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多功能SAM依賴性酶LepI和海棲熱袍菌乙酰羥酸合酶的結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究

發(fā)布時間:2021-09-30 16:24
  酶是生命體必不可少的重要物質(zhì),為生物體內(nèi)發(fā)生多種催化反應(yīng)提供了重要保障。隨著深入的探究,生物酶在生產(chǎn)生活中的應(yīng)用越來越重要。周環(huán)反應(yīng)在工業(yè)合成中應(yīng)用廣泛,但能夠催化周環(huán)反應(yīng)的酶很少,目前已報道了黃曲霉中有具有相似活性的酶,對其進行探究將為工業(yè)生產(chǎn)提供重要價值。極端環(huán)境下嗜熱菌的典型生物海棲熱袍菌在合成生物學(xué)中的應(yīng)用越來越廣泛,而對于其乙酰羥酸合酶的研究將為支鏈氨基酸生產(chǎn)提供新的方向。本文開展了對兩種重要酶的結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究,首先是黃曲霉生物合成leporinB途徑中生成吡喃環(huán)的關(guān)鍵酶——多功能SAM依賴性酶LepI。我們通過構(gòu)建重組質(zhì)粒并且進行表達純化,得到純度高、均一性好的蛋白后進行結(jié)晶實驗,在篩選了 768個池液條件后,發(fā)現(xiàn)有晶體生長。對相關(guān)的結(jié)晶條件進行優(yōu)化,通過X-射線衍射收集有效的衍射數(shù)據(jù)。在沒有同源結(jié)構(gòu)的情況下,通過對硒代蛋白進行表達純化和結(jié)晶實驗,收集到硒代晶體的衍射數(shù)據(jù)后成功解析LepI的蛋白結(jié)構(gòu)。隨后通過結(jié)構(gòu)分析,序列比對和分子對接實驗提出了LepI的催化機理。本文研究的另一個酶是海棲熱袍菌的乙酰羥酸合酶,乙酰羥酸合酶是生物合成支鏈氨基酸過程中的第一個限速酶,該酶由兩個... 

【文章來源】:北京化工大學(xué)北京市 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:83 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

多功能SAM依賴性酶LepI和海棲熱袍菌乙酰羥酸合酶的結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究


圖1-]?LeporinB的部分合成途徑t16]??Figure?1-1?Part?of?the?synthesis?pathway?of?Leporin?B[16]??

示意圖,樣品,示意圖,蛋白


適當(dāng)延長時間,有的膠濃度較高電流可能過高可以適當(dāng)??降低電壓。??膠的染脫色:結(jié)束后,拆掉膠板,用考馬斯染色,微波爐加熱2?min,靜置??一會,重復(fù)2-3次可以使染色效果更好。隨后用脫色液脫色,此過程也可以用??微波爐加熱,與染色過程相同,能從膠上看到條帶時可先初步了解蛋白表達純??化的情況,更換脫色液繼續(xù)脫色,即可得到清晰明了的膠結(jié)果。??NI?I?S?P?BAW?E?BAE?M??mmm????1?.?'??mm,:??'?參?:f??w?、?*?-爲(wèi)’/??圖2-2?SDS-PAGE示意圖??Figure?2-2?SDS-PAGE?schematic??如圖2-2所示,對圖中樣品說明:NI表示誘導(dǎo)前,I表示誘導(dǎo)后,S表示破??胞高速離心后的上清,P表示破胞高速離心后的沉淀,BAW表示洗雜結(jié)束后的??Beads,?E表示洗脫的蛋白,BAE表示洗脫完成后的beads。從圖上NI和I對比??可以明顯的看到有一條帶在誘導(dǎo)后出現(xiàn)了,在S中也有,說明目的蛋白成功表達??且是可溶性蛋白;同時在鎳柱上大量掛柱,經(jīng)過洗雜蛋白純度也有所提高,并??且能夠被洗脫下來,雖然BAE上有少量蛋白殘留,但是絕大多數(shù)蛋白都被很好??的洗脫了。??2.?3蛋白質(zhì)結(jié)晶實驗??21??

標(biāo)簽,分子量,氨基酸,蛋白


?^^35?|::雜? ̄?GST??;響.:暴;.,,??|。鄭,?i???S??聲??_9???16?1J?18?19_20,??^?n??????"仏 ̄*■**?Cond??Fraction??A??./?—L?丄?L?L?L?k?L?j:?b?g?k.L?fc?L,?k?L?h?Uf;l?????t?,?>?>?*?t?<?t?????io?ii?u?u?m?it?w?ii?ie?it???2i?a??圖3-1?LepI少量表達純化結(jié)果??Figure?3-1?The?test?results?of?LepI??LepI的氨基酸數(shù)為1-387分子量約為43?KDa,GST標(biāo)簽大小在26?KDa。??從帶GST標(biāo)簽的LepI試表達的蛋白膠圖3-1?a上可以明顯的看到誘后樣品I中??有蛋白被誘導(dǎo)出來,且在后續(xù)的純化過程中洗雜結(jié)束后的親和層析柱上也明顯??富集了這個蛋白,和蛋白Marker?qū)Ρ劝l(fā)現(xiàn)蛋白在60-80?KDa之間,和帶GST??標(biāo)簽的LepI基本相符。一般用來做結(jié)晶實驗的蛋白會切掉GST標(biāo)簽,防止標(biāo)??簽過大影響蛋白結(jié)晶。在經(jīng)過PP酶酶切后跑膠,從膠圖3-lb上E和BAW對??比可以看到蛋白切掉標(biāo)簽后大小發(fā)生了明顯的變化,在洗脫后的層析柱樣品中??有三個蛋白,從上到下依次是是少量沒有切掉標(biāo)簽的LepI,PP酶或者未洗脫完??全的LepI?(二者分子量相近,在膠圖上不能完全分開),GST標(biāo)簽。將酶切后??30??


本文編號:3416239

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