蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)（Protein-Protein Interaction Network,PPIN）是由一個(gè)生命有機(jī)體內(nèi)所有蛋白質(zhì)之間的相互作用組成的,具備高度復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)的特性。檢測(cè)PPIN中的功能模塊是蛋白質(zhì)組學(xué)研究中的一個(gè)重要問(wèn)題,不僅對(duì)揭示蛋白質(zhì)功能、了解生物系統(tǒng)的組織結(jié)構(gòu)有重大意義,而且為疾病的預(yù)知、未來(lái)藥物標(biāo)靶的發(fā)現(xiàn)提供理論依據(jù)。為了準(zhǔn)確地識(shí)別PPIN功能模塊,大量計(jì)算方法迅速興起。其中,運(yùn)用群集智能思想來(lái)檢測(cè)功能模塊已成為該領(lǐng)域的一個(gè)研究熱點(diǎn)。本課題探索了一種新穎的群集智能算法——蝙蝠算法針對(duì)PPIN功能模塊檢測(cè)問(wèn)題進(jìn)行研究,并開(kāi)展了以下兩個(gè)方面的工作:（1）蝙蝠算法是一種全局搜索能力較強(qiáng)的群集智能算法,本課題提出了基于蝙蝠算法的蛋白質(zhì)網(wǎng)絡(luò)功能模塊檢測(cè)（BA-FMD）方法,以期在該領(lǐng)域取得不錯(cuò)的效果。首先,該方法結(jié)合PPIN中節(jié)點(diǎn)之間的拓?fù)湫畔⒑凸δ苄畔⒆鳛樗鼈兊南嗨菩远攘?利用相似性度量在搜索空間中隨機(jī)初始化蝙蝠種群,每只蝙蝠所處位置代表一個(gè)候選功能模塊劃分;然后在種群優(yōu)化階段,設(shè)計(jì)了定向局部擾動(dòng)、隨機(jī)擾動(dòng)、基于距離和頻率的自適應(yīng)變異、自然選擇四種尋優(yōu)機(jī)制來(lái)進(jìn)行解的隨機(jī)優(yōu)... 

【文章來(lái)源】：北京工業(yè)大學(xué)北京市 211工程院校

【文章頁(yè)數(shù)】：68 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

酵母菌PPIN示意圖

PPIN 數(shù)據(jù)庫(kù)部分示例artial example of PPIN dat據(jù)庫(kù)有以下幾種：avin等人使用親和純了當(dāng)時(shí)最大的以物理類(lèi)復(fù)合體的個(gè)數(shù)，為n Protein）數(shù)據(jù)庫(kù)[42記錄實(shí)驗(yàn)確定的 PP完整的工具。該數(shù)據(jù)了工具，允許用戶分的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)。n center for Protein之一，由慕尼黑蛋白

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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