香蕉Metacaspases家族基因的鑒定及表達(dá)分析
發(fā)布時間:2021-06-24 03:21
半胱天冬氨酸酶(metacaspases,MC)在植物生長發(fā)育調(diào)控和逆境脅迫的細(xì)胞程序性死亡(PCD)中扮演著重要角色。本研究對香蕉MuMCs基因序列和蛋白序列進(jìn)行生物學(xué)信息分析,采用qTR-PCR技術(shù)對香蕉幼苗中MuMCs進(jìn)行基因表達(dá)分析。結(jié)果表明,香蕉MuMCs具有8個成員,分為2種類型,Ⅰ型MuMC1~MuMC5和Ⅱ型MuMC6~MuMC8;順式調(diào)控元件預(yù)測顯示在MuMCs啟動子區(qū)域存在19種激素和逆境脅迫相關(guān)的順式調(diào)控元件;基因表達(dá)分析發(fā)現(xiàn)Mu MCs具有組織表達(dá)特性,在大部分MuMCs中葉的相對表達(dá)量最高,假莖的次之,根的最低;此外,Mu MCs對鹽脅迫有不同程度的應(yīng)答模式,鹽脅迫后MuMC5和MuMC8相對表達(dá)量最高,MuMC2和MuMC6相對表達(dá)量最低。本研究為深入了解MuMCs基因特點及驗證其生物學(xué)功能提供了理論基礎(chǔ),同時也為進(jìn)一步探究PCD的調(diào)控途徑提供了理論依據(jù)。
【文章來源】:基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2020,39(01)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:14 頁
【部分圖文】:
香蕉MuMCs的基因結(jié)構(gòu)
植物的根是最先感受土壤逆境脅迫的重要部位(Huang et al.,2014),因此植物感受鹽脅迫的最早部位為根系。實驗中采用NaCl人工模擬鹽脅迫,去探討香蕉根系中MuMCs鹽誘導(dǎo)表達(dá)特性。計算分析同上組織表達(dá)特性分析,仍然以0 h的根為對照,將其相對表達(dá)量標(biāo)準(zhǔn)化為1,得到2 h處理和2 h對照各基因相對表達(dá)量(圖5)?傮w來看Mu MCs每個成員中的0、2 h處理和2 h對照之間的相對表達(dá)量均達(dá)到顯著差異水平(p<0.05)。其中MuMC5中處理組相對表達(dá)量最高,達(dá)5.60,說明MuMC5能夠被鹽脅迫誘導(dǎo)表達(dá)上調(diào)。MuMC3和MuMC8中2 h處理和2 h對照都顯著上調(diào),說明2 h對照產(chǎn)生了一定的水分脅迫,這兩個基因?qū)λ置{迫響應(yīng)的強度較低。MuMC2、MuMC6和MuMC7中處理組都顯著下調(diào),最低達(dá)0.37(MuMC6),說明鹽脅迫能負(fù)向調(diào)控這3個基因的表達(dá)。MuMC1和MuMC4中處理組顯著上調(diào),說明鹽脅迫能誘導(dǎo)其表達(dá)上調(diào)。鹽脅迫能誘導(dǎo)Mu MCs在香蕉根中特異性表達(dá),但是不同基因誘導(dǎo)表達(dá)特性和響應(yīng)的強度不同。圖2 香蕉(Mu)和擬南芥(At)多重序列比對
香蕉(Mu)和擬南芥(At)多重序列比對
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]番茄Ⅱ型metacaspase蛋白SlMC7抗體效價檢測及其在果實中表達(dá)特性分析[J]. 王志超,馬秋敏,葉彥雄,溫帥,曹景順,曲桂芹. 北方園藝. 2017(16)
[2]番茄與馬鈴薯TIFY家族基因的鑒定與比較分析[J]. 胡利宗,王俊生,趙錦慧,王秋霞,韓嬌月,紀(jì)秀娥. 分子植物育種. 2017(04)
[3]香蕉葉片響應(yīng)鹽脅迫轉(zhuǎn)錄組分析[J]. 吉福桑,李元元,唐露,王文昌,李新國. 分子植物育種. 2017(03)
[4]陸地棉苯丙氨酸解氨酶家族基因的鑒定及分析[J]. 楊郁文,李雙,黃俊宇,張保龍. 分子植物育種. 2017(04)
[5]西瓜BADH基因序列分析及其乙烯和茉莉酸甲酯誘導(dǎo)表達(dá)特性[J]. 徐子健,孫夢利,龍婭麗,喬飛,黨選民,江雪飛. 分子植物育種. 2017(04)
[6]實時熒光定量檢測鹽脅迫下香蕉幼苗CaM和Ca2+-ATPase基因的相對表達(dá)量[J]. 王文昌,周雙云,喬飛,吉福桑,李元元,李新國. 分子植物育種. 2017(05)
[7]茉莉酸甲酯誘導(dǎo)西瓜ClTPS1基因的表達(dá)特性及其生物學(xué)信息分析[J]. 龍婭麗,徐子健,朱白婢,江雪飛,張文. 分子植物育種. 2016(12)
