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擬南芥JMJ21基因調(diào)控莖端分生組織發(fā)育的功能研究

發(fā)布時(shí)間:2021-07-14 14:02
  植物地上部分組織和器官的細(xì)胞都來源于莖端分生組織,而莖端分生組織活性的維持依賴于干細(xì)胞分裂與分化活動(dòng)之間的動(dòng)態(tài)平衡,研究莖端分生組織的發(fā)育過程對(duì)于植物的生長發(fā)育具有重要的意義。前期我們鑒定到一個(gè)T-DNA插入突變體jmj21,其莖端分生組織比野生型明顯變小;對(duì)JMJ21的酶活性進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)其可能不具有JMJ家族其他成員的組蛋白去甲基化酶活性;通過jmj21突變體轉(zhuǎn)錄組分析發(fā)現(xiàn),該基因通過調(diào)控WUS和STM的表達(dá)來影響莖端分生組織的發(fā)育。本研究初步解析了JMJ21介導(dǎo)的莖端分生組織發(fā)育的分子機(jī)理。主要結(jié)果如下:(1)通過觀察jmj21突變體的表型,發(fā)現(xiàn)其萌發(fā)10天的小苗較野生型明顯變小;開花后jmj21突變體植株明顯較野生型矮小,且分枝變少;經(jīng)鑒定,JMJ21的T-DNA插入突變體為knock-out突變體,透明觀察其莖端分生組織大小,發(fā)現(xiàn)莖端分生組織明顯小于野生型。觀察JMJ21的表達(dá)模式發(fā)現(xiàn),該基因在莖端分生組織表達(dá)較強(qiáng),且JMJ21蛋白定位于細(xì)胞核中。(2)JMJ21屬于Jumonji C(Jmj C)-Domain containing(JMJ)蛋白家族,是一類典型的組蛋白去甲... 

