羅伊氏乳桿菌J1益生特性初步評價(jià)及基因組學(xué)研究
發(fā)布時(shí)間:2021-12-23 14:32
羅伊氏乳桿菌(Lactobacillus reuteri)是一種性能良好的乳酸菌,廣泛應(yīng)用于功能性食品的開發(fā)中。該菌株具有多種益生功能,其中羅伊氏乳桿菌對機(jī)體的免疫調(diào)節(jié)功能受到了廣泛關(guān)注。在菌株特性的評價(jià)過程中,傳統(tǒng)的評價(jià)方法多以生化試驗(yàn)為基礎(chǔ),但隨著全基因組測序技術(shù)的成熟,研究者可從生物信息角度在微生物基因結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上,探索微生物的生物學(xué)功能,大大推進(jìn)了乳酸菌研究的發(fā)展。由于乳酸菌具有菌株特異性,因此,本研究將體外試驗(yàn)與基因組學(xué)相結(jié)合對羅伊氏乳桿菌J1的免疫功能和分子生物學(xué)信息進(jìn)行研究,為揭示羅伊氏乳桿菌益生機(jī)理以及遺傳特性奠定基礎(chǔ)。本研究以羅伊氏乳桿菌J1(L.reuteri J1)為研究對象,該菌株分離自傳統(tǒng)發(fā)酵乳制品,對其黏附能力、胃腸道耐受性、抑菌能力以及免疫調(diào)節(jié)功能等益生特性進(jìn)行初步評價(jià),進(jìn)一步利用全基因組測序技術(shù)對其進(jìn)行基因組組分分析和比較基因組研究,挖掘該菌株的遺傳基礎(chǔ)。通過上述研究,得到以下研究結(jié)果:(1)羅伊氏乳桿菌J1具有較強(qiáng)的黏附能力。其黏附數(shù)為867±88.0 CFU/100Caco-2 Cells,黏附率可達(dá)87.93%,與試驗(yàn)中的對照菌株相比,該菌株具備較...
【文章來源】:東北農(nóng)業(yè)大學(xué)黑龍江省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:76 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
英文摘要
1 前言
1.1 羅伊氏乳桿菌介紹
1.1.1 羅伊氏乳桿菌基本特性
1.1.2 羅伊氏乳桿菌的益生功能
1.1.3 羅伊氏乳桿菌的應(yīng)用
1.2 免疫功能
1.2.1 乳酸菌對免疫的影響
1.2.2 乳酸菌的免疫調(diào)節(jié)成分
1.2.3 羅伊氏乳桿菌的免疫作用
1.3 基因組測序技術(shù)與比較基因組
1.3.1 基因組測序技術(shù)簡介
1.3.2 基因組測序技術(shù)在乳酸菌中的應(yīng)用
1.3.3 比較基因組在乳酸菌中的應(yīng)用
1.4 研究的目的與意義
1.5 研究內(nèi)容
2 材料與方法
2.1 材料與儀器
2.1.1 試驗(yàn)菌株及細(xì)胞
2.1.2 主要生化試劑
2.1.3 主要儀器與設(shè)備
2.1.4 主要溶液的配制
2.2 試驗(yàn)方法
2.2.1 菌株活化與保藏
2.2.2 菌株鑒定
2.2.3 黏附能力評價(jià)
2.2.4 生長曲線及胃腸道耐受性試驗(yàn)
2.2.5 抑菌能力評價(jià)
2.2.6 免疫相關(guān)基因表達(dá)研究
2.2.7 數(shù)據(jù)與圖像分析
2.2.8 羅伊氏乳桿菌J1 全基因組測序
2.2.9 免疫功能基因挖掘
2.2.10 比較基因組學(xué)分析
3.結(jié)果與分析
3.1 菌株鑒定
3.1.1 形態(tài)學(xué)觀察
3.1.2 SEM觀測結(jié)果分析
3.1.3 16S rDNA鑒定
3.2 羅伊氏乳桿菌J1 黏附能力評價(jià)
3.2.1 Caco-2 細(xì)胞的培養(yǎng)
3.2.2 黏附能力評價(jià)
3.3 羅伊氏乳桿菌J1 收獲期的確定及胃腸道耐受性評價(jià)
3.3.1 收獲期的確定
3.3.2 耐酸性評價(jià)
3.3.3 耐膽鹽評價(jià)
3.3.4 耐人工胃腸液評價(jià)
3.3.5 耐鹽性評價(jià)
3.4 羅伊氏乳桿菌抑菌能力的測定