[8]擬南芥根毛衰老死亡過程的PCD檢測[J]. 李林,譚康,唐秀光,晁曉婷,汶晨曦,白壯東,豐華玲,劉文哲,蘇慧. 植物學(xué)報. 2016(02)
[9]植物Metacaspase研究進(jìn)展[J]. 馬聰,孔維文. 植物學(xué)報. 2012(05)
[10]環(huán)境因子誘導(dǎo)的植物細(xì)胞程序性死亡[J]. 高赟,琴英玉,李紹波. 現(xiàn)代生物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2011(06)
本文編號:3246259
【文章來源】:基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2020,39(01)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:14 頁
【部分圖文】:
香蕉MuMCs的基因結(jié)構(gòu)
植物的根是最先感受土壤逆境脅迫的重要部位(Huang et al.,2014),因此植物感受鹽脅迫的最早部位為根系。實驗中采用NaCl人工模擬鹽脅迫,去探討香蕉根系中MuMCs鹽誘導(dǎo)表達(dá)特性。計算分析同上組織表達(dá)特性分析,仍然以0 h的根為對照,將其相對表達(dá)量標(biāo)準(zhǔn)化為1,得到2 h處理和2 h對照各基因相對表達(dá)量(圖5)?傮w來看Mu MCs每個成員中的0、2 h處理和2 h對照之間的相對表達(dá)量均達(dá)到顯著差異水平(p<0.05)。其中MuMC5中處理組相對表達(dá)量最高,達(dá)5.60,說明MuMC5能夠被鹽脅迫誘導(dǎo)表達(dá)上調(diào)。MuMC3和MuMC8中2 h處理和2 h對照都顯著上調(diào),說明2 h對照產(chǎn)生了一定的水分脅迫,這兩個基因?qū)λ置{迫響應(yīng)的強度較低。MuMC2、MuMC6和MuMC7中處理組都顯著下調(diào),最低達(dá)0.37(MuMC6),說明鹽脅迫能負(fù)向調(diào)控這3個基因的表達(dá)。MuMC1和MuMC4中處理組顯著上調(diào),說明鹽脅迫能誘導(dǎo)其表達(dá)上調(diào)。鹽脅迫能誘導(dǎo)Mu MCs在香蕉根中特異性表達(dá),但是不同基因誘導(dǎo)表達(dá)特性和響應(yīng)的強度不同。圖2 香蕉(Mu)和擬南芥(At)多重序列比對
香蕉(Mu)和擬南芥(At)多重序列比對
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]番茄Ⅱ型metacaspase蛋白SlMC7抗體效價檢測及其在果實中表達(dá)特性分析[J]. 王志超,馬秋敏,葉彥雄,溫帥,曹景順,曲桂芹. 北方園藝. 2017(16)
[2]番茄與馬鈴薯TIFY家族基因的鑒定與比較分析[J]. 胡利宗,王俊生,趙錦慧,王秋霞,韓嬌月,紀(jì)秀娥. 分子植物育種. 2017(04)
[3]香蕉葉片響應(yīng)鹽脅迫轉(zhuǎn)錄組分析[J]. 吉福桑,李元元,唐露,王文昌,李新國. 分子植物育種. 2017(03)
[4]陸地棉苯丙氨酸解氨酶家族基因的鑒定及分析[J]. 楊郁文,李雙,黃俊宇,張保龍. 分子植物育種. 2017(04)
[5]西瓜BADH基因序列分析及其乙烯和茉莉酸甲酯誘導(dǎo)表達(dá)特性[J]. 徐子健,孫夢利,龍婭麗,喬飛,黨選民,江雪飛. 分子植物育種. 2017(04)
[6]實時熒光定量檢測鹽脅迫下香蕉幼苗CaM和Ca2+-ATPase基因的相對表達(dá)量[J]. 王文昌,周雙云,喬飛,吉福桑,李元元,李新國. 分子植物育種. 2017(05)
[7]茉莉酸甲酯誘導(dǎo)西瓜ClTPS1基因的表達(dá)特性及其生物學(xué)信息分析[J]. 龍婭麗,徐子健,朱白婢,江雪飛,張文. 分子植物育種. 2016(12)
[8]擬南芥根毛衰老死亡過程的PCD檢測[J]. 李林,譚康,唐秀光,晁曉婷,汶晨曦,白壯東,豐華玲,劉文哲,蘇慧. 植物學(xué)報. 2016(02)
[9]植物Metacaspase研究進(jìn)展[J]. 馬聰,孔維文. 植物學(xué)報. 2012(05)
[10]環(huán)境因子誘導(dǎo)的植物細(xì)胞程序性死亡[J]. 高赟,琴英玉,李紹波. 現(xiàn)代生物醫(yī)學(xué)進(jìn)展. 2011(06)
本文編號:3246259
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