辣椒轉(zhuǎn)錄因子CaNAC23基因的克隆與表達(dá)分析
發(fā)布時(shí)間:2021-09-23 02:16
為分析NAC轉(zhuǎn)錄因子在辣椒發(fā)育及非生物脅迫中的功能,本研究以‘晉尖椒22’為試驗(yàn)材料,克隆獲得CaNAC23基因全長,該基因全長1 899 bp,編碼632個(gè)氨基酸,預(yù)測(cè)分子量約為72.54 kD,等電點(diǎn)為6.26,無序化區(qū)域有7個(gè)。二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)和亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)表明CaNAC23含有一個(gè)保守的NAC結(jié)構(gòu)域,定位于細(xì)胞核。氨基酸序列比對(duì)和進(jìn)化樹分析表明CaNAC23和擬南芥AT3G03200 (NAC045)同源性較高,進(jìn)化上在同一分支。CaNAC23基因的組織表達(dá)特異性和非生物脅迫下的表達(dá)模式結(jié)果表明:CaNAC23在葉片中表達(dá)量最高,其次是根,暗示CaNAC23基因可能參與辣椒葉片或根發(fā)育相關(guān)。CaNAC23能夠被干旱和鹽脅迫誘導(dǎo)表達(dá),推測(cè)其參與調(diào)控辣椒的非生物脅迫調(diào)控。本研究結(jié)果為研究NAC轉(zhuǎn)錄因子在辣椒發(fā)育及非生物脅迫應(yīng)答中的功能提供了參考依據(jù)。
【文章來源】:分子植物育種. 2020,18(12)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:8 頁
【部分圖文】:
CaNAC23 cDNA全長PCR擴(kuò)增
CaNAC23基因cDNA測(cè)序全長序列及氨基酸序列
為了進(jìn)一步了解該蛋白,對(duì)辣椒CaNAC23轉(zhuǎn)錄因子氨基酸序列進(jìn)行了理化性質(zhì)分析,以及蛋白的三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)。氨基酸序列的無序化分析表明:CaNAC23轉(zhuǎn)錄因子整個(gè)氨基酸序列中無序化區(qū)域共有7個(gè),最大無序化區(qū)域是從307位的甘氨酸至444位的絲氨酸共138個(gè)氨基酸殘基,其次為46位到124位,174位~227位,560~589位,490~507位,135~148位,484~488位,總無序化氨基酸數(shù)目為338個(gè),無序化占比53.48%(圖4A)。對(duì)CaNAC23蛋白組成及親水性進(jìn)行分析,結(jié)果表明CaNAC23蛋白由20種氨基酸組成,其中含量最高的為絲氨酸(Ser),含量為8.1%,含量最低的為半胱氨酸(Cys),含量僅為1.7%。脂肪族系數(shù)(Aliphatic amino acid)為70.79;不穩(wěn)定系數(shù)為43.05;親水性平均系數(shù)為-0.611,表現(xiàn)為親水性(圖4B)。
本文編號(hào):3404826
【文章來源】:分子植物育種. 2020,18(12)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:8 頁
【部分圖文】:
CaNAC23 cDNA全長PCR擴(kuò)增
CaNAC23基因cDNA測(cè)序全長序列及氨基酸序列
為了進(jìn)一步了解該蛋白,對(duì)辣椒CaNAC23轉(zhuǎn)錄因子氨基酸序列進(jìn)行了理化性質(zhì)分析,以及蛋白的三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)。氨基酸序列的無序化分析表明:CaNAC23轉(zhuǎn)錄因子整個(gè)氨基酸序列中無序化區(qū)域共有7個(gè),最大無序化區(qū)域是從307位的甘氨酸至444位的絲氨酸共138個(gè)氨基酸殘基,其次為46位到124位,174位~227位,560~589位,490~507位,135~148位,484~488位,總無序化氨基酸數(shù)目為338個(gè),無序化占比53.48%(圖4A)。對(duì)CaNAC23蛋白組成及親水性進(jìn)行分析,結(jié)果表明CaNAC23蛋白由20種氨基酸組成,其中含量最高的為絲氨酸(Ser),含量為8.1%,含量最低的為半胱氨酸(Cys),含量僅為1.7%。脂肪族系數(shù)(Aliphatic amino acid)為70.79;不穩(wěn)定系數(shù)為43.05;親水性平均系數(shù)為-0.611,表現(xiàn)為親水性(圖4B)。
本文編號(hào):3404826
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