蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)（Protein-Protein Interaction Network,PPIN）是由一個生命有機(jī)體內(nèi)所有蛋白質(zhì)之間的相互作用組成的,具備高度復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)的特性。檢測PPIN中的功能模塊是蛋白質(zhì)組學(xué)研究中的一個重要問題,不僅對揭示蛋白質(zhì)功能、了解生物系統(tǒng)的組織結(jié)構(gòu)有重大意義,而且為疾病的預(yù)知、未來藥物標(biāo)靶的發(fā)現(xiàn)提供理論依據(jù)。為了準(zhǔn)確地識別PPIN功能模塊,大量計算方法迅速興起。其中,運用群集智能思想來檢測功能模塊已成為該領(lǐng)域的一個研究熱點。本課題探索了一種新穎的群集智能算法——蝙蝠算法針對PPIN功能模塊檢測問題進(jìn)行研究,并開展了以下兩個方面的工作:（1）蝙蝠算法是一種全局搜索能力較強的群集智能算法,本課題提出了基于蝙蝠算法的蛋白質(zhì)網(wǎng)絡(luò)功能模塊檢測（BA-FMD）方法,以期在該領(lǐng)域取得不錯的效果。首先,該方法結(jié)合PPIN中節(jié)點之間的拓?fù)湫畔⒑凸δ苄畔⒆鳛樗鼈兊南嗨菩远攘?利用相似性度量在搜索空間中隨機(jī)初始化蝙蝠種群,每只蝙蝠所處位置代表一個候選功能模塊劃分;然后在種群優(yōu)化階段,設(shè)計了定向局部擾動、隨機(jī)擾動、基于距離和頻率的自適應(yīng)變異、自然選擇四種尋優(yōu)機(jī)制來進(jìn)行解的隨機(jī)優(yōu)... 

【文章來源】：北京工業(yè)大學(xué)北京市 211工程院校

【文章頁數(shù)】：68 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

酵母菌PPIN示意圖

PPIN 數(shù)據(jù)庫部分示例artial example of PPIN dat據(jù)庫有以下幾種：avin等人使用親和純了當(dāng)時最大的以物理類復(fù)合體的個數(shù)，為n Protein）數(shù)據(jù)庫[42記錄實驗確定的 PP完整的工具。該數(shù)據(jù)了工具，允許用戶分的實驗數(shù)據(jù)。n center for Protein之一，由慕尼黑蛋白

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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