發(fā)布時間：2021-11-21 09:43

　　川續(xù)斷目（Dipsacales）是被子植物的一個重要分支,多為木本植物,主要包含兩個科,49個屬,約1,090個物種,主要分布在北半球,以及南半球的部分地區(qū)。忍冬屬（Lonicera）是川續(xù)斷目下忍冬科（Caprifoliaceae）的主要組成類群,約含200個物種,包含大量的園藝觀賞性植物和藥用植物。目前對于川續(xù)斷目及忍冬屬物種的研究主要集中在生態(tài)領(lǐng)域及中藥領(lǐng)域。同時,對其物種進化關(guān)系的研究主要是利用一些分子標記序列及形態(tài)學證據(jù),并未從基因組學水平上對其物種之間的進化關(guān)系進行解釋。葉綠體基因組具有長度小,單親遺傳,核苷酸替換率低,基因和基因組結(jié)構(gòu)簡單保守等特點,是研究物種系統(tǒng)進化的重要分子工具。本研究測序組裝了十個川續(xù)斷目物種的葉綠體全基因組序列,并從Genbank中下載七種該目物種葉綠體基因組數(shù)據(jù),運用生物信息學方法對其進行比較基因組學分析,同時利用不同數(shù)據(jù)集及不同軟件構(gòu)建該目的系統(tǒng)進化關(guān)系。本研究的主要內(nèi)容及結(jié)果如下:1.十四個川續(xù)斷目物種葉綠體基因組結(jié)構(gòu)變異及系統(tǒng)進化分析組裝和注釋葉綠體基因組序列結(jié)果表明,川續(xù)斷目物種葉綠體基因組是一個四部分環(huán)狀DNA分子;六個五福花科物種葉綠... 

【文章來源】：西北大學陜西省 211工程院校

【文章頁數(shù)】：94 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

六個五�；ǹ坪桶藗�忍冬科物種葉綠體基因組圖譜

圖 2 葉綠體基因組重復序列分析（A）六個五�；ǹ莆锓N重復序列數(shù)目的直方圖分布（B）八個忍冬科物種物種重復序列數(shù)目的直方圖分布（C）六個五福花科物種重復序列不同分布的數(shù)目統(tǒng)計（D）八個忍冬科物種重復序列不同分布的數(shù)目統(tǒng)計（E）六個五�；ǹ莆锓N重復類型總數(shù)目餅圖（F）八個忍冬科物種重復類型總數(shù)目餅圖。Figure 2. Maps obtained by repeat sequence analyses.(A) Histogram showing the number of repeats in the sixAdoxaceae chloroplast genomes. (B) Histogramshowing the number of repeats in the eight Caprifoliaceae chloroplast genomes. (C) Compositions ofthe repeats in sixAdoxaceae species. (D) Compositions of the repeats in sixAdoxaceae species. (E) Piechart showing the numbers of the three repeat types inAdoxaceae. (F) Pie chart showing the numbers ofthe three repeat types in Caprifoliaceae.

20圖 3 十四種川續(xù)斷目物種葉綠體基因組 LSC, SSC, IR 邊界比較Figure3. Comparison of the border positions of LSC, SSC, and IR regions in thechloroplast genomes in six Adoxaceae species and eight Caprifoliaceae species.3.1.4 序列變異分析多個全葉綠體基因組序列的比較給我們提供了比較序列變異情況的機會。首先，

【參考文獻】：
期刊論文
[1]蕨類植物葉綠體rps4基因的適應性進化分析[J]. 張麗君,陳潔,王艇.  植物研究. 2010(01)
[2]藍靛果綠枝扦插繁殖技術(shù)的研究[J]. 林淑玲,楊利民,喬國平.  吉林農(nóng)業(yè)大學學報. 2003(04)
[3]金銀花中一個新的裂環(huán)環(huán)烯醚萜苷(英文)[J]. 李會軍,李萍,王閩川,葉文才.  中國天然藥物. 2003(03)



本文編號：3509266