細胞分化的DNA復制時序和染色質(zhì)三維結(jié)構(gòu)的動態(tài)調(diào)控
發(fā)布時間:2021-09-18 14:41
真核生物細胞周期是一個復雜而又高度有序的過程。包括細胞的生長、遺傳物質(zhì)的復制,以及將復制產(chǎn)生的染色體分離到其子細胞等過程。DNA復制是該過程的核心事件。細胞分化是單一細胞系經(jīng)過復雜生命活動產(chǎn)生一系列結(jié)構(gòu)功能有明顯差異細胞系的過程。在分化過程中基因的選擇性表達需要特異性的轉(zhuǎn)錄程序,而DNA的復制時序與基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控存在密切聯(lián)系。細胞在分化過程中通過改變DNA復制時序使得分化后細胞的生物功能順利實現(xiàn),這一動態(tài)變化可能與染色質(zhì)的序列、表觀特征以及結(jié)構(gòu)密切相關(guān)。為了驗證這一假設(shè),我們利用染色體構(gòu)像捕獲(Hi-C)等實驗技術(shù)得到的高通量測序數(shù)據(jù),根據(jù)胚胎干細胞與體細胞間復制時序的差異將基因組分為4類:在5類細胞中復制時序保守的早復制域,稱為CE;5類細胞中復制時序保守的晚復制域,稱為CL;在干細胞中晚復制而在4類體細胞中早復制的區(qū)域,稱為LtoE;在干細胞中早復制而在4類體細胞中晚復制的區(qū)域,稱為EtoL。我們從染色質(zhì)的序列特征、表觀特征和染色質(zhì)結(jié)構(gòu)特征三方面分析在分化中復制時序改變和保守區(qū)域的染色質(zhì)特性。首先在染色質(zhì)序列特征層面上,保守的復制域表現(xiàn)出與其復制時序相對應(yīng)的染色質(zhì)特征:早復制域是基...
【文章來源】:華中農(nóng)業(yè)大學湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:59 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
細胞周期中DNA復制起點的空間結(jié)構(gòu)變化(Rivera-MuliaandGilbert2016)
華中農(nóng)業(yè)大學 2019 屆碩士研究生學位(畢業(yè))論文傳物質(zhì)分子量。主要是 Repli-chip 以及 Repli-seq 技tani et al 2008, Ryba et al 2011)主要是使用 5-溴-2-脫氧的 DNA,根據(jù) S 期的不同時期利用熒光激活細胞分選用 BrdU 分離出目標時間點合成的 DNA,最后通過微nsen 等人又對從 BrdU 標記和 FACS 分選獲得的 DNA Repli-seq 技術(shù)(Hansen et al 2010)。通過將 S 期劃分為是 6 個時期(G1、S1、S2、S3、S4、G2)計算早 S 期比。Repli-chip與Repli-seq數(shù)據(jù)在平滑和標準化后具有較
華中農(nóng)業(yè)大學 2019 屆碩士研究生學位(畢業(yè))論文染色體構(gòu)象捕獲是一種用于研究細胞中染色體交互模式的生物技術(shù),而 H術(shù)(Lieberman-Aiden et al 2009) (High-through chromosome conformation captu以細胞核結(jié)構(gòu)為研究對象,利用高通量測序技術(shù)獲得高分辨率的染色質(zhì)相互作譜,結(jié)合生物信息學分析方法探索染色質(zhì)的相互關(guān)系(圖 1.3)。
本文編號:3400323
【文章來源】:華中農(nóng)業(yè)大學湖北省 211工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:59 頁
【學位級別】:碩士
【部分圖文】:
細胞周期中DNA復制起點的空間結(jié)構(gòu)變化(Rivera-MuliaandGilbert2016)
華中農(nóng)業(yè)大學 2019 屆碩士研究生學位(畢業(yè))論文傳物質(zhì)分子量。主要是 Repli-chip 以及 Repli-seq 技tani et al 2008, Ryba et al 2011)主要是使用 5-溴-2-脫氧的 DNA,根據(jù) S 期的不同時期利用熒光激活細胞分選用 BrdU 分離出目標時間點合成的 DNA,最后通過微nsen 等人又對從 BrdU 標記和 FACS 分選獲得的 DNA Repli-seq 技術(shù)(Hansen et al 2010)。通過將 S 期劃分為是 6 個時期(G1、S1、S2、S3、S4、G2)計算早 S 期比。Repli-chip與Repli-seq數(shù)據(jù)在平滑和標準化后具有較
華中農(nóng)業(yè)大學 2019 屆碩士研究生學位(畢業(yè))論文染色體構(gòu)象捕獲是一種用于研究細胞中染色體交互模式的生物技術(shù),而 H術(shù)(Lieberman-Aiden et al 2009) (High-through chromosome conformation captu以細胞核結(jié)構(gòu)為研究對象,利用高通量測序技術(shù)獲得高分辨率的染色質(zhì)相互作譜,結(jié)合生物信息學分析方法探索染色質(zhì)的相互關(guān)系(圖 1.3)。
本文編號:3400323
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