【文章來源】:山東農(nóng)業(yè)大學(xué)山東省

【文章頁數(shù)】:88 頁

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【文章目錄】:
中文摘要
Abstract
1 前言
    1.1 擬南芥莖端分生組織
        1.1.1 莖端分生組織的結(jié)構(gòu)
        1.1.2 莖端分生組織的起始和維持
    1.2 莖端分生組織活性調(diào)控的分子機(jī)制
        1.2.1 莖端分生組織活性調(diào)節(jié)的關(guān)鍵基因
            1.2.1.1 WUS在莖端分生組織中的功能
            1.2.1.2 STM在莖端分生組織中的功能
            1.2.1.3 CLV3在莖端分生組織中的功能
        1.2.2 維持莖端分生組織活性的調(diào)控途徑
            1.2.2.1 WUS-CLV3 在莖端分生組織發(fā)育過程中的反饋調(diào)節(jié)
            1.2.2.2 WUS-STM在莖端分生組織發(fā)育過程中的協(xié)同作用
        1.2.3 SHD在莖端分生組織中的功能
    1.3 JMJ家族研究進(jìn)展
        1.3.1 JMJ家族功能研究
        1.3.2 JMJ調(diào)控植物的生長發(fā)育
            1.3.2.1 JMJ調(diào)控植物開花
            1.3.2.2 JMJ調(diào)控葉片衰老
            1.3.2.3 JMJ調(diào)控種子萌發(fā)
            1.3.2.4 JMJ調(diào)控芽再生過程
    1.4 本研究的目的和意義
2 材料與方法
    2.1 實(shí)驗(yàn)所用植物材料
        2.1.1 植物材料及其培養(yǎng)條件
        2.1.2 菌株與載體
        2.1.3 實(shí)驗(yàn)用酶及其他生化試劑
        2.1.4 實(shí)驗(yàn)所用主要儀器
        2.1.5 實(shí)驗(yàn)所用PCR引物以及序列測定
        2.1.6 引物序列
    2.2 實(shí)驗(yàn)方法
        2.2.1 擬南芥種子萌發(fā)前的處理
        2.2.2 擬南芥葉片基因組DNA的提取
        2.2.3 實(shí)驗(yàn)所用表達(dá)載體的構(gòu)建
            2.2.3.1 目的基因的克隆
            2.2.3.2 目的片段的回收與檢測
            2.2.3.3 克隆載體與目的片段的連接
            2.2.3.4 大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞Top10的制備
            2.2.3.5 熱激法轉(zhuǎn)化E.coli感受態(tài)細(xì)胞
            2.2.3.6 陽性克隆的篩選及測序
            2.2.3.7 質(zhì)粒DNA的提取
            2.2.3.8 表達(dá)載體的構(gòu)建
            2.2.3.9 目的片段與表達(dá)載體連接
            2.2.3.10 GV3101根瘤農(nóng)桿菌感受態(tài)細(xì)胞轉(zhuǎn)化
        2.2.4 擬南芥轉(zhuǎn)基因植株的獲取
            2.2.4.1 擬南芥遺傳轉(zhuǎn)化
            2.2.4.2 轉(zhuǎn)基因植株鑒定
        2.2.5 擬南芥組織RNA的提取
        2.2.6 反轉(zhuǎn)錄cDNA的合成
        2.2.7 熒光定量PCR
        2.2.8 煙草注射
        2.2.9 蛋白提取
        2.2.10 Western Blot
        2.2.11 GUS染色
        2.2.12 莖端分生組織透明拍照
        2.2.13 低熔點(diǎn)瓊脂糖震蕩切片
        2.2.14 組蛋白甲基化修飾免疫染色
        2.2.15 原位雜交
            2.2.15.1 植物組織的固定與包埋
            2.2.15.2 探針的合成與處理
            2.2.15.3 雜交液的配制
            2.2.15.4 脫蠟與復(fù)水
            2.2.15.5 雜交后處理
            2.2.15.6 信號(hào)的檢測
3 結(jié)果與分析
    3.1 jmj21突變體的表型分析與鑒定
        3.1.1 jmj21突變體的表型分析
        3.1.2 jmj21突變體的鑒定
        3.1.3 jmj21突變體莖端分生組織變小
    3.2 JMJ21的表達(dá)模式分析
        3.2.1 JMJ21蛋白亞細(xì)胞定位
        3.2.2 JMJ21組織表達(dá)模式分析
    3.3 JMJ21的功能分析
        3.3.1 JMJ家族成員進(jìn)化樹分析
        3.3.2 JMJ21組蛋白去甲基化酶的活性分析
    3.4 野生型和jmj21突變體莖端分生組織轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果分析
        3.4.1 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)質(zhì)量分析
        3.4.2 差異表達(dá)基因數(shù)據(jù)分析
        3.4.3 差異表達(dá)基因GO分析
        3.4.4 轉(zhuǎn)錄組測序結(jié)果莖端分生組織相關(guān)基因的韋恩圖分析
        3.4.5 轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)莖端分生組織相關(guān)基因的表達(dá)量分析
    3.5 jmj21突變體中莖端分生組織特征基因的表達(dá)模式分析
        3.5.1 jmj21 突變體中莖端分生組織特征基因WUS的表達(dá)模式分析
        3.5.2 jmj21 突變體中莖端分生組織特征基因STM的表達(dá)模式分析
        3.5.3 jmj21 突變體中莖端分生組織特征基因CLV3 的表達(dá)模式分析
    3.6 JMJ21 基因與莖端分生組織特征基因WUS和 STM的遺傳學(xué)關(guān)系
    3.7 JMJ21 通過調(diào)控SHD的表達(dá)影響莖端分生組織的發(fā)育
4 討論
    4.1 JMJ21 作用于WUS-STM途徑上游調(diào)控莖端分生組織發(fā)育
    4.2 JMJ21 可能不具有JMJ家族的組蛋白去甲基化酶活性
    4.3 JMJ21可能通過其他途徑調(diào)控下游基因表達(dá)
5 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]擬南芥和水稻JMJC蛋白的研究進(jìn)展[J]. 秦巧,張海文,黃榮峰.  生物技術(shù)通報(bào). 2013(10)
[2]JMJ在胚胎發(fā)育中的作用[J]. 柯麗琴,屈順林,楊向東.  生命的化學(xué). 2007(02)



本文編號(hào):3284283

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