目的:以人類心肌特異性表達基因TMEM121為研究部對象,對其編碼蛋白的結(jié)構(gòu)和功能進行預測。方法:利用生物信息學方法對TMEM121蛋白的同源度、二級結(jié)構(gòu)、互作蛋白及功能等進行預測分析。結(jié)果:TMEM121蛋白在進化上高度保守,與猩猩、綠猴、家貓、大鼠及小鼠等的同源度高達96%以上,主要二級結(jié)構(gòu)是α螺旋,無信號肽,定位于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的可能性比較大,具有轉(zhuǎn)運及信號轉(zhuǎn)導等功能。結(jié)論:人類TMEM121基因可能作為轉(zhuǎn)運和信號轉(zhuǎn)導因子與其他蛋白共同作用參與成體心臟功能的調(diào)控。 

【文章來源】：湖南師范大學學報(醫(yī)學版). 2020,17(01)

【文章頁數(shù)】：4 頁

【部分圖文】：

不同物種間TMEM121蛋白的同源度分析

通過SOPHMA程序[5,6]預測人TMEM121蛋白的二級結(jié)構(gòu)（https：//npsa-prabi.ibcp.fr/cgi-bin/npsa＿automat.pl?page=npsa＿sopma.html），發(fā)現(xiàn)由155個氨基酸殘基構(gòu)成的α螺旋結(jié)構(gòu)占整個二級結(jié)構(gòu)的48.59%(155/319），是TMEM12二級結(jié)構(gòu)的主要構(gòu)成原件；無規(guī)則卷曲占29.47%(94/319）；延伸鏈占17.8%(57/319）及β轉(zhuǎn)角站4.08%(13/319）（圖2-A,B）。以上數(shù)據(jù)說明TMEM121蛋白中大部分氨基酸殘基處在一個基本有序的結(jié)構(gòu)中，這有利于執(zhí)行其應有的功能。應用COILS在線軟件對人類TMEM121蛋白進行卷曲螺旋分析，結(jié)果顯示該蛋白不存在任何卷曲（圖2-C）。2.4 人TMEM121蛋白的三級結(jié)構(gòu)預測分析

進一步應用模拉曼圖方法（The Structure Analysis and Verification Server)(http：//services.mbi.ucla.edu/SAVES/）[8]分析該模型的空間結(jié)構(gòu)的合理性，得到圖3-C，結(jié)果顯示預測模型中的大部分氨基酸殘基均在拉曼圖中的紅色核心區(qū)內(nèi)和黃色的合理區(qū)域內(nèi)，說明該模型中的所有氨基酸均形成的二面角均合理可靠，表明該模型的空間結(jié)構(gòu)基本合理。2.5 人TMEM121的相互作用蛋白分析

【參考文獻】：
期刊論文
[1]鐵蛋白重鏈多肽對RAW264.7細胞中凋亡相關(guān)基因表達的影響[J]. 杜軍偉,王遠志,陳創(chuàng)夫,葛陽春.  石河子大學學報(自然科學版). 2010(05)
[2]慢性鼻-鼻竇炎患者嗅覺功能和嗅覺標記蛋白的研究[J]. 高海燕,諸小儂,彭詩東,張呼和,范爾鐘,王鴻,韓德民.  中華耳鼻咽喉科雜志. 2004(08)



本文編號：3289425