植物去甲基化酶ROS1的研究進(jìn)展
發(fā)布時(shí)間:2021-04-12 18:29
DNA甲基化狀態(tài)是由從頭合成的甲基化、維持型甲基化和DNA主動(dòng)去甲基化動(dòng)態(tài)調(diào)控的結(jié)果,由不同調(diào)節(jié)途徑靶向各種酶的催化。5-甲基胞嘧啶DNA糖基化酶/裂解酶ROS1(REPRESSOR OF SILENCING1)是一種DNA去甲基化酶,能夠通過啟動(dòng)堿基切除修復(fù)途徑完成DNA主動(dòng)去甲基化。介紹了植物中DNA主動(dòng)去甲基化途徑中的去甲基化酶和調(diào)節(jié)因子;ROS1介導(dǎo)的DNA主動(dòng)去甲基化的途徑;DNA主動(dòng)去甲基化酶ROS1在各種植物不同發(fā)育過程中的作用,包括負(fù)調(diào)控印記基因表達(dá)和種子休眠、調(diào)控水稻籽粒品質(zhì)、影響植物氣孔發(fā)育等。
【文章來源】:生物技術(shù)通報(bào). 2020,36(07)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:10 頁(yè)
【部分圖文】:
植物ROS1同源蛋白系統(tǒng)進(jìn)化
ROS1介導(dǎo)的DNA主動(dòng)去甲基化過程中產(chǎn)生3"羥基后,下游的聚合酶和連接酶可以在這個(gè)缺口填充未甲基化的胞嘧啶。迄今為止,在擬南芥DNA主動(dòng)去甲基化的最后一步中起作用、產(chǎn)生磷酸二酯鍵并連接DNA鏈兩端的DNA連接酶是AtLIG1(圖2),而這個(gè)途徑中的DNA聚合酶作用尚不清楚。LIG1對(duì)于母體印跡基因的去甲基化和活化是必不可少的[22-23]。通過共免疫定位測(cè)定,發(fā)現(xiàn)AtLIG1與核質(zhì)灶中的ROS1共定位,與細(xì)胞核和核質(zhì)中的APE1L共定位,與核質(zhì)中ZDP共定位,表明AtLIG1與ROS1、APE1L、ZDP在DNA主動(dòng)去甲基化途徑中一起發(fā)揮作用[23]。雜合突變體atlig1-1(Col背景)和atlig1-3(C24背景)植株的生長(zhǎng)發(fā)育均出現(xiàn)異常,LIG1的RNAi系也表現(xiàn)出嚴(yán)重的矮化表型,通過亞硫酸氫鹽測(cè)序證實(shí)AtLIG1 RNAi系在CG背景下顯示該基因座處的DNA高甲基化,進(jìn)一步證明AtLIG1是去甲基化過程中的重要組成部分[23]。2 植物體中去甲基化酶ROS1的調(diào)節(jié)機(jī)制
DNA甲基化和DNