東北地區(qū)中鼩鼱遺傳多樣性與分子系統(tǒng)地理學(xué)
發(fā)布時間:2021-10-29 06:01
本研究對我國東北地區(qū)3個種群(大興安嶺、小興安嶺和長白山山脈)的中鼩鼱(99個樣本)Cyt b基因全序列進(jìn)行分析,共獲得81個單倍型。整體單倍型多態(tài)性為0.9940,顯示東北地區(qū)中鼩鼱整體遺傳多樣性較高,3個種群的遺傳多樣性無明顯差異。分子變異方差分析顯示3個種群之間的分化占總分化的2.48%,種群內(nèi)采樣地的分化占總分化的0.34%,采樣地內(nèi)部遺傳分化占總分化的97.19%。遺傳分化結(jié)果顯示中鼩鼱遺傳分化與地理距離存在非正相關(guān)關(guān)系。結(jié)合GenBank下載歐亞其他地區(qū)中鼩鼱Cyt b基因全序列構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)生樹,分化為3個分支:日本北海道分布的中鼩鼱構(gòu)成1個小分支;韓國濟州島的中鼩鼱構(gòu)成1個小分支;我國東北地區(qū)和其他歐亞大陸的中鼩鼱構(gòu)成1個大分支,在這個大支上未顯現(xiàn)進(jìn)一步的遺傳分化結(jié)構(gòu)。中介網(wǎng)絡(luò)分析也暗示除日本北海道和韓國濟州島外,歐亞大陸分布的中鼩鼱沒有明顯的地理系統(tǒng)分化,表現(xiàn)出遺傳分化與地理關(guān)聯(lián)性較弱。種群歷史分析顯示東北地區(qū)中鼩鼱經(jīng)歷過種群擴張。
【文章來源】:獸類學(xué)報. 2020,40(03)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:12 頁
【部分圖文】:
中鼩鼱的單倍型中介網(wǎng)絡(luò)圖(最短樹的突變數(shù)為356).不同地理分布的樣本單倍型用不同的顏色表示.單倍型間最大突變數(shù)量和中間突變節(jié)點(紅色)被進(jìn)一步描述
對我國東北地區(qū)中鼩鼱整體中性檢測,Tajima’s D結(jié)果(D=-2.5596,P< 0.001)和Fu’s FS結(jié)果(Fs=-34.203,P< 0.001)均顯示為顯著性負(fù)值(表2),說明非中性進(jìn)化顯著,進(jìn)一步說明東北地區(qū)中鼩鼱可能經(jīng)歷過數(shù)量急劇擴張。對3個種群(大興安嶺、小興安嶺和長白山山脈種群)分別進(jìn)行Tajima’s D和Fu’s FS中性檢測,兩種檢測結(jié)果都顯示3個種群均為顯著負(fù)值(表2),說明3種群存在歷史擴張。采用錯配分布方法對種群歷史進(jìn)行檢驗,我國東北地區(qū)整體樣本序列的配對距離矩陣構(gòu)建錯配曲線是一個光滑單峰曲線(圖4),進(jìn)一步說明東北地區(qū)中鼩鼱經(jīng)歷了種群擴張。3 討論
主要采用陷阱法,輔以鋏捕法,在我國東北地區(qū)大興安嶺、小興安嶺和長白山山脈捕獲中鼩鼱標(biāo)本(地模標(biāo)本),共采集99只,其中大興安嶺山脈呼中地區(qū)(北緯51°44′14″,東經(jīng)123°40′44″)采集到25只(HZ1~HZ25)、塔河地區(qū)(北緯53°10′09″,東經(jīng)124°44′44″)2只(TH1、TH2);小興安嶺山脈鐵力地區(qū)(北緯46°59′6.68″,東經(jīng)128°02′17.70″)18只(TL1~TL18)、南岔地區(qū)(北緯47°08′16.76″,東經(jīng)129°17′1.14″)2只(NC1、NC2)、蘿北地區(qū)(北緯45°50′07″,東經(jīng)132°84′74″)9只(LB1~LB9);長白山山脈橫道河子地區(qū)(北緯44°48′44″,東經(jīng)129°02′04″)24只(HD1~HD24)、牡丹江地區(qū)(北緯44°48′48″,東經(jīng)129°04′42″)8只(MD1~MD8)、鳳凰山地區(qū)(北緯44°27′48″,東經(jīng)128°12′40″)10只(FH1~FH10)和新賓地區(qū)(北緯41°36′15″,東經(jīng)125°23′30″)1只(LN1),具體位置見圖1。采集標(biāo)本的后肢腿部肌肉組織,存放于牡丹江師范學(xué)院動植物標(biāo)本館冷凍。從GenBank下載了歐亞其他地區(qū)中鼩鼱Cyt b基因全序列,具體地理位置見圖1,序列基本信息見表1。表1 GenBank下載的中鼩鼱基因Cyt b序列Table 1 Cyt b gene sequences of S. caecutiens downloaded from GenBank 地理區(qū)域Geographical distribution 樣本采樣地*Sampling location GenBank號GenBank number 樣本號Sample number 朝鮮半島 Korea 19 AB119190; AB119191 Korea 1; Korea 2 24 AB062727;AB062728;AB062729 Korea 3-Korea 5 30 AB062725 Korea 6 韓國濟州島 Korea: Cheju Island 31 AB062721; AB062722; AB062723; AB062724;JX192946; JX192947 Cheju 1-Cheju 6 日本北海道 Japan: Hokkaido 32 AB028561; AB028560 Hokkaido 1; Hokkaido 2 俄羅斯烏蘇里地區(qū) Russia: Ussuri 18 AB028554;AB062731 Ussuri 1; Ussuri 2 22 AB119183;AB119184 Ussuri 3; Ussuri 4 23 AB062730; AB028557 Ussuri 5; Ussuri 6 28 GU929336 Ussuri 7 俄羅斯納戈爾諾 Russia: Nagorny 14 AB028548; AB119182;AB062733 Nagorny 1-Nagorny 3
