荸薺CCoAOMT基因的克隆與表達(dá)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-09-24 15:32
咖啡酰輔酶-A-O-甲基轉(zhuǎn)移酶(CCoAOMT)是植物木質(zhì)素合成的關(guān)鍵酶之一。為探明CCoAOMT在荸薺木質(zhì)素單體合成過程中的作用,本研究利用RACE技術(shù)在荸薺球莖中克隆CCoAOMT基因的全長(zhǎng)序列,并對(duì)其在不同組織和鮮切荸薺貯藏過程中的表達(dá)進(jìn)行分析。結(jié)果表明,克隆得到荸薺CCoAOMT基因cDNA全長(zhǎng)1 302 bp,將此基因命名為CwCCoAOMT,其GenBank登錄號(hào)為MG719240。該序列包含一個(gè)786 bp的最大開放閱讀框,可編碼261個(gè)氨基酸,其DNA中包含4個(gè)內(nèi)含子和5個(gè)外顯子。該蛋白的分子量為29.17kD,理論等點(diǎn)為5.21。CCoAOMT蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)中α-螺旋占37.55%,無規(guī)則卷曲占35.63%,延伸鏈占19.16%,β-折疊結(jié)構(gòu)占7.66%。序列比對(duì)和系統(tǒng)進(jìn)化樹分析表明,Cw CCoAOMT蛋白與其它植物CCoAOMT蛋白序列相似度較高,其中與慈竹的親緣關(guān)系最近。通過各組織表達(dá)特性分析發(fā)現(xiàn),CwCCoAOMT在荸薺皮中的表達(dá)最高,在荸薺肉中的表達(dá)最低。在鮮切荸薺貯藏過程中CwCCoAOMT的表達(dá)呈快速上升趨勢(shì),而水楊酸處理能顯著抑制CwCCoAOMT表達(dá)上...
【文章來源】:分子植物育種. 2020,18(20)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:7 頁
【文章目錄】:
1 結(jié)果與分析
1.1 克隆獲得荸薺CCo AOMT基因
1.2 Cw CCo AOMT基因的生物信息學(xué)分析
1.3 Cw CCo AOMT組織特異性表達(dá)分析
1.4 Cw CCo AOMT在鮮切荸薺貯藏過程中的表達(dá)分析
2 討論
3 材料與方法
3.1 試驗(yàn)材料
3.2 總RNA提取
3.3 基因克隆
3.4 基因生物信息學(xué)分析
3.5 基因表達(dá)分析
作者貢獻(xiàn)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]熱處理對(duì)抑制鮮切馬蹄褐變效果的研究[J]. 宋慕波,帥良,陳振林,蔡文,段振華,方方. 食品科技. 2017(05)
[2]桂花查爾酮異構(gòu)酶OfCHI基因的克隆與表達(dá)分析[J]. 張水明,涂佳麗,阿不都熱扎克·依沙克,李川微,戶倩,陳磊,董麗麗. 西北植物學(xué)報(bào). 2016(09)
[3]酚類物質(zhì)代謝與鮮切茭白褐變和木質(zhì)化的關(guān)系研究[J]. 羅海波,陳偉,王曉晴,葉美玲,馮曉娥,王春芳. 食品科技. 2015(06)
[4]‘碭山酥梨’果實(shí)CCoAOMT基因的克隆與表達(dá)分析[J]. 王丹陽,高付永,孫煒,芮偉康,Khanizadeh Shahrokh,張紹鈴,陶書田. 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2015(01)
[5]柚CCoAOMT基因的克隆與超表達(dá)載體構(gòu)建[J]. 徐玉,潘騰飛,潘東明. 中國農(nóng)學(xué)通報(bào). 2014(25)
[6]赤桉CCoAOMT亞家族的基因克隆及可變剪接分析[J]. 谷振軍,章懷云,張黨權(quán),謝耀堅(jiān),何含杰,陳麗莉,彭寬,劉果,楊丹. 林業(yè)科學(xué). 2014(05)
[7]木質(zhì)素合成關(guān)鍵酶咖啡酰輔酶A氧甲基轉(zhuǎn)移酶的研究進(jìn)展[J]. 王華美,于延沖,付春祥,周功克,高歡歡. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2014(02)
