基因組編輯技術(shù)及其在合成生物學(xué)中的應(yīng)用
發(fā)布時(shí)間:2021-08-03 08:06
基因組編輯技術(shù)是一種能夠定向修改基因組的強(qiáng)有力工具。近年來,CRISPR/Cas9系統(tǒng)因其易于構(gòu)建、編輯效率高等優(yōu)點(diǎn)逐漸成為應(yīng)用最為廣泛的基因組編輯工具。合成生物學(xué)作為一門整合了工程學(xué)思維以及生物學(xué)原理的新生交叉學(xué)科,在生物學(xué)、醫(yī)學(xué)、化學(xué)、農(nóng)業(yè)、能源和環(huán)境等領(lǐng)域發(fā)揮著重要的作用。合成生物學(xué)對(duì)于DNA等遺傳物質(zhì)的合成、組裝和編輯等操作有著巨大的需求,因此基因組編輯技術(shù)在合成生物學(xué)中有著廣泛的應(yīng)用。本文綜述了以ZFN和TALEN為代表的早期基因組編輯技術(shù),以及新型CRISPR/Cas9基因組編輯技術(shù)的原理、發(fā)展、作用機(jī)制、系統(tǒng)優(yōu)化、衍生技術(shù)以及應(yīng)用。同時(shí)也介紹了基因組編輯技術(shù)在基因表達(dá)調(diào)控、微生物基因編輯和分子記錄等合成生物學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用,并展望了基因組編輯技術(shù)的前景以及在合成生物學(xué)領(lǐng)域的發(fā)展趨勢(shì)。
【文章來源】:合成生物學(xué). 2020,1(04)
【文章頁(yè)數(shù)】:14 頁(yè)
【部分圖文】:
CRISPR系統(tǒng)在合成生物學(xué)中的應(yīng)用
為了更便捷地使用CRISPR/Cas9系統(tǒng),研究人員對(duì)其進(jìn)行了一些優(yōu)化。Jinek等[4]通過一段GAAA序列將cr RNA的3?端與tracr RNA的5?端融合在一起,形成了單鏈引導(dǎo)RNA (single guide RNA,sg RNA),在不影響效率的同時(shí)簡(jiǎn)化了系統(tǒng)組分(圖1)。此外,Zhang課題組[3]對(duì)Sp Cas9蛋白進(jìn)行密碼子優(yōu)化,并加入核定位信號(hào),提高了Sp Cas9蛋白轉(zhuǎn)運(yùn)到哺乳動(dòng)物細(xì)胞核內(nèi)的效率。有研究表明,sg RNA在哺乳動(dòng)物細(xì)胞內(nèi)的表達(dá)水平較低,限制了CRISPR/Cas9系統(tǒng)的應(yīng)用[38]。因此Chen等[39]對(duì)sg RNA的骨架結(jié)構(gòu)進(jìn)行了優(yōu)化:他們將sg RNA莖環(huán)結(jié)構(gòu)中第4個(gè)連續(xù)的U替換為A,避免了PolⅢ啟動(dòng)子的提前終止;同時(shí)他們將sg RNA骨架上的發(fā)夾結(jié)構(gòu)延伸了5對(duì)堿基,以便Sp Cas9與sg RNA的結(jié)合;谝陨系膬(yōu)化,CRISPR/Cas9系統(tǒng)只需要導(dǎo)入Cas9與sg RNA即可實(shí)現(xiàn)高效的基因組編輯。1.2.4 多種CRISPR/Cas系統(tǒng)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Rapid improvement of grain weight via highly efficient CRISPR/Cas9-mediated multiplex genome editing in rice[J]. Rongfang Xu,Yachun Yang,Ruiying Qin,Hao Li,Chunhong Qiu,Li Li,Pengcheng Wei,Jianbo Yang. Journal of Genetics and Genomics. 2016(08)
本文編號(hào):3319262
【文章來源】:合成生物學(xué). 2020,1(04)
【文章頁(yè)數(shù)】:14 頁(yè)
【部分圖文】:
CRISPR系統(tǒng)在合成生物學(xué)中的應(yīng)用
為了更便捷地使用CRISPR/Cas9系統(tǒng),研究人員對(duì)其進(jìn)行了一些優(yōu)化。Jinek等[4]通過一段GAAA序列將cr RNA的3?端與tracr RNA的5?端融合在一起,形成了單鏈引導(dǎo)RNA (single guide RNA,sg RNA),在不影響效率的同時(shí)簡(jiǎn)化了系統(tǒng)組分(圖1)。此外,Zhang課題組[3]對(duì)Sp Cas9蛋白進(jìn)行密碼子優(yōu)化,并加入核定位信號(hào),提高了Sp Cas9蛋白轉(zhuǎn)運(yùn)到哺乳動(dòng)物細(xì)胞核內(nèi)的效率。有研究表明,sg RNA在哺乳動(dòng)物細(xì)胞內(nèi)的表達(dá)水平較低,限制了CRISPR/Cas9系統(tǒng)的應(yīng)用[38]。因此Chen等[39]對(duì)sg RNA的骨架結(jié)構(gòu)進(jìn)行了優(yōu)化:他們將sg RNA莖環(huán)結(jié)構(gòu)中第4個(gè)連續(xù)的U替換為A,避免了PolⅢ啟動(dòng)子的提前終止;同時(shí)他們將sg RNA骨架上的發(fā)夾結(jié)構(gòu)延伸了5對(duì)堿基,以便Sp Cas9與sg RNA的結(jié)合;谝陨系膬(yōu)化,CRISPR/Cas9系統(tǒng)只需要導(dǎo)入Cas9與sg RNA即可實(shí)現(xiàn)高效的基因組編輯。1.2.4 多種CRISPR/Cas系統(tǒng)
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]Rapid improvement of grain weight via highly efficient CRISPR/Cas9-mediated multiplex genome editing in rice[J]. Rongfang Xu,Yachun Yang,Ruiying Qin,Hao Li,Chunhong Qiu,Li Li,Pengcheng Wei,Jianbo Yang. Journal of Genetics and Genomics. 2016(08)
本文編號(hào):3319262
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