基于ITS和rbcL基因序列探討廣義棒果芥屬植物的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系
發(fā)布時間:2021-08-13 19:27
分子標(biāo)記廣泛應(yīng)用于植物分類學(xué)研究,本研究利用貝葉斯法(bayesian method, BI),依據(jù)核基因ITS序列和葉綠體rbcL基因序列構(gòu)建棒果芥屬的系統(tǒng)發(fā)育樹,分析了廣義棒果芥屬植物的種間親緣關(guān)系。結(jié)果顯示,ITS序列對位排列后長度為619 bp,包含360個信息位點,G+C含量為56.9%;rbcL序列對位后長度為1 152 bp,包含9個信息位點,G+C含量為45.4%。以小花糖果芥為外類群,基于貝葉斯法將ITS和rbcL基因聯(lián)合起來構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,結(jié)果表明系統(tǒng)樹分為3支,第Ⅰ支是紫花棒果芥,第Ⅱ支是大花棒果芥、無腺棒果芥、灰毛棒果芥、黃花棒果芥及青新棒果芥;第Ⅲ支是棒果芥和福海棒果芥。其中,福海棒果芥被聚類到第Ⅲ支,這與形態(tài)學(xué)研究略有分歧。本研究整體上證實了前人將廣義棒果芥劃分成棒果芥屬和爪花芥屬的結(jié)論,并為其它相關(guān)物種的分類提供了理論參考。
【文章來源】:分子植物育種. 2020,18(22)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:6 頁
【部分圖文】:
棒果芥屬rbcL基因序列的比較
圖1 棒果芥屬rbcL基因序列的比較通過系統(tǒng)進(jìn)化樹可以看出:分布于新疆阿爾金山的大花棒果芥與無(少)腺棒果芥聚成一支,并又與灰毛棒果芥聚在一起而形成了阿爾金山的高原類群,大花棒果芥(花黃色)與無腺棒果芥(花紅色)分布于同一居群,只是花色有差異,大花棒果芥占據(jù)了居群的絕對優(yōu)勢,而無腺棒果芥只是零星分布,二者在花期易于區(qū)分,但果期則無法鑒別。Zhou等(2001)記載灰毛棒果芥與前二者的區(qū)別在于:前者植物體僅有星狀毛,而后者具星狀毛及腺毛,通過已有標(biāo)本的觀察可以看出,灰毛棒果芥與前二者一樣在植物體上均無腺毛,只是花萼的頂端才能見到稀疏的腺毛,因此將大花棒果芥、無腺棒果芥和灰毛棒果芥合并為少腺爪花芥(O.eglandulosum Botsch.);黃花棒果芥和青新棒果芥聚在一起,即成為爪花芥(O.violaceum Botsch.),它與少腺爪花芥形成了第Ⅱ分支,說明二者的親源較近。這與Zhou等(2001)的分類一致。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于rbcL和tufA基因的石莼和滸苔系統(tǒng)發(fā)育分析[J]. 姜芳燕,楊寧,菅盼盼,馬軍,黃海. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2018(07)
[2]38個藤本月季品種ITS序列分析[J]. 高鵬華,于文劍,趙芮,王錦. 分子植物育種. 2018(04)
[3]基于ITS序列的中國櫻桃、歐洲甜櫻桃和毛櫻桃種內(nèi)遺傳多樣性及種間關(guān)系分析[J]. 王浩,黃智林,陳濤,張靜,王燕,陳清,湯浩茹,王小蓉. 園藝學(xué)報. 2018(01)
[4]秦巴山區(qū)漆樹nrDNAITS和cpDNA序列分子進(jìn)化特點的分析[J]. 柏國清,李為民,陳昊,黎斌,李思鋒. 植物研究. 2017(04)
[5]基于ITS基因的部分蘭屬序列分析[J]. 何婷婷,柴軍紅. 分子植物育種. 2017(01)
[6]采用多基因聯(lián)合方法鑒定福建長樂和福清產(chǎn)區(qū)馬鈴薯Y病毒株系組成[J]. 沈林林,鄒文超,高芳鑾,詹家綏. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(20)
[7]基于nrDNA ITS和cpDNA trnL-F序列探討薤白的系統(tǒng)地位[J]. 黃德青,李琴琴,周頌東,何興金. 植物分類與資源學(xué)報. 2015(05)
[8]中國馬鈴薯Y病毒的檢測鑒定及CP基因的分子變異[J]. 高芳鑾,沈建國,史鳳陽,方治國,謝聯(lián)輝,詹家綏. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(15)
[9]蘋果輪紋病菌的多基因聯(lián)合鑒定[J]. 賈廣成,周增強(qiáng),侯琿,王麗,朱建蘭. 生物技術(shù)通報. 2013(07)
