大腸桿菌sRNA EsrE的轉錄調控研究
發(fā)布時間：2021-10-13 03:23
大腸桿菌sRNA EsrE可以維持細胞在有氧條件下的正常生長,固體平板上的生長形態(tài)以及對不同抗生素的敏感性等多種表型,并且參與輔酶Q8的合成。實驗室前期對于esrE基因的轉錄調控進行了初步的探索,識別多個順式調控元件,并在此基礎上篩選得到54種潛在的轉錄調控因子,本研究主體內容是驗證潛在轉錄調控因子對EsrE調控功能并明確其調控機制。研究中首先完善了實驗室前期構建的雙質粒報告基因（lacZ）系統(tǒng),并利用該系統(tǒng)逐一驗證了潛在轉錄調控因子的調控功能,研究結果表明FabZ與RpoH可以調控EsrE的轉錄。FabZ為脂肪酸生物合成中的β-羥酰-ACP脫水酶,雙質粒系統(tǒng)表明其可下調EsrE的轉錄,進一步的凝膠阻滯實驗分析發(fā)現(xiàn),其不能直接和EsrE啟動子區(qū)域的DNA片段結合,即其不具有DNA結合活性,故關于FabZ如何精確調控EsrE的轉錄還有待研究。RpoH為RNA聚合酶的σ亞基,雙質粒系統(tǒng)的實驗結果表明RpoH能上調EsrE的轉錄,而凝膠阻滯實驗分析發(fā)現(xiàn),該蛋白在RNA聚合酶核心酶的協(xié)同作用下能直接和EsrE啟動子區(qū)域的DNA片段結合,即RpoH能以RNA聚合酶σ亞基形式啟動EsrE的轉錄�；�...
【文章來源】：華東理工大學上海市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】：77 頁
【學位級別】：碩士
【部分圖文】：
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ｓｓ?ＩＩ）相互作用來發(fā)揮調控功能［氣然而大腸桿菌體內ＲＮＡ聚合酶頻繁“奔??波”于各轉錄調控因子之間，啟動不同基因的轉錄，所以為提髙兩者的作用效率，兩者??蛋白－蛋白相互作用力通常相對微弱，另外，可以通過提高靶基因啟動子周圍轉錄調控??因子的濃度促進轉錄調控因子與ＲＮＡ聚合酶的結合。除此之外，大約２０－３０種轉錄調??控因子直接結合ＲＮＡ聚合酶（ｃｌａｓｓ?ＩＩＩ和ｃｌａｓｓ?ＩＶ）。這種轉錄調控因子通常與ｐ或者Ｐ’??亞基結合，即使在延伸過程中也可以控制ｍＲＮＡ的衰減、延伸和終止（圖１．４）。??＜〇％２ＳＳ？?１；??Ｆ？ｄ?ｆａｃｔｏｒ＊?ｊ￡＇?．??梅Ｂ■■費＆??Ｃｏｒ？?？ｎｚｙｍ＊?Ｍｏ＊ｏｗ？ｙｍ？?＊？?ｒ?ｆＫｔ〇??—ｉＷｆｆｉｌ?ＩＭ．Ｍ—ｍｉｗ??圖１．４大腸桿菌ＲＮＡ聚合酶的功能分化??Ｆｉｇ．?１．４?Ｆｕｎｃｔｉｏｎａｌ?ｄｉｆｆｅｒｅｎｔｉａｔｉｏｎ?ｏｉＥｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ?ｃｏｌｉ?ＲＮＡ?ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ??ＤＮＡ結合型轉錄調控因子一般由兩個結構域組成，一是功能域，另一是ＤＮＡ結合??域。在原核生物中，ＨＴＨ?（ｈｅｌｉｘ－ｔｕｍ－ｈｅｌｉｘ）結構是調控因子ＤＮＡ結合域中最常見的形??式。??根據(jù)作用效果的不同，轉錄調控因子一般分為轉錄激活因子和轉錄抑制因子。其中，??對于轉錄抑制因子而言，當細胞中誘導物不存在時，其可以與調控序列結合，使周圍的??啟動子不能啟動基因轉錄；當存在誘導物，誘導物與抑制因子結合，使其從靶ＤＮＡ區(qū)??域脫離，啟動子的轉錄活性恢復。相比之下，轉錄激活因子需要效應配體的參與才能完??
