荸薺CCoAOMT基因的克隆與表達分析
發(fā)布時間:2021-09-24 15:32
咖啡酰輔酶-A-O-甲基轉移酶(CCoAOMT)是植物木質素合成的關鍵酶之一。為探明CCoAOMT在荸薺木質素單體合成過程中的作用,本研究利用RACE技術在荸薺球莖中克隆CCoAOMT基因的全長序列,并對其在不同組織和鮮切荸薺貯藏過程中的表達進行分析。結果表明,克隆得到荸薺CCoAOMT基因cDNA全長1 302 bp,將此基因命名為CwCCoAOMT,其GenBank登錄號為MG719240。該序列包含一個786 bp的最大開放閱讀框,可編碼261個氨基酸,其DNA中包含4個內含子和5個外顯子。該蛋白的分子量為29.17kD,理論等點為5.21。CCoAOMT蛋白二級結構中α-螺旋占37.55%,無規(guī)則卷曲占35.63%,延伸鏈占19.16%,β-折疊結構占7.66%。序列比對和系統(tǒng)進化樹分析表明,Cw CCoAOMT蛋白與其它植物CCoAOMT蛋白序列相似度較高,其中與慈竹的親緣關系最近。通過各組織表達特性分析發(fā)現(xiàn),CwCCoAOMT在荸薺皮中的表達最高,在荸薺肉中的表達最低。在鮮切荸薺貯藏過程中CwCCoAOMT的表達呈快速上升趨勢,而水楊酸處理能顯著抑制CwCCoAOMT表達上...
【文章來源】:分子植物育種. 2020,18(20)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:7 頁
【文章目錄】:
1 結果與分析
1.1 克隆獲得荸薺CCo AOMT基因
1.2 Cw CCo AOMT基因的生物信息學分析
1.3 Cw CCo AOMT組織特異性表達分析
1.4 Cw CCo AOMT在鮮切荸薺貯藏過程中的表達分析
2 討論
3 材料與方法
3.1 試驗材料
3.2 總RNA提取
3.3 基因克隆
3.4 基因生物信息學分析
3.5 基因表達分析
作者貢獻
【參考文獻】:
期刊論文
[1]熱處理對抑制鮮切馬蹄褐變效果的研究[J]. 宋慕波,帥良,陳振林,蔡文,段振華,方方. 食品科技. 2017(05)
[2]桂花查爾酮異構酶OfCHI基因的克隆與表達分析[J]. 張水明,涂佳麗,阿不都熱扎克·依沙克,李川微,戶倩,陳磊,董麗麗. 西北植物學報. 2016(09)
[3]酚類物質代謝與鮮切茭白褐變和木質化的關系研究[J]. 羅海波,陳偉,王曉晴,葉美玲,馮曉娥,王春芳. 食品科技. 2015(06)
[4]‘碭山酥梨’果實CCoAOMT基因的克隆與表達分析[J]. 王丹陽,高付永,孫煒,芮偉康,Khanizadeh Shahrokh,張紹鈴,陶書田. 南京農業(yè)大學學報. 2015(01)
[5]柚CCoAOMT基因的克隆與超表達載體構建[J]. 徐玉,潘騰飛,潘東明. 中國農學通報. 2014(25)
[6]赤桉CCoAOMT亞家族的基因克隆及可變剪接分析[J]. 谷振軍,章懷云,張黨權,謝耀堅,何含杰,陳麗莉,彭寬,劉果,楊丹. 林業(yè)科學. 2014(05)
[7]木質素合成關鍵酶咖啡酰輔酶A氧甲基轉移酶的研究進展[J]. 王華美,于延沖,付春祥,周功克,高歡歡. 基因組學與應用生物學. 2014(02)
[8]‘琯溪蜜柚’貯藏期間汁胞�;c木質素代謝的關系[J]. 潘騰飛,朱學亮,潘東明,郭志雄,佘文琴,陳桂信. 果樹學報. 2013(02)
[9]慈竹CCoAOMT基因的克隆及生物信息學分析[J]. 吳曉宇,胡尚連,曹穎,盧學琴,任鵬,周美娟,李曉瑞. 南京林業(yè)大學學報(自然科學版). 2012(03)
[10]外源SA對甜菜幼苗細胞壁HRGP和木質素含量的影響[J]. 陳貴華,張少英. 作物雜志. 2012(02)
本文編號:3408002
【文章來源】:分子植物育種. 2020,18(20)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:7 頁
【文章目錄】:
1 結果與分析
1.1 克隆獲得荸薺CCo AOMT基因
1.2 Cw CCo AOMT基因的生物信息學分析
1.3 Cw CCo AOMT組織特異性表達分析
1.4 Cw CCo AOMT在鮮切荸薺貯藏過程中的表達分析
2 討論
3 材料與方法
3.1 試驗材料
3.2 總RNA提取
3.3 基因克隆
3.4 基因生物信息學分析
3.5 基因表達分析
作者貢獻
【參考文獻】:
期刊論文
[1]熱處理對抑制鮮切馬蹄褐變效果的研究[J]. 宋慕波,帥良,陳振林,蔡文,段振華,方方. 食品科技. 2017(05)
[2]桂花查爾酮異構酶OfCHI基因的克隆與表達分析[J]. 張水明,涂佳麗,阿不都熱扎克·依沙克,李川微,戶倩,陳磊,董麗麗. 西北植物學報. 2016(09)
[3]酚類物質代謝與鮮切茭白褐變和木質化的關系研究[J]. 羅海波,陳偉,王曉晴,葉美玲,馮曉娥,王春芳. 食品科技. 2015(06)
[4]‘碭山酥梨’果實CCoAOMT基因的克隆與表達分析[J]. 王丹陽,高付永,孫煒,芮偉康,Khanizadeh Shahrokh,張紹鈴,陶書田. 南京農業(yè)大學學報. 2015(01)
[5]柚CCoAOMT基因的克隆與超表達載體構建[J]. 徐玉,潘騰飛,潘東明. 中國農學通報. 2014(25)
[6]赤桉CCoAOMT亞家族的基因克隆及可變剪接分析[J]. 谷振軍,章懷云,張黨權,謝耀堅,何含杰,陳麗莉,彭寬,劉果,楊丹. 林業(yè)科學. 2014(05)
[7]木質素合成關鍵酶咖啡酰輔酶A氧甲基轉移酶的研究進展[J]. 王華美,于延沖,付春祥,周功克,高歡歡. 基因組學與應用生物學. 2014(02)
[8]‘琯溪蜜柚’貯藏期間汁胞�;c木質素代謝的關系[J]. 潘騰飛,朱學亮,潘東明,郭志雄,佘文琴,陳桂信. 果樹學報. 2013(02)
[9]慈竹CCoAOMT基因的克隆及生物信息學分析[J]. 吳曉宇,胡尚連,曹穎,盧學琴,任鵬,周美娟,李曉瑞. 南京林業(yè)大學學報(自然科學版). 2012(03)
[10]外源SA對甜菜幼苗細胞壁HRGP和木質素含量的影響[J]. 陳貴華,張少英. 作物雜志. 2012(02)
本文編號:3408002
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