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荸薺CCoAOMT基因的克隆與表達(dá)分析

發(fā)布時(shí)間:2021-09-24 15:32
  咖啡酰輔酶-A-O-甲基轉(zhuǎn)移酶(CCoAOMT)是植物木質(zhì)素合成的關(guān)鍵酶之一。為探明CCoAOMT在荸薺木質(zhì)素單體合成過程中的作用,本研究利用RACE技術(shù)在荸薺球莖中克隆CCoAOMT基因的全長(zhǎng)序列,并對(duì)其在不同組織和鮮切荸薺貯藏過程中的表達(dá)進(jìn)行分析。結(jié)果表明,克隆得到荸薺CCoAOMT基因cDNA全長(zhǎng)1 302 bp,將此基因命名為CwCCoAOMT,其GenBank登錄號(hào)為MG719240。該序列包含一個(gè)786 bp的最大開放閱讀框,可編碼261個(gè)氨基酸,其DNA中包含4個(gè)內(nèi)含子和5個(gè)外顯子。該蛋白的分子量為29.17kD,理論等點(diǎn)為5.21。CCoAOMT蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)中α-螺旋占37.55%,無規(guī)則卷曲占35.63%,延伸鏈占19.16%,β-折疊結(jié)構(gòu)占7.66%。序列比對(duì)和系統(tǒng)進(jìn)化樹分析表明,Cw CCoAOMT蛋白與其它植物CCoAOMT蛋白序列相似度較高,其中與慈竹的親緣關(guān)系最近。通過各組織表達(dá)特性分析發(fā)現(xiàn),CwCCoAOMT在荸薺皮中的表達(dá)最高,在荸薺肉中的表達(dá)最低。在鮮切荸薺貯藏過程中CwCCoAOMT的表達(dá)呈快速上升趨勢(shì),而水楊酸處理能顯著抑制CwCCoAOMT表達(dá)上... 

【文章來源】:分子植物育種. 2020,18(20)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】:7 頁

【文章目錄】:
1 結(jié)果與分析
    1.1 克隆獲得荸薺CCo AOMT基因
    1.2 Cw CCo AOMT基因的生物信息學(xué)分析
    1.3 Cw CCo AOMT組織特異性表達(dá)分析
    1.4 Cw CCo AOMT在鮮切荸薺貯藏過程中的表達(dá)分析
2 討論
3 材料與方法
    3.1 試驗(yàn)材料
    3.2 總RNA提取
    3.3 基因克隆
    3.4 基因生物信息學(xué)分析
    3.5 基因表達(dá)分析
作者貢獻(xiàn)


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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本文編號(hào):3408002

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