蜱是一種可以傳播多種病原體的節(jié)肢動物,蟲媒病毒（arboviruses）包括蜱傳病毒（Tick-borne viruses,TBVs）,它們在自然界中通過媒介蜱和宿主動物之間循環(huán)而持續(xù)存在。分子生物學(xué)技術(shù)的發(fā)展日新月異,不斷發(fā)現(xiàn)新蜱傳病毒。負(fù)鏈RNA病毒宿主范圍廣泛,包括植物、節(jié)肢動物、哺乳動物等,因此既會對人類造成疾病又能對畜牧業(yè)和農(nóng)業(yè)造成損失。近年來,科學(xué)家們發(fā)現(xiàn)了很多新的負(fù)鏈RNA病毒,但由于未能獲得其分離株進(jìn)而缺乏進(jìn)一步的研究。本研究選取2018年我國黑龍江省五個采集點(diǎn)采集的游離全溝硬蜱77只,提取核酸后基于第二代測序技術(shù),探索荊楚病毒目（Jingchuvirales）與單股負(fù)鏈RNA病毒目（Mononegavirales）的新蜱傳病毒并分析進(jìn)化地位。檢測出了Ixodes persulcatus mononegavirales-like virus HLJ、Ixodes persulcatus chuvirus HLJ、Ixodes persulcatus dimarhabdovirus HLJ三種新病毒。發(fā)現(xiàn)Ixodes persulcatus mononegavirales... 

【文章來源】：軍事科學(xué)院北京市

【文章頁數(shù)】：69 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

018年黑龍江全溝硬蜱采集點(diǎn)

軍事科學(xué)院碩士學(xué)位論文第14頁圖1.2瓊脂糖凝膠電泳檢測結(jié)果圖2.3上機(jī)測序質(zhì)量分析結(jié)果測序完成后，本次測序RNA樣本Barcode編號分別為1-9，共生成72Gb的數(shù)據(jù)，ISPLoading為69%，說明此次上機(jī)69%的芯片得到覆蓋。2.4序列結(jié)果分析我們采集的全溝硬蜱RNA樣本共建立了9個RNA文庫，總共生成了72Gb的數(shù)據(jù)。通過對產(chǎn)生數(shù)據(jù)進(jìn)行組裝、質(zhì)量過濾、去除宿主基因、比對、驗(yàn)證，對其中存在的Jingchuvirales與Mononegavirales進(jìn)行篩選，我們共發(fā)現(xiàn)了3種新病毒，分別暫命名為Ixodespersulcatusmononegavirales-likevirusHLJ、IxodespersulcatuschuvirusHLJ、IxodespersulcatusdimarhabdovirusHLJ，基因組長度分別為10865、10365、11440個核苷酸，且預(yù)測均可編碼4個orf。

軍事科學(xué)院碩士學(xué)位論文 2.5 病毒進(jìn)化分析 通過基于對 RdRp 蛋白進(jìn)行進(jìn)化分析，通過結(jié)果可以發(fā)現(xiàn)，不同亞枝上形成了不同的病毒群，發(fā)現(xiàn) Ixodes persulcatus mononegavirales-like virus HLJ 屬于未分類的 Mononegavirales，與中國黑龍江省報道的 Deer tick mononegavirales virus 病毒關(guān)系更為密切。Ixodes persulcatus chuvirus HLJ 屬于 Jingchuvirales，與 Hubei chuvirus-like virus 3 、 Wuhan Mosquito 8 親緣關(guān)系最近。 Ixodes persulcatus dimarhabdovirus HLJ 屬于彈狀病毒科，有意思的是，屬于 Jingchuvirales 的 Ixodes persulcatus chuvirus HLJ 在進(jìn)化樹中位于 Mononegavirales 之間。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]新疆中哈邊境地區(qū)分離到遠(yuǎn)東型和西伯利亞型蜱傳腦炎病毒[J]. 張桂林,孫響,劉然,鄭重,劉曉明,伊小平.  中國人獸共患病學(xué)報. 2017(04)



本文編號：3413635