光合作用是生物界賴以生存的基礎(chǔ),也是地球碳氧循環(huán)的重要媒介。光合代謝系統(tǒng)提供了生命體基本的物質(zhì)來源,同時是未來生物工業(yè)發(fā)展的基石。光合代謝網(wǎng)絡(luò)的研究是生物學(xué)的熱點(diǎn)問題之一。通過對全球碳循環(huán)的主要參與者和初級生產(chǎn)力的主要貢獻(xiàn)者--光合生物藍(lán)細(xì)菌聚球藻（Synechococcus）的代謝流、代謝途徑等網(wǎng)絡(luò)特性的研究,了解生物體代謝過程,以及酶反應(yīng)之間的影響。生物過程的系統(tǒng)級建模和模擬,在定量和動態(tài)獲得細(xì)胞功能方面具有指導(dǎo)作用。本文利用基于約束的代謝網(wǎng)絡(luò)分析方法在計(jì)算機(jī)中模擬細(xì)胞代謝,分析聚球藻代謝網(wǎng)絡(luò)的基本拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)和網(wǎng)絡(luò)內(nèi)在聯(lián)系。iJB785模型是為聚球藻Synechococcus elongatus PCC 7942建立的模型,以該聚球藻為實(shí)驗(yàn)對象,我們通過對其代謝網(wǎng)絡(luò)中的反應(yīng)進(jìn)行逐一刪除,使用FBA方法分析敲除反應(yīng)后的代謝網(wǎng)絡(luò)的通量分布,以及該反應(yīng)的敲除對其余反應(yīng)的影響,并找到代謝網(wǎng)絡(luò)中對整個系統(tǒng)有影響的反應(yīng),進(jìn)一步驗(yàn)證其網(wǎng)絡(luò)理論和模型方法的可行性。對所構(gòu)建的突變體進(jìn)行代謝研究,比較其與野生型Synechococcus在上述功能方面的差異。并使用FVA方法找到給定約束條件的目標(biāo)函數(shù)的最... 

【文章來源】：貴州師范大學(xué)貴州省

【文章頁數(shù)】：58 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

光合作用圖解

圖 2-1 BIGG models--Synechococcus elongatus PCC 7942Fig.2-1 BIGG models--Synechococcus elongatus PCC 7942模型及工具BiGG 數(shù)據(jù)庫提供支持 Matlab 數(shù)據(jù)格式的基于約束的重建和分析模RA)。選用 BiGG 開放數(shù)據(jù)庫中的 iJB785 模型作為實(shí)驗(yàn)對象，iJB藻 Synechococcus elongatus PCC 7942 建立的模型。包含 768 個代謝應(yīng)。計(jì)算其野生型的最大生物量為 0.0539。如圖 2-2 所示。

鼠標(biāo)放置在相應(yīng)的節(jié)點(diǎn)上，出現(xiàn)反應(yīng)和代謝物的詳細(xì)信息

【參考文獻(xiàn)】：
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本文編號：3554701