殼斗目栗屬植物比較葉綠體基因組與系統(tǒng)發(fā)育研究
發(fā)布時(shí)間:2021-10-28 19:25
栗屬(Castanea Mill)是隸屬于殼斗目殼斗科(Fagaceae)的重要經(jīng)濟(jì)樹種。中國栗屬物種因其良好的抗病特征在世界栗屬植物中占據(jù)重要地位。目前,對(duì)栗屬植物的研究主要集中在形態(tài)學(xué)和遺傳多樣性方面的研究,對(duì)栗屬植物和殼斗科植物的葉綠體序列的比較基因組學(xué)研究有助于增進(jìn)栗屬植物起源進(jìn)化、系統(tǒng)分類及基因組學(xué)多樣性等方面研究,并為更深入了解認(rèn)識(shí)和利用殼斗科植物。葉綠體基因組是研究物種進(jìn)化和重建被子植物系統(tǒng)關(guān)系的傳統(tǒng)方法之一,而在此類分析中的頻繁使用葉綠體基因組是基于其單親遺傳的簡單保守結(jié)構(gòu):通過母系的單親遺傳。在本研究中利用高通量二代測序技術(shù)對(duì)中國特有的栗屬植物中國板栗(Castanea mollissima)、茅栗(C.seguinii)、錐栗(C.henryi)進(jìn)行葉綠體基因組測序、組裝與注釋。同時(shí)對(duì)前期NCBI Gen Bank數(shù)據(jù)庫已公布的栗屬葉綠體基因組序列進(jìn)行下載。利用現(xiàn)今快速發(fā)展的生物信息學(xué)方法對(duì)所選序列進(jìn)行基因組特征、遺傳變異、分子標(biāo)記開發(fā)、系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系及選擇基因位點(diǎn)等比較基因組學(xué)分析研究。研究結(jié)果將對(duì)世界栗屬植物以及殼斗目的葉綠體基因組提供更多有價(jià)值基礎(chǔ)數(shù)據(jù)和依據(jù)。主...
【文章來源】:西北大學(xué)陜西省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:151 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
中國栗屬植物物種分布圖
性,各國的大多數(shù)學(xué)者認(rèn)為是在中國大陸[Janicketal,1975.Mooreetal,1990.Huangetal,1994.Casasolietal,2001.],但是很長時(shí)間沒有直接的科學(xué)證據(jù),板栗的遺傳多樣性和基因流大于已知的板栗植物[Daneetal,2003]。因此,充分對(duì)栗屬植物的信息進(jìn)行挖掘,是對(duì)我國栗屬資源多樣性的保護(hù)、發(fā)展和進(jìn)一步開發(fā)利用提供可能。圖1-1中國栗屬植物物種分布圖(引自中國國家標(biāo)本資源平臺(tái)http://www.nsii.org.cn/2017/home.php)Figure1-1ThedistributionofCastaneaspeciesinChina(QuotedfromtheChineseNationalSpecimenResourcePlatform)圖1-2世界栗屬植物物種分布圖2
Figure1-2ThedistributionofCastaneaspeciesintheworld殼斗科(Fagaceae)隸屬于殼斗目(Fagales),除熱帶部分地區(qū)非洲和南非等地幾乎遍布世界各地,是亞熱帶常綠闊葉林的主要樹種。我國分布的殼斗科有7個(gè)屬,即栗屬(Castanea)、錐屬(或栲屬)(Castanopsis)、青岡屬(Cyclobalanopsis)、水青岡屬(Fagus)、柯屬(Lithocarpus)、櫟屬(或石櫟屬)(Quercus)、三棱櫟屬(Trigonobalanus),共約320個(gè)種,其中特有種164種[Huangetal,1999]。在我國的分布范圍除新疆外,其他區(qū)域均有分布,而在我國的云南、廣西、廣東分布尤為豐饒,以這些地區(qū)為中心擴(kuò)散周邊地區(qū)分布逐漸減少。因此,根據(jù)之前的研究,普遍認(rèn)為在我國西南地區(qū)的云南、四川、廣西、貴州等地是中國殼斗科現(xiàn)代分布的中心[劉松茂等,1998.邱麗氚等,2016.邱麗氚等,2017.邱麗氚等,2018.]。圖1-3中國殼斗科植物屬種分布圖(引自吳曉湲,2017)Figure1-3ThedistributionofgeneraandspeciesofFagaceaeinChina殼斗科中栗屬和錐屬多數(shù)物種的種子自古被視為木本糧食。其中含鞣質(zhì)較高的種類在經(jīng)過加工過后可作為備荒食糧、飼料或是釀造原料[參考文獻(xiàn)]。青岡屬和柯屬木材結(jié)3
本文編號(hào):3463234
【文章來源】:西北大學(xué)陜西省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:151 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
中國栗屬植物物種分布圖
性,各國的大多數(shù)學(xué)者認(rèn)為是在中國大陸[Janicketal,1975.Mooreetal,1990.Huangetal,1994.Casasolietal,2001.],但是很長時(shí)間沒有直接的科學(xué)證據(jù),板栗的遺傳多樣性和基因流大于已知的板栗植物[Daneetal,2003]。因此,充分對(duì)栗屬植物的信息進(jìn)行挖掘,是對(duì)我國栗屬資源多樣性的保護(hù)、發(fā)展和進(jìn)一步開發(fā)利用提供可能。圖1-1中國栗屬植物物種分布圖(引自中國國家標(biāo)本資源平臺(tái)http://www.nsii.org.cn/2017/home.php)Figure1-1ThedistributionofCastaneaspeciesinChina(QuotedfromtheChineseNationalSpecimenResourcePlatform)圖1-2世界栗屬植物物種分布圖2
Figure1-2ThedistributionofCastaneaspeciesintheworld殼斗科(Fagaceae)隸屬于殼斗目(Fagales),除熱帶部分地區(qū)非洲和南非等地幾乎遍布世界各地,是亞熱帶常綠闊葉林的主要樹種。我國分布的殼斗科有7個(gè)屬,即栗屬(Castanea)、錐屬(或栲屬)(Castanopsis)、青岡屬(Cyclobalanopsis)、水青岡屬(Fagus)、柯屬(Lithocarpus)、櫟屬(或石櫟屬)(Quercus)、三棱櫟屬(Trigonobalanus),共約320個(gè)種,其中特有種164種[Huangetal,1999]。在我國的分布范圍除新疆外,其他區(qū)域均有分布,而在我國的云南、廣西、廣東分布尤為豐饒,以這些地區(qū)為中心擴(kuò)散周邊地區(qū)分布逐漸減少。因此,根據(jù)之前的研究,普遍認(rèn)為在我國西南地區(qū)的云南、四川、廣西、貴州等地是中國殼斗科現(xiàn)代分布的中心[劉松茂等,1998.邱麗氚等,2016.邱麗氚等,2017.邱麗氚等,2018.]。圖1-3中國殼斗科植物屬種分布圖(引自吳曉湲,2017)Figure1-3ThedistributionofgeneraandspeciesofFagaceaeinChina殼斗科中栗屬和錐屬多數(shù)物種的種子自古被視為木本糧食。其中含鞣質(zhì)較高的種類在經(jīng)過加工過后可作為備荒食糧、飼料或是釀造原料[參考文獻(xiàn)]。青岡屬和柯屬木材結(jié)3
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