華東理工大學碩士學位論文?第７頁??Ａ１７８－２０１?Ｕ４５Ｐ??［ｒｐｏＨｌ６２）??Ｄ１７９Ｇ?、?Ｗ２４４Ｒ、?Ｕ２７０Ｒ??（ｒｐｏＨＩＩＩ）?｛ｔｐｏＨｉｅｎ?（ｒｐｏＨ１￥３）??Ｆ１３８Ｌ?Ｌ１６１Ｐ?＼?Ｒ２４３Ｃ?＼?Ｌ２Ｔ８Ｗ??０ｐｏＨ１７＾｛ｒｐｏＨ１Ｂ２）?（ｒｐｏＨ１７４）?（ｒｐｔ＾１１２）??ｉ?■ｉｘＷＫ／ｉ?ｐｓＡ＾Ｆ＾ｖｓｎ??１．２?２．１?２．２?２．３?２．４?￣Ｔ￣?３．１?３．２?４．１?４．２??ＲｐｏＨ?ｂｏｘ??圖１．５?ａ３２的保守區(qū)域示意圖??Ｆｉｇ．?１．５?Ｓｃｈｅｍａｔｉｃ?ｄｉａｇｒａｍ?ｏｆ?ｔｈｅ?ｃｏｎｓｅｒｖｅｄ?ｒｅｇｉｏｎｓ?ｏｆ?ａ３２??１．３．１?ａ３２轉錄調控??基因ｒｐｏ／／的調控是非常復雜的，包括三個層面：轉錄、翻譯及翻譯后修飾［３２，３３］。??從轉錄水平而言，ｒｐｏ／／編碼基因上游５種啟動子（Ｐｌ，Ｐ３－Ｐ６）可以被不同的ｃｒ識別并??受到多種操縱子的調控（圖１．６），其中Ｐ４和Ｐ５由ａ７Ｇ轉錄，Ｐ３和Ｐ６可以結合ａ２４和ａ５４，??然而Ｐ１可以根據(jù)生長期選擇ａ７Ｑ或ａｓ介導轉錄［３４＾］，另外，Ｐ６啟動子對代謝產(chǎn)物敏感且??其轉錄依賴于胞內ｃＡＭＰ的水平和ＣＲＰ催化劑［３７ｌｃＡＭＰ－ＣＲＰ與ＣｙｔＲ抗催化劑形成復??合結構從而掩蓋Ｐ３、Ｐ４和Ｐ５［４１］。同樣地，涉及起始染色體ＤＮＡ復制的ＤＮＡ結合蛋??白ＤｎａＡ，通過抑制Ｐ３和Ｐ４的轉錄參與調控的轉錄（圖１．６）?［４２］。這些效應因子??和轉錄調控因子響應各種環(huán)境信號和狀況，調控ｒｐｏ／／的轉錄，并且在壓力反應中有廣??泛的適用性。??（ｃ＾Ｒ）??
【參考文獻】：
期刊論文
[1]大腸桿菌yigP基因轉錄調控序列的鑒定[J]. 汪屹,葉江,張惠展. 微生物學報. 2012(05)
[2]Fat poetry: a kingdom for PPARγ[J]. Silvia I Anghel,Walter Wahli. Cell Research. 2007(06)
本文編號：3433860
【文章來源】：華東理工大學上海市 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】：77 頁
【學位級別】：碩士
【部分圖文】：
圖１．２?ｈＷ■／推測功能示意圖ｌ１７ｌ??Ｆｉｇ．?１．２?ｐｒｏｐｏｓｅｄ?ｆｕｎｃｔｉｏｎ?ｏｆ?ｔｈｅ?ｕｂｉＪ?ｌｏｃｕｓ１１７１????ｕｈｉＪ?６０６?ｂｐ????
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華東理工大學碩士學位論文?第７頁??Ａ１７８－２０１?Ｕ４５Ｐ??［ｒｐｏＨｌ６２）??Ｄ１７９Ｇ?、?Ｗ２４４Ｒ、?Ｕ２７０Ｒ??（ｒｐｏＨＩＩＩ）?｛ｔｐｏＨｉｅｎ?（ｒｐｏＨ１￥３）??Ｆ１３８Ｌ?Ｌ１６１Ｐ?＼?Ｒ２４３Ｃ?＼?Ｌ２Ｔ８Ｗ??０ｐｏＨ１７＾｛ｒｐｏＨ１Ｂ２）?（ｒｐｏＨ１７４）?（ｒｐｔ＾１１２）??ｉ?■ｉｘＷＫ／ｉ?ｐｓＡ＾Ｆ＾ｖｓｎ??１．２?２．１?２．２?２．３?２．４?￣Ｔ￣?３．１?３．２?４．１?４．２??ＲｐｏＨ?ｂｏｘ??圖１．５?ａ３２的保守區(qū)域示意圖??Ｆｉｇ．?１．５?Ｓｃｈｅｍａｔｉｃ?ｄｉａｇｒａｍ?ｏｆ?ｔｈｅ?ｃｏｎｓｅｒｖｅｄ?ｒｅｇｉｏｎｓ?ｏｆ?ａ３２??１．３．１?ａ３２轉錄調控??基因ｒｐｏ／／的調控是非常復雜的，包括三個層面：轉錄、翻譯及翻譯后修飾［３２，３３］。??從轉錄水平而言，ｒｐｏ／／編碼基因上游５種啟動子（Ｐｌ，Ｐ３－Ｐ６）可以被不同的ｃｒ識別并??受到多種操縱子的調控（圖１．６），其中Ｐ４和Ｐ５由ａ７Ｇ轉錄，Ｐ３和Ｐ６可以結合ａ２４和ａ５４，??然而Ｐ１可以根據(jù)生長期選擇ａ７Ｑ或ａｓ介導轉錄［３４＾］，另外，Ｐ６啟動子對代謝產(chǎn)物敏感且??其轉錄依賴于胞內ｃＡＭＰ的水平和ＣＲＰ催化劑［３７ｌｃＡＭＰ－ＣＲＰ與ＣｙｔＲ抗催化劑形成復??合結構從而掩蓋Ｐ３、Ｐ４和Ｐ５［４１］。同樣地，涉及起始染色體ＤＮＡ復制的ＤＮＡ結合蛋??白ＤｎａＡ，通過抑制Ｐ３和Ｐ４的轉錄參與調控的轉錄（圖１．６）?［４２］。這些效應因子??和轉錄調控因子響應各種環(huán)境信號和狀況，調控ｒｐｏ／／的轉錄，并且在壓力反應中有廣??泛的適用性。??（ｃ＾Ｒ）??
【參考文獻】：
期刊論文
[1]大腸桿菌yigP基因轉錄調控序列的鑒定[J]. 汪屹,葉江,張惠展. 微生物學報. 2012(05)
[2]Fat poetry: a kingdom for PPARγ[J]. Silvia I Anghel,Walter Wahli. Cell Research. 2007(06)
本文編號：3433860
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