要集中在衰老葉片和花器官中大量表達。3 討論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]不同類型煙草種子蛋白質(zhì)、脂肪及其主要活性成分分析[J]. 楊瓊,侯小東,劉艷華,張懷寶,付秋娟,張富軍,杜詠梅. 中國煙草科學. 2019(06)
[2]花生DGAT基因家族的生物信息學分析[J]. 鄭玲,單雷,李新國,郭峰,孟靜靜,萬書波,彭振英. 山東農(nóng)業(yè)科學. 2018(06)
[3]煙籽油成分分析及體內(nèi)抗氧化作用研究[J]. 侯小東,張懷寶,張忠鋒,梁惠,傅泳,付秋娟,毛新新,杜詠梅. 中國煙草科學. 2016(04)
本文編號:3606952
【文章來源】:中國煙草科學. 2020,41(01)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:8 頁
【部分圖文】:
DGAT基因家族系統(tǒng)發(fā)育樹
基因結(jié)構(gòu)分析結(jié)果顯示(圖2b),聚成一簇的基因結(jié)構(gòu)相似,WSD亞型基因序列平均外顯子數(shù)目為6.24個,范圍為2~8個,DGAT亞型基因序列平均外顯子數(shù)目為11.25個,范圍為5~14個。WSD亞型基因外顯子數(shù)目相對較少,基因序列相對較短。這在一定程度上也反映了基因的進化關(guān)系。2.6 基因表達分析
基因表達分析結(jié)果顯示(圖3),不同基因的表達模式有所差異,并表現(xiàn)出一定的組織特異性;騈t DGAT1~Nt DGAT8的表達模式類似,在未開放花蕾、已開放花蕾、花頂端和花等花器官以及莖生葉中的表達量均較低,在早期、早中期、中后期、后期衰老葉、成熟葉等葉片以及幼芽中的表達量均較高,在種子、幼葉、子葉、莖尖等幼嫩組織以及上部莖中的表達量中等。但其中基因Nt DGAT1、Nt DGAT2、Nt DGAT3和Nt DGAT5在下部莖、成熟根、幼根中的表達量較高,而基因Nt DGAT4、Nt DGAT6、Nt DGAT7和Nt DGAT8在這些組織中的表達量中等;騈t WSD13、NtWSD14和NtWSD15除了在種子、幼葉和莖尖的表達量較低外,在其余組織中的表達情況與Nt DGAT1、Nt DGAT2、Nt DGAT3和Nt DGAT5的表達模式基本一致;騈tWSD16和NtWSD17在幼芽、子葉、幼葉和莖端的表達量較高,在花和幼根中的表達量較低,在其余組織中的表達量趨于中等。基因NtWSD1~NtWSD12的表達模式相似,并且與基因Nt DGAT1~Nt DGAT8的表達模式相反,在未開放花蕾、已開放花蕾、花頂端和花等花器官以及莖生葉中的表達量均較高,在早期、早中期、中后期、后期衰老葉、成熟葉以及幼芽中的表達量均較低,在種子、幼葉、子葉、莖尖等幼嫩組織以及上部莖中的表達量中等?傮w來看,DGAT家族基因主要集中在衰老葉片和花器官中大量表達。3 討論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]不同類型煙草種子蛋白質(zhì)、脂肪及其主要活性成分分析[J]. 楊瓊,侯小東,劉艷華,張懷寶,付秋娟,張富軍,杜詠梅. 中國煙草科學. 2019(06)
[2]花生DGAT基因家族的生物信息學分析[J]. 鄭玲,單雷,李新國,郭峰,孟靜靜,萬書波,彭振英. 山東農(nóng)業(yè)科學. 2018(06)
[3]煙籽油成分分析及體內(nèi)抗氧化作用研究[J]. 侯小東,張懷寶,張忠鋒,梁惠,傅泳,付秋娟,毛新新,杜詠梅. 中國煙草科學. 2016(04)
本文編號:3606952
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