3.5 免疫相關(guān)基因表達(dá)的體外評價(jià)
3.5.1 RNA完整性和純度檢測
3.5.2 免疫相關(guān)基因表達(dá)量動(dòng)態(tài)變化
3.6 基因組測序質(zhì)量分析
3.7 羅伊氏乳桿菌J1 基因組特征分析
3.7.1 基因組的基本特點(diǎn)
3.7.2 基因組基因預(yù)測及功能注釋
3.7.3 基因組組分分析
3.7.4 免疫功能基因挖掘
3.8 比較基因組分析
3.8.1 泛基因與核心基因分析
3.8.2 基因進(jìn)化分析
3.8.3 平均核苷酸一致性分析
4 討論
4.1 黏附能力評價(jià)
4.2 環(huán)境耐受性評價(jià)
4.2.1 酸耐受性評價(jià)
4.2.2 膽鹽耐受性評價(jià)
4.2.3 人工胃腸液耐受性評價(jià)
4.2.4 鹽耐受性評價(jià)
4.3 抑菌能力分析
4.3.1 發(fā)酵上清液抑菌能力分析
4.3.2 甘油發(fā)酵液抑菌能力分析
4.4 免疫相關(guān)基因表達(dá)分析
4.5 基因組特點(diǎn)分析
4.6 免疫功能基因分析
4.7 比較基因組學(xué)分析
5 結(jié)論
致謝
參考文獻(xiàn)
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]趨化因子CCL20、SDF-1在大腸癌中的表達(dá)及其與淋巴結(jié)及肝臟轉(zhuǎn)移的關(guān)系[J]. 陳志京,廖山嬰,吳伍林,賴曉嶸,林煥建. 廣東醫(yī)學(xué). 2018(17)
[2]Caco-2細(xì)胞培養(yǎng)、細(xì)胞單層模型建立的研究[J]. 雷艷青,李煥德. 臨床合理用藥雜志. 2018(20)
[3]一株羅伊氏乳桿菌的分離鑒定及其益生性能研究[J]. 杜志琳,尹望,李雪平. 飼料研究. 2017(11)
[4]嗜鉛乳酸菌JT1傳代培養(yǎng)穩(wěn)定性研究[J]. 朱鳳,都啟晶,滿兆紅,王玉燕,趙宏坤. 糧油食品科技. 2016(05)
[5]干酪乳桿菌對細(xì)菌性腸炎NF-κB通路及其介導(dǎo)的炎性介質(zhì)的影響[J]. 潘娜,王開,齊宇,伊淑帥,胡桂學(xué). 中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2016(09)
[6]羅伊氏乳桿菌的益生特性及安全性分析[J]. 朱振軍,黃國宏,梁曉琳,蔡達(dá),梁愛紅,李全陽. 現(xiàn)代食品科技. 2016(06)
[7]3株羅伊氏乳桿菌生物學(xué)特性的分析比較[J]. 李文靜,梁運(yùn)祥,趙述淼. 微生物學(xué)通報(bào). 2016(05)
[8]羅伊氏乳桿菌體外抑菌和免疫調(diào)節(jié)性能的研究[J]. 池海波,李燁. 中國乳品工業(yè). 2015(12)
[9]細(xì)菌磷壁酸的免疫調(diào)控作用及與其結(jié)構(gòu)的關(guān)系[J]. 高權(quán)新,彭士明,張晨捷,姚震,張慧,施兆鴻. 動(dòng)物營養(yǎng)學(xué)報(bào). 2016(01)
[10]東北粘豆包中一株羅伊氏乳桿菌的分離、鑒定與益生性質(zhì)研究[J]. 孫大慶,李洪飛,楊健,張麗萍. 黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué)學(xué)報(bào). 2015(05)
博士論文
[1]羅伊氏乳桿菌全基因組序列分析及其調(diào)節(jié)仔豬腸黏膜免疫功能的研究[D]. 侯成立.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]植物乳桿菌ST-Ⅲ全基因組序列分析及其對低聚果糖代謝通路的解析[D]. 陳臣.江南大學(xué) 2014
碩士論文
[1]麥芽糊精促進(jìn)Lactobacillus plantarum Lp-115膽鹽耐受性及相關(guān)酶學(xué)性質(zhì)的研究[D]. 王建琴.華東理工大學(xué) 2018
