素馨屬植物ISSR-PCR反應(yīng)體系的建立和優(yōu)化
發(fā)布時(shí)間:2021-10-30 16:28
為了確定素馨屬植物ISSR-PCR反應(yīng)的最佳體系,以素馨屬植物葉片為材料,采用單因素試驗(yàn)和正交試驗(yàn)設(shè)計(jì)2種方法對(duì)影響素馨屬ISSR-PCR反應(yīng)中的dNTPs、Taq DNA聚合酶、引物、模板DNA以及Mg2+ 5個(gè)因素進(jìn)行4個(gè)水平的優(yōu)化試驗(yàn),通過(guò)試驗(yàn)建立了素馨屬25μL最佳反應(yīng)體系:dNTPs濃度為0.10 mmol/L、Taq DNA聚合酶用量2.5 U、引物濃度為0.7μmol/L、模板DNA用量為2.5 ng、Mg2+濃度為1.0 mmol/L。在最佳反應(yīng)體系下,從100條ISSR引物中篩選出了8條ISSR引物,并確定了各引物的最佳退火溫度。利用29份素馨屬材料進(jìn)行最佳反應(yīng)體系的驗(yàn)證,結(jié)果表明,該優(yōu)化體系擴(kuò)增條帶清晰,穩(wěn)定性高,重復(fù)性好,表明該反應(yīng)體系適用于素馨屬植物ISSR分子標(biāo)記的研究。本研究可為素馨屬植物遺傳多樣性以及親緣關(guān)系等方面的研究提供參考依據(jù)。
【文章來(lái)源】:江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020,48(23)
【文章頁(yè)數(shù)】:9 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)材料
1.2 試驗(yàn)方法
1.2.1 供試材料DNA提取與檢測(cè)
1.2.2 ISSR-PCR反應(yīng)體系單因素篩選試驗(yàn)
1.2.3 ISSR-PCR反應(yīng)體系正交試驗(yàn)設(shè)計(jì)
1.2.4 引物及其退火溫度的篩選
1.2.5 ISSR-PCR最佳體系的驗(yàn)證
2 結(jié)果與分析
2.1 單因素試驗(yàn)優(yōu)化結(jié)果
2.1.1 dNTPs濃度對(duì)ISSR-PCR擴(kuò)增體系的影響
2.1.2 Taq DNA聚合酶用量對(duì)ISSR-PCR擴(kuò)增體系的影響
2.1.3 引物濃度對(duì)ISSR-PCR擴(kuò)增體系的影響
2.1.4 模板DNA用量對(duì)ISSR-PCR擴(kuò)增體系的影響
2.1.5 Mg2+濃度對(duì)ISSR-PCR擴(kuò)增體系的影響
2.2 正交試驗(yàn)設(shè)計(jì)瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果
2.3 正交試驗(yàn)設(shè)計(jì)瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果圖直觀評(píng)分
2.4 正交設(shè)計(jì)試驗(yàn)因素內(nèi)各處理水平對(duì)PCR擴(kuò)增結(jié)果的影響
2.4.1 dNTPs濃度對(duì)PCR擴(kuò)增體系的影響
2.4.2 Taq DNA聚合酶用量對(duì)PCR擴(kuò)增體系的影響
2.4.3 引物濃度對(duì)PCR擴(kuò)增體系的影響
2.4.4 Mg2+濃度對(duì)PCR擴(kuò)增體系的影響
2.4.5 模板DNA用量對(duì)PCR擴(kuò)增體系的影響
2.5 引物及其退火溫度的篩選
2.6 優(yōu)化后ISSR-PCR反應(yīng)體系穩(wěn)定性檢測(cè)
3 討論與結(jié)論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]茉莉花磷酸甲羥戊酸激酶基因克隆及表達(dá)分析[J]. 陳笛,王鵬杰,鄭玉成,鄭知臨,陳桂信,葉乃興. 南方農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2018(10)
[2]扭肚藤UPLC指紋圖譜建立及2種成分測(cè)定[J]. 胥愛(ài)麗,畢曉黎,劉布鳴,江潔怡,陳昭,丁平. 中成藥. 2018(03)
[3]茉莉花JsPAL2基因的克隆與表達(dá)分析[J]. 熊青,宋姣敏,崔萌,許穎妍,俞瀅,葉乃興,陳桂信. 熱帶作物學(xué)報(bào). 2018(07)
[4]采用正交設(shè)計(jì)方法優(yōu)化觀賞桃ISSR-PCR反應(yīng)體系[J]. 肖琳,曾艷玲,劉衛(wèi)東. 經(jīng)濟(jì)林研究. 2017(04)
[5]基于ISSR分子標(biāo)記的郁金香品種遺傳多樣性分析[J]. 巨秀婷,阿啟蘭,侯志強(qiáng),蔣福娟. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2017(07)
[6]基于廣西茉莉產(chǎn)業(yè)的農(nóng)業(yè)科普教育分析[J]. 周錦業(yè),宋倩,李春牛,關(guān)世凱,張自斌,卜朝陽(yáng). 熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(05)
[7]基于ISSR標(biāo)記的20種荷花品種資源遺傳多樣性分析[J]. 何天友,沈少炎,瞿印權(quán),陳凌艷,劉穎嘉,榮俊冬,鄭郁善. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(06)
[8]28份茉莉花種質(zhì)基于TRAP技術(shù)的遺傳多樣性分析[J]. 劉忠,楊波,楊玉國(guó),羅明. 分子植物育種. 2017(01)
[9]黔產(chǎn)寬葉纈草ISSR反應(yīng)體系的建立與優(yōu)化[J]. 錢志瑤,周道堂,黃秀平,周鎂,陳祖云,覃容貴. 生物技術(shù)通報(bào). 2015(07)
[10]葡萄種質(zhì)資源ISSR-PCR反應(yīng)體系的建立與優(yōu)化[J]. 代培紅,朱瑜,姚正培,李瑋璐,馬麗,羅淑萍. 南方農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2013(08)
