噬菌體在微生物中分布較廣。為研究T4類噬菌體在納帕海高原濕地的分布情況,本研究從納帕海濕地分別采集水樣和淤泥土樣,采用g23基因為分子探針,利用MZIA1和MZIA6引物對其進行擴增,共獲得92條基因序列,并與其他不同生境的g23基因進行比對和遺傳多樣性研究。結果顯示,納帕海高原濕地的T4類噬菌體與海洋基因序列相距較遠,而與淡水湖泊和稻田土壤及平原基因序列相距較近。但也有部分序列獨立聚簇,推測其為納帕海地區(qū)的獨有基因序列。本研究充分說明納帕海地區(qū)擁有獨特而豐富的微生物資源,為研究高原淡水湖泊中噬菌體的生態(tài)功能提供了理論依據。 

【文章來源】：基因組學與應用生物學. 2020,39(06)北大核心CSCD

【文章頁數】：7 頁

【部分圖文】：

YW與其他生境氨基酸序列系統(tǒng)發(fā)育樹

圖1 YW與其他生境氨基酸序列系統(tǒng)發(fā)育樹從進化樹可以看出，納帕海濕地獲得的39條序列中，YW樣品序列可以分成3類，1條序列(YW-57)與中國東北稻田相距較近，3條序列與中國東湖和科托克利湖聚成1簇，另一類有7條序列(YW-8,YW-10,YW-15,YW-44,YW-49,YW-52和YW-57)與各生境序列相距剩遠，可以推測為納帕海獨有序列；YN樣品可以分成3簇，其中兩簇共23條序列與南極湖、北極冰川、三江平原濕地聚簇，另一簇5條序列(YN-24,YN-27,YN-38,YN-72和YN-81)沒有與其他生境氨基酸序列聚簇，推測是納帕海濕地的獨有序列。

利用樣點的Chao、Shannon及Simpson指數來表征噬菌體的多樣性(表2),Chao值或Shannon值越大，Simpson值越小，則表明生物多樣性越高。與中國境內的淡水湖泊相比，YN的多樣性最低；YW多樣性高于YN，但是低于東湖的噬菌體多樣性。2 討論

【參考文獻】：
期刊論文
[1]自然環(huán)境中T4型噬菌體g23基因多樣性研究進展[J]. 王光華,劉俊杰,Makoto Kimura.  微生物學報. 2011(06)
[2]基于g23基因的武漢東湖T4類浮游病毒遺傳多樣性[J]. 黃慧珍,程凱,許敏,趙以軍.  中國環(huán)境科學. 2011(03)



本文編號：3332723