[8]‘琯溪蜜柚’貯藏期間汁胞;c木質(zhì)素代謝的關(guān)系[J]. 潘騰飛,朱學(xué)亮,潘東明,郭志雄,佘文琴,陳桂信. 果樹學(xué)報(bào). 2013(02)
[9]慈竹CCoAOMT基因的克隆及生物信息學(xué)分析[J]. 吳曉宇,胡尚連,曹穎,盧學(xué)琴,任鵬,周美娟,李曉瑞. 南京林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2012(03)
[10]外源SA對(duì)甜菜幼苗細(xì)胞壁HRGP和木質(zhì)素含量的影響[J]. 陳貴華,張少英. 作物雜志. 2012(02)
本文編號(hào):3408002
【文章來源】:分子植物育種. 2020,18(20)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:7 頁
【文章目錄】:
1 結(jié)果與分析
1.1 克隆獲得荸薺CCo AOMT基因
1.2 Cw CCo AOMT基因的生物信息學(xué)分析
1.3 Cw CCo AOMT組織特異性表達(dá)分析
1.4 Cw CCo AOMT在鮮切荸薺貯藏過程中的表達(dá)分析
2 討論
3 材料與方法
3.1 試驗(yàn)材料
3.2 總RNA提取
3.3 基因克隆
3.4 基因生物信息學(xué)分析
3.5 基因表達(dá)分析
作者貢獻(xiàn)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]熱處理對(duì)抑制鮮切馬蹄褐變效果的研究[J]. 宋慕波,帥良,陳振林,蔡文,段振華,方方. 食品科技. 2017(05)
[2]桂花查爾酮異構(gòu)酶OfCHI基因的克隆與表達(dá)分析[J]. 張水明,涂佳麗,阿不都熱扎克·依沙克,李川微,戶倩,陳磊,董麗麗. 西北植物學(xué)報(bào). 2016(09)
[3]酚類物質(zhì)代謝與鮮切茭白褐變和木質(zhì)化的關(guān)系研究[J]. 羅海波,陳偉,王曉晴,葉美玲,馮曉娥,王春芳. 食品科技. 2015(06)
[4]‘碭山酥梨’果實(shí)CCoAOMT基因的克隆與表達(dá)分析[J]. 王丹陽,高付永,孫煒,芮偉康,Khanizadeh Shahrokh,張紹鈴,陶書田. 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2015(01)
[5]柚CCoAOMT基因的克隆與超表達(dá)載體構(gòu)建[J]. 徐玉,潘騰飛,潘東明. 中國農(nóng)學(xué)通報(bào). 2014(25)
[6]赤桉CCoAOMT亞家族的基因克隆及可變剪接分析[J]. 谷振軍,章懷云,張黨權(quán),謝耀堅(jiān),何含杰,陳麗莉,彭寬,劉果,楊丹. 林業(yè)科學(xué). 2014(05)
[7]木質(zhì)素合成關(guān)鍵酶咖啡酰輔酶A氧甲基轉(zhuǎn)移酶的研究進(jìn)展[J]. 王華美,于延沖,付春祥,周功克,高歡歡. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2014(02)
[8]‘琯溪蜜柚’貯藏期間汁胞;c木質(zhì)素代謝的關(guān)系[J]. 潘騰飛,朱學(xué)亮,潘東明,郭志雄,佘文琴,陳桂信. 果樹學(xué)報(bào). 2013(02)
[9]慈竹CCoAOMT基因的克隆及生物信息學(xué)分析[J]. 吳曉宇,胡尚連,曹穎,盧學(xué)琴,任鵬,周美娟,李曉瑞. 南京林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2012(03)
[10]外源SA對(duì)甜菜幼苗細(xì)胞壁HRGP和木質(zhì)素含量的影響[J]. 陳貴華,張少英. 作物雜志. 2012(02)
本文編號(hào):3408002
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