小鼠下丘腦和海馬組織神經(jīng)干細(xì)胞的蛋白質(zhì)組學(xué)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-09-27 23:28
目的:采用蛋白質(zhì)組學(xué)法探討C57BL/6J小鼠下丘腦和海馬組織中神經(jīng)干細(xì)胞(NSCs)中蛋白質(zhì)表達(dá)差異,闡明不同來源(區(qū)域) NSCs中蛋白表達(dá)譜不同的原因,為下丘腦和海馬組織NSCs的基礎(chǔ)研究和移植治療提供參考。方法:提取出生24 h內(nèi)C57BL/6J小鼠原代下丘腦和海馬組織NSCs,經(jīng)傳代進(jìn)行擴(kuò)增和純化。觀察細(xì)胞形態(tài)表現(xiàn),免疫熒光法檢測NSCs中Nestin和Sox2的表達(dá),采用串聯(lián)質(zhì)譜標(biāo)簽(TMT)蛋白質(zhì)組學(xué)法分析下丘腦和海馬組織NSCs中的差異表達(dá)蛋白質(zhì),對得到的差異蛋白質(zhì)進(jìn)行生物信息學(xué)分析。結(jié)果:形態(tài)表現(xiàn)檢測,下丘腦和海馬組織NSCs均表現(xiàn)出不透明和折光率高的典型神經(jīng)球形態(tài)。免疫熒光檢測,下丘腦和海馬組織NSCs中Nestin和Sox2陽性表達(dá)率隨培養(yǎng)代數(shù)增加而升高,在第4代達(dá)到98%以上,但下丘腦和海馬組織NSCs比較差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。蛋白質(zhì)組學(xué)分析,與海馬組織比較,下丘腦組織NSCs中有6種蛋白表達(dá)水平明顯升高(P<0.05和P<0.01),4種蛋白表達(dá)水平明顯降低(P<0.05和P<0.01);虮倔w(GO)分析,差異蛋白...
【文章來源】:吉林大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2020,46(06)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:9 頁
【部分圖文】:
小鼠來源的P0代下丘腦和海馬組織中NSCs形形態(tài)態(tài)表表現(xiàn)現(xiàn)(Bar=200μm)
P2~P4代下丘腦和海馬組織中NSCs中Nestin和Sox2的陽性表達(dá)率隨著代數(shù)的增加而增加,但下丘腦和海馬組織NSCs中Nestin和Sox2的表達(dá)陽性率比較差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。當(dāng)傳代培養(yǎng)到P2代,下丘腦組織NSCs中Sox2陽性表達(dá)率為(76.87±5.65)%(Sox2+/DPAI),海馬組織NSCs中Sox2陽性表達(dá)率為(80.75±10.76)%;下丘腦組織NSCs中Nestin陽性表達(dá)率為(74.66±9.40)%(Nestin+/DPAI),海馬組織NSCs中Nestin陽性表達(dá)率為(80.72±12.71)%,見圖3。當(dāng)傳代培養(yǎng)到P4代,下丘腦組織NSCs中Sox2陽性表達(dá)率為(98.35±2.58)%,海馬組織NSCs中Sox2陽性表達(dá)率為(99.48±1.06)%;下丘腦組織NSCs中Nestin陽性表達(dá)率為(98.73±1.81)%,海馬組織NSCs中Nestin陽性表達(dá)率為(99.48±1.06)%,見圖4(插頁三)和圖5,即傳代培養(yǎng)可以提升下丘腦和海馬組織NSCs的純化率,因此,本課題組選擇具有較高純度的P4代下丘腦和海馬組織的NSCs用于后續(xù)研究,較高的NSCs比例為蛋白質(zhì)組學(xué)的分析提供了保證。2.4 下丘腦和海馬組織中NSCs質(zhì)譜分析
通過TMT標(biāo)記聯(lián)合LC-MS/MS分析共匹配到131 016個(gè)質(zhì)譜圖,鑒定到42 456個(gè)肽段,38 195個(gè)特異性肽段和5 593種蛋白,對鑒定到的蛋白質(zhì)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析顯示:在下丘腦和海馬組織NSCs中最終得到10種差異蛋白,其中相對于海馬NSCs上調(diào)的蛋白有6種,相對于海馬NSCs下調(diào)的蛋白有4種。見表1。2.5 差異蛋白質(zhì)的GO和KEEG通路分析
本文編號:3410814
【文章來源】:吉林大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2020,46(06)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:9 頁
【部分圖文】:
小鼠來源的P0代下丘腦和海馬組織中NSCs形形態(tài)態(tài)表表現(xiàn)現(xiàn)(Bar=200μm)
P2~P4代下丘腦和海馬組織中NSCs中Nestin和Sox2的陽性表達(dá)率隨著代數(shù)的增加而增加,但下丘腦和海馬組織NSCs中Nestin和Sox2的表達(dá)陽性率比較差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。當(dāng)傳代培養(yǎng)到P2代,下丘腦組織NSCs中Sox2陽性表達(dá)率為(76.87±5.65)%(Sox2+/DPAI),海馬組織NSCs中Sox2陽性表達(dá)率為(80.75±10.76)%;下丘腦組織NSCs中Nestin陽性表達(dá)率為(74.66±9.40)%(Nestin+/DPAI),海馬組織NSCs中Nestin陽性表達(dá)率為(80.72±12.71)%,見圖3。當(dāng)傳代培養(yǎng)到P4代,下丘腦組織NSCs中Sox2陽性表達(dá)率為(98.35±2.58)%,海馬組織NSCs中Sox2陽性表達(dá)率為(99.48±1.06)%;下丘腦組織NSCs中Nestin陽性表達(dá)率為(98.73±1.81)%,海馬組織NSCs中Nestin陽性表達(dá)率為(99.48±1.06)%,見圖4(插頁三)和圖5,即傳代培養(yǎng)可以提升下丘腦和海馬組織NSCs的純化率,因此,本課題組選擇具有較高純度的P4代下丘腦和海馬組織的NSCs用于后續(xù)研究,較高的NSCs比例為蛋白質(zhì)組學(xué)的分析提供了保證。2.4 下丘腦和海馬組織中NSCs質(zhì)譜分析
通過TMT標(biāo)記聯(lián)合LC-MS/MS分析共匹配到131 016個(gè)質(zhì)譜圖,鑒定到42 456個(gè)肽段,38 195個(gè)特異性肽段和5 593種蛋白,對鑒定到的蛋白質(zhì)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析顯示:在下丘腦和海馬組織NSCs中最終得到10種差異蛋白,其中相對于海馬NSCs上調(diào)的蛋白有6種,相對于海馬NSCs下調(diào)的蛋白有4種。見表1。2.5 差異蛋白質(zhì)的GO和KEEG通路分析
本文編號:3410814
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