碩士論文
[1]基于形態(tài)性狀和ISSR標(biāo)記的朱頂紅品種遺傳多樣性分析及ISSR指紋圖譜構(gòu)建[D]. 張林.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[2]武陵山區(qū)茶樹(shù)種質(zhì)資源遺傳多樣性和親緣關(guān)系的ISSR分析[D]. 盧莉.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
本文編號(hào):3467055
【文章來(lái)源】:江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2020,48(23)
【文章頁(yè)數(shù)】:9 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)材料
1.2 試驗(yàn)方法
1.2.1 供試材料DNA提取與檢測(cè)
1.2.2 ISSR-PCR反應(yīng)體系單因素篩選試驗(yàn)
1.2.3 ISSR-PCR反應(yīng)體系正交試驗(yàn)設(shè)計(jì)
1.2.4 引物及其退火溫度的篩選
1.2.5 ISSR-PCR最佳體系的驗(yàn)證
2 結(jié)果與分析
2.1 單因素試驗(yàn)優(yōu)化結(jié)果
2.1.1 dNTPs濃度對(duì)ISSR-PCR擴(kuò)增體系的影響
2.1.2 Taq DNA聚合酶用量對(duì)ISSR-PCR擴(kuò)增體系的影響
2.1.3 引物濃度對(duì)ISSR-PCR擴(kuò)增體系的影響
2.1.4 模板DNA用量對(duì)ISSR-PCR擴(kuò)增體系的影響
2.1.5 Mg2+濃度對(duì)ISSR-PCR擴(kuò)增體系的影響
2.2 正交試驗(yàn)設(shè)計(jì)瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果
2.3 正交試驗(yàn)設(shè)計(jì)瓊脂糖凝膠電泳結(jié)果圖直觀評(píng)分
2.4 正交設(shè)計(jì)試驗(yàn)因素內(nèi)各處理水平對(duì)PCR擴(kuò)增結(jié)果的影響
2.4.1 dNTPs濃度對(duì)PCR擴(kuò)增體系的影響
2.4.2 Taq DNA聚合酶用量對(duì)PCR擴(kuò)增體系的影響
2.4.3 引物濃度對(duì)PCR擴(kuò)增體系的影響
2.4.4 Mg2+濃度對(duì)PCR擴(kuò)增體系的影響
2.4.5 模板DNA用量對(duì)PCR擴(kuò)增體系的影響
2.5 引物及其退火溫度的篩選
2.6 優(yōu)化后ISSR-PCR反應(yīng)體系穩(wěn)定性檢測(cè)
3 討論與結(jié)論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]茉莉花磷酸甲羥戊酸激酶基因克隆及表達(dá)分析[J]. 陳笛,王鵬杰,鄭玉成,鄭知臨,陳桂信,葉乃興. 南方農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2018(10)
[2]扭肚藤UPLC指紋圖譜建立及2種成分測(cè)定[J]. 胥愛(ài)麗,畢曉黎,劉布鳴,江潔怡,陳昭,丁平. 中成藥. 2018(03)
[3]茉莉花JsPAL2基因的克隆與表達(dá)分析[J]. 熊青,宋姣敏,崔萌,許穎妍,俞瀅,葉乃興,陳桂信. 熱帶作物學(xué)報(bào). 2018(07)
[4]采用正交設(shè)計(jì)方法優(yōu)化觀賞桃ISSR-PCR反應(yīng)體系[J]. 肖琳,曾艷玲,劉衛(wèi)東. 經(jīng)濟(jì)林研究. 2017(04)
[5]基于ISSR分子標(biāo)記的郁金香品種遺傳多樣性分析[J]. 巨秀婷,阿啟蘭,侯志強(qiáng),蔣福娟. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2017(07)
[6]基于廣西茉莉產(chǎn)業(yè)的農(nóng)業(yè)科普教育分析[J]. 周錦業(yè),宋倩,李春牛,關(guān)世凱,張自斌,卜朝陽(yáng). 熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(05)
[7]基于ISSR標(biāo)記的20種荷花品種資源遺傳多樣性分析[J]. 何天友,沈少炎,瞿印權(quán),陳凌艷,劉穎嘉,榮俊冬,鄭郁善. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2017(06)
[8]28份茉莉花種質(zhì)基于TRAP技術(shù)的遺傳多樣性分析[J]. 劉忠,楊波,楊玉國(guó),羅明. 分子植物育種. 2017(01)
[9]黔產(chǎn)寬葉纈草ISSR反應(yīng)體系的建立與優(yōu)化[J]. 錢志瑤,周道堂,黃秀平,周鎂,陳祖云,覃容貴. 生物技術(shù)通報(bào). 2015(07)
[10]葡萄種質(zhì)資源ISSR-PCR反應(yīng)體系的建立與優(yōu)化[J]. 代培紅,朱瑜,姚正培,李瑋璐,馬麗,羅淑萍. 南方農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào). 2013(08)
碩士論文
[1]基于形態(tài)性狀和ISSR標(biāo)記的朱頂紅品種遺傳多樣性分析及ISSR指紋圖譜構(gòu)建[D]. 張林.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2012
[2]武陵山區(qū)茶樹(shù)種質(zhì)資源遺傳多樣性和親緣關(guān)系的ISSR分析[D]. 盧莉.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2009
本文編號(hào):3467055
本文鏈接:http://sikaile.net/projectlw/swxlw/3467055.html
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