[2]2株溶血不動(dòng)桿菌全基因組測序及生物信息學(xué)分析[D]. 宋程程.天津大學(xué) 2016
[3]脂磷壁酸在植物乳桿菌免疫調(diào)節(jié)過程中的作用研究[D]. 初佳麗.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[4]豬源羅伊氏乳桿菌的篩選、特性研究及應(yīng)用[D]. 王巧麗.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[5]產(chǎn)細(xì)菌素植物乳桿菌的初探及其應(yīng)用[D]. 王小娜.浙江工商大學(xué) 2011
[6]羅伊氏乳桿菌生物學(xué)特性及功能性發(fā)酵乳的研究[D]. 李正華.江南大學(xué) 2008
本文編號:3548654
【文章來源】:東北農(nóng)業(yè)大學(xué)黑龍江省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:76 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
英文摘要
1 前言
1.1 羅伊氏乳桿菌介紹
1.1.1 羅伊氏乳桿菌基本特性
1.1.2 羅伊氏乳桿菌的益生功能
1.1.3 羅伊氏乳桿菌的應(yīng)用
1.2 免疫功能
1.2.1 乳酸菌對免疫的影響
1.2.2 乳酸菌的免疫調(diào)節(jié)成分
1.2.3 羅伊氏乳桿菌的免疫作用
1.3 基因組測序技術(shù)與比較基因組
1.3.1 基因組測序技術(shù)簡介
1.3.2 基因組測序技術(shù)在乳酸菌中的應(yīng)用
1.3.3 比較基因組在乳酸菌中的應(yīng)用
1.4 研究的目的與意義
1.5 研究內(nèi)容
2 材料與方法
2.1 材料與儀器
2.1.1 試驗(yàn)菌株及細(xì)胞
2.1.2 主要生化試劑
2.1.3 主要儀器與設(shè)備
2.1.4 主要溶液的配制
2.2 試驗(yàn)方法
2.2.1 菌株活化與保藏
2.2.2 菌株鑒定
2.2.3 黏附能力評價(jià)
2.2.4 生長曲線及胃腸道耐受性試驗(yàn)
2.2.5 抑菌能力評價(jià)
2.2.6 免疫相關(guān)基因表達(dá)研究
2.2.7 數(shù)據(jù)與圖像分析
2.2.8 羅伊氏乳桿菌J1 全基因組測序
2.2.9 免疫功能基因挖掘
2.2.10 比較基因組學(xué)分析
3.結(jié)果與分析
3.1 菌株鑒定
3.1.1 形態(tài)學(xué)觀察
3.1.2 SEM觀測結(jié)果分析
3.1.3 16S rDNA鑒定
3.2 羅伊氏乳桿菌J1 黏附能力評價(jià)
3.2.1 Caco-2 細(xì)胞的培養(yǎng)
3.2.2 黏附能力評價(jià)
3.3 羅伊氏乳桿菌J1 收獲期的確定及胃腸道耐受性評價(jià)
3.3.1 收獲期的確定
3.3.2 耐酸性評價(jià)
3.3.3 耐膽鹽評價(jià)
3.3.4 耐人工胃腸液評價(jià)
3.3.5 耐鹽性評價(jià)
3.4 羅伊氏乳桿菌抑菌能力的測定
3.5 免疫相關(guān)基因表達(dá)的體外評價(jià)
3.5.1 RNA完整性和純度檢測
3.5.2 免疫相關(guān)基因表達(dá)量動(dòng)態(tài)變化
3.6 基因組測序質(zhì)量分析
3.7 羅伊氏乳桿菌J1 基因組特征分析
3.7.1 基因組的基本特點(diǎn)
3.7.2 基因組基因預(yù)測及功能注釋
3.7.3 基因組組分分析
3.7.4 免疫功能基因挖掘
3.8 比較基因組分析
3.8.1 泛基因與核心基因分析
3.8.2 基因進(jìn)化分析
3.8.3 平均核苷酸一致性分析
4 討論
4.1 黏附能力評價(jià)
4.2 環(huán)境耐受性評價(jià)
4.2.1 酸耐受性評價(jià)
4.2.2 膽鹽耐受性評價(jià)
4.2.3 人工胃腸液耐受性評價(jià)
4.2.4 鹽耐受性評價(jià)
4.3 抑菌能力分析
4.3.1 發(fā)酵上清液抑菌能力分析
