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穿山甲新型瘟病毒與Colti病毒的鑒定及基因組特征研究

發(fā)布時(shí)間:2021-10-22 01:52
  野生動(dòng)物非法貿(mào)易是全球最嚴(yán)重的暴利犯罪活動(dòng)之一,不但嚴(yán)重破壞生物多樣性及生態(tài)環(huán)境,同時(shí)走私運(yùn)輸也是新發(fā)和再發(fā)傳染病重要的傳播途徑,嚴(yán)重威脅人類社會的公共衛(wèi)生安全。雖然存在極大的生物安全風(fēng)險(xiǎn),但是這類非法走私的野生動(dòng)物所攜帶病原體的相關(guān)研究卻極其有限。穿山甲是全球被走私數(shù)量最多的哺乳動(dòng)物,是全球野生動(dòng)物非法貿(mào)易的代表性物種。由于一些傳統(tǒng)的“食補(bǔ)”觀念及中醫(yī)藥材的需求,我國是大部分穿山甲走私的目的地。伴隨著穿山甲的非法走私運(yùn)輸,其攜帶的病原體也會隨之輸入我國。在2018年7月-8月期間,浙江省金華市野生動(dòng)物保護(hù)站救助了四只穿山甲(3只馬來穿山甲,1只中華穿山甲)。這四只穿山甲在被救助后不久均出現(xiàn)了拒食等表現(xiàn)不一的臨床癥狀。在野生動(dòng)物保護(hù)站工作人員的悉心照顧和對癥治療下,其中1只中華穿山甲病情逐漸好轉(zhuǎn)。然而剩余的3只馬來穿山甲治療效果不佳,并在救助后的半個(gè)月時(shí)間相繼死去。為了查找引起這四只穿山甲疾病的病原體,我們對這四只穿山甲的樣本進(jìn)行了核酸(RNA)提取和轉(zhuǎn)錄組文庫構(gòu)建。通過宏轉(zhuǎn)錄組測序、生物信息分析并結(jié)合反轉(zhuǎn)錄PCR(RT-PCR)的方法,在兩只死亡的馬來穿山甲(分布編號為1-Dongy... 

【文章來源】:中國疾病預(yù)防控制中心北京市

【文章頁數(shù)】:77 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

穿山甲新型瘟病毒與Colti病毒的鑒定及基因組特征研究


圖4-2.2-Lishui穿山甲胸片檢查結(jié)果,在左肺中觀察到大面積陰影

穿山甲,病理,箭頭


?穿山甲新型瘟病毒與Colti病毒的鑒定及基因組特征研究???1-Dongyang?2-Lishui??,i?*B,??“丨■??如爨??圖4-3?死亡穿山甲l-Dongyang和2-Lishui的組織病理分析結(jié)果(><200)。出血(綠色??箭頭);壞死(藍(lán)色箭頭)?,細(xì)胞核固縮(黃色箭頭);膠原纖維變性(黑色箭頭)。??Figure?4-3.?Pathologic?changes?of?dead?pangolins?1?-Dongyang?and?2-Lishui.?Bleeding?(green??arrows);?Necrosis?(blue?arrows);?Pyknotic?nucleus?(yellow?arrows);?Collagen?fiber?degeneration??(black?arrows).??24??

基因組,片段,密碼子


CWP??CTFV?AAGGGCUGCUGUUGACGGUGUUGGCCU??KGCC?*?R?CWP??EYAV?AAGGGUUGUUGU?UGACGGUGUUGGCCU??RGCC?*?R?GWP??TFRV?CGAGGCUGUUGUUGACGGGGUUGGCCU??RGCC?*?R?CWP??TarTV?AGAGGGUGUUGU?UGACGGUGUUGGCCU??KllNfW?RGCC?*?RCWP??AGAGGAUGCUGU?UGACGGUGUUGGCCU??圖4-7.?LSPV基因組特征。(a)使用Weblogo分析和可視化LSPV基因組片段中5’和??3’末端保守的10個(gè)核苷酸序列。(b)?LSPV和己知的Colti病毒片段9中間的終止密碼子??周圍的序列信息。??Figure?4-7.?Characteristics?of?the?LSPV?genome,?(a)?Sequence?conservation?of?the?55-?and??3’-terminal?10?nucleotides?in?genomic?segments?of?the?LSPV?genome?were?analyzed?and??visualized?using?Weblogo.?(b)?Sequence?information?around?the?stop?codon?of?segment?VP9?of??LSPV?and?known?coltivirus.??35??


本文編號:3450148

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