[10]基于matK、rbcL和ITS序列的5種大葉藻系統(tǒng)發(fā)育研究[J]. 李淵,孫典榮,李文濤,張沛東,江鑫,郭棟,高天翔. 水產(chǎn)學(xué)報. 2011(02)
博士論文
[1]十字花科植物分子系統(tǒng)發(fā)育研究[D]. 趙博.武漢大學(xué) 2010
碩士論文
[1]十字花科棒果芥屬和紫羅蘭屬的系統(tǒng)分類研究[D]. 邱東.新疆農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
本文編號:3341007
【文章來源】:分子植物育種. 2020,18(22)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:6 頁
【部分圖文】:
棒果芥屬rbcL基因序列的比較
圖1 棒果芥屬rbcL基因序列的比較通過系統(tǒng)進(jìn)化樹可以看出:分布于新疆阿爾金山的大花棒果芥與無(少)腺棒果芥聚成一支,并又與灰毛棒果芥聚在一起而形成了阿爾金山的高原類群,大花棒果芥(花黃色)與無腺棒果芥(花紅色)分布于同一居群,只是花色有差異,大花棒果芥占據(jù)了居群的絕對優(yōu)勢,而無腺棒果芥只是零星分布,二者在花期易于區(qū)分,但果期則無法鑒別。Zhou等(2001)記載灰毛棒果芥與前二者的區(qū)別在于:前者植物體僅有星狀毛,而后者具星狀毛及腺毛,通過已有標(biāo)本的觀察可以看出,灰毛棒果芥與前二者一樣在植物體上均無腺毛,只是花萼的頂端才能見到稀疏的腺毛,因此將大花棒果芥、無腺棒果芥和灰毛棒果芥合并為少腺爪花芥(O.eglandulosum Botsch.);黃花棒果芥和青新棒果芥聚在一起,即成為爪花芥(O.violaceum Botsch.),它與少腺爪花芥形成了第Ⅱ分支,說明二者的親源較近。這與Zhou等(2001)的分類一致。
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]基于rbcL和tufA基因的石莼和滸苔系統(tǒng)發(fā)育分析[J]. 姜芳燕,楊寧,菅盼盼,馬軍,黃海. 基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2018(07)
[2]38個藤本月季品種ITS序列分析[J]. 高鵬華,于文劍,趙芮,王錦. 分子植物育種. 2018(04)
[3]基于ITS序列的中國櫻桃、歐洲甜櫻桃和毛櫻桃種內(nèi)遺傳多樣性及種間關(guān)系分析[J]. 王浩,黃智林,陳濤,張靜,王燕,陳清,湯浩茹,王小蓉. 園藝學(xué)報. 2018(01)
[4]秦巴山區(qū)漆樹nrDNAITS和cpDNA序列分子進(jìn)化特點的分析[J]. 柏國清,李為民,陳昊,黎斌,李思鋒. 植物研究. 2017(04)
[5]基于ITS基因的部分蘭屬序列分析[J]. 何婷婷,柴軍紅. 分子植物育種. 2017(01)
[6]采用多基因聯(lián)合方法鑒定福建長樂和福清產(chǎn)區(qū)馬鈴薯Y病毒株系組成[J]. 沈林林,鄒文超,高芳鑾,詹家綏. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2016(20)
[7]基于nrDNA ITS和cpDNA trnL-F序列探討薤白的系統(tǒng)地位[J]. 黃德青,李琴琴,周頌東,何興金. 植物分類與資源學(xué)報. 2015(05)
[8]中國馬鈴薯Y病毒的檢測鑒定及CP基因的分子變異[J]. 高芳鑾,沈建國,史鳳陽,方治國,謝聯(lián)輝,詹家綏. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(15)
[9]蘋果輪紋病菌的多基因聯(lián)合鑒定[J]. 賈廣成,周增強(qiáng),侯琿,王麗,朱建蘭. 生物技術(shù)通報. 2013(07)
[10]基于matK、rbcL和ITS序列的5種大葉藻系統(tǒng)發(fā)育研究[J]. 李淵,孫典榮,李文濤,張沛東,江鑫,郭棟,高天翔. 水產(chǎn)學(xué)報. 2011(02)
博士論文
[1]十字花科植物分子系統(tǒng)發(fā)育研究[D]. 趙博.武漢大學(xué) 2010
碩士論文
[1]十字花科棒果芥屬和紫羅蘭屬的系統(tǒng)分類研究[D]. 邱東.新疆農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
本文編號:3341007
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