4.3.2 甘油發(fā)酵液抑菌能力分析
4.4 免疫相關(guān)基因表達(dá)分析
4.5 基因組特點(diǎn)分析
4.6 免疫功能基因分析
4.7 比較基因組學(xué)分析
5 結(jié)論
致謝
參考文獻(xiàn)
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]趨化因子CCL20、SDF-1在大腸癌中的表達(dá)及其與淋巴結(jié)及肝臟轉(zhuǎn)移的關(guān)系[J]. 陳志京,廖山嬰,吳伍林,賴曉嶸,林煥建. 廣東醫(yī)學(xué). 2018(17)
[2]Caco-2細(xì)胞培養(yǎng)、細(xì)胞單層模型建立的研究[J]. 雷艷青,李煥德. 臨床合理用藥雜志. 2018(20)
[3]一株羅伊氏乳桿菌的分離鑒定及其益生性能研究[J]. 杜志琳,尹望,李雪平. 飼料研究. 2017(11)
[4]嗜鉛乳酸菌JT1傳代培養(yǎng)穩(wěn)定性研究[J]. 朱鳳,都啟晶,滿兆紅,王玉燕,趙宏坤. 糧油食品科技. 2016(05)
[5]干酪乳桿菌對細(xì)菌性腸炎NF-κB通路及其介導(dǎo)的炎性介質(zhì)的影響[J]. 潘娜,王開,齊宇,伊淑帥,胡桂學(xué). 中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào). 2016(09)
[6]羅伊氏乳桿菌的益生特性及安全性分析[J]. 朱振軍,黃國宏,梁曉琳,蔡達(dá),梁愛紅,李全陽. 現(xiàn)代食品科技. 2016(06)
[7]3株羅伊氏乳桿菌生物學(xué)特性的分析比較[J]. 李文靜,梁運(yùn)祥,趙述淼. 微生物學(xué)通報(bào). 2016(05)
[8]羅伊氏乳桿菌體外抑菌和免疫調(diào)節(jié)性能的研究[J]. 池海波,李燁. 中國乳品工業(yè). 2015(12)
[9]細(xì)菌磷壁酸的免疫調(diào)控作用及與其結(jié)構(gòu)的關(guān)系[J]. 高權(quán)新,彭士明,張晨捷,姚震,張慧,施兆鴻. 動(dòng)物營養(yǎng)學(xué)報(bào). 2016(01)
[10]東北粘豆包中一株羅伊氏乳桿菌的分離、鑒定與益生性質(zhì)研究[J]. 孫大慶,李洪飛,楊健,張麗萍. 黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué)學(xué)報(bào). 2015(05)
博士論文
[1]羅伊氏乳桿菌全基因組序列分析及其調(diào)節(jié)仔豬腸黏膜免疫功能的研究[D]. 侯成立.中國農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[2]植物乳桿菌ST-Ⅲ全基因組序列分析及其對低聚果糖代謝通路的解析[D]. 陳臣.江南大學(xué) 2014
碩士論文
[1]麥芽糊精促進(jìn)Lactobacillus plantarum Lp-115膽鹽耐受性及相關(guān)酶學(xué)性質(zhì)的研究[D]. 王建琴.華東理工大學(xué) 2018
[2]2株溶血不動(dòng)桿菌全基因組測序及生物信息學(xué)分析[D]. 宋程程.天津大學(xué) 2016
[3]脂磷壁酸在植物乳桿菌免疫調(diào)節(jié)過程中的作用研究[D]. 初佳麗.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[4]豬源羅伊氏乳桿菌的篩選、特性研究及應(yīng)用[D]. 王巧麗.甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[5]產(chǎn)細(xì)菌素植物乳桿菌的初探及其應(yīng)用[D]. 王小娜.浙江工商大學(xué) 2011
[6]羅伊氏乳桿菌生物學(xué)特性及功能性發(fā)酵乳的研究[D]. 李正華.江南大學(xué) 2008
本文編號:3548654
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