本文編號:3464106
【文章來源】:獸類學(xué)報. 2020,40(03)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:12 頁
【部分圖文】:
中鼩鼱的單倍型中介網(wǎng)絡(luò)圖(最短樹的突變數(shù)為356).不同地理分布的樣本單倍型用不同的顏色表示.單倍型間最大突變數(shù)量和中間突變節(jié)點(紅色)被進(jìn)一步描述
對我國東北地區(qū)中鼩鼱整體中性檢測,Tajima’s D結(jié)果(D=-2.5596,P< 0.001)和Fu’s FS結(jié)果(Fs=-34.203,P< 0.001)均顯示為顯著性負(fù)值(表2),說明非中性進(jìn)化顯著,進(jìn)一步說明東北地區(qū)中鼩鼱可能經(jīng)歷過數(shù)量急劇擴張。對3個種群(大興安嶺、小興安嶺和長白山山脈種群)分別進(jìn)行Tajima’s D和Fu’s FS中性檢測,兩種檢測結(jié)果都顯示3個種群均為顯著負(fù)值(表2),說明3種群存在歷史擴張。采用錯配分布方法對種群歷史進(jìn)行檢驗,我國東北地區(qū)整體樣本序列的配對距離矩陣構(gòu)建錯配曲線是一個光滑單峰曲線(圖4),進(jìn)一步說明東北地區(qū)中鼩鼱經(jīng)歷了種群擴張。3 討論
主要采用陷阱法,輔以鋏捕法,在我國東北地區(qū)大興安嶺、小興安嶺和長白山山脈捕獲中鼩鼱標(biāo)本(地模標(biāo)本),共采集99只,其中大興安嶺山脈呼中地區(qū)(北緯51°44′14″,東經(jīng)123°40′44″)采集到25只(HZ1~HZ25)、塔河地區(qū)(北緯53°10′09″,東經(jīng)124°44′44″)2只(TH1、TH2);小興安嶺山脈鐵力地區(qū)(北緯46°59′6.68″,東經(jīng)128°02′17.70″)18只(TL1~TL18)、南岔地區(qū)(北緯47°08′16.76″,東經(jīng)129°17′1.14″)2只(NC1、NC2)、蘿北地區(qū)(北緯45°50′07″,東經(jīng)132°84′74″)9只(LB1~LB9);長白山山脈橫道河子地區(qū)(北緯44°48′44″,東經(jīng)129°02′04″)24只(HD1~HD24)、牡丹江地區(qū)(北緯44°48′48″,東經(jīng)129°04′42″)8只(MD1~MD8)、鳳凰山地區(qū)(北緯44°27′48″,東經(jīng)128°12′40″)10只(FH1~FH10)和新賓地區(qū)(北緯41°36′15″,東經(jīng)125°23′30″)1只(LN1),具體位置見圖1。采集標(biāo)本的后肢腿部肌肉組織,存放于牡丹江師范學(xué)院動植物標(biāo)本館冷凍。從GenBank下載了歐亞其他地區(qū)中鼩鼱Cyt b基因全序列,具體地理位置見圖1,序列基本信息見表1。表1 GenBank下載的中鼩鼱基因Cyt b序列Table 1 Cyt b gene sequences of S. caecutiens downloaded from GenBank 地理區(qū)域Geographical distribution 樣本采樣地*Sampling location GenBank號GenBank number 樣本號Sample number 朝鮮半島 Korea 19 AB119190; AB119191 Korea 1; Korea 2 24 AB062727;AB062728;AB062729 Korea 3-Korea 5 30 AB062725 Korea 6 韓國濟州島 Korea: Cheju Island 31 AB062721; AB062722; AB062723; AB062724;JX192946; JX192947 Cheju 1-Cheju 6 日本北海道 Japan: Hokkaido 32 AB028561; AB028560 Hokkaido 1; Hokkaido 2 俄羅斯烏蘇里地區(qū) Russia: Ussuri 18 AB028554;AB062731 Ussuri 1; Ussuri 2 22 AB119183;AB119184 Ussuri 3; Ussuri 4 23 AB062730; AB028557 Ussuri 5; Ussuri 6 28 GU929336 Ussuri 7 俄羅斯納戈爾諾 Russia: Nagorny 14 AB028548; AB119182;AB062733 Nagorny 1-Nagorny 3
本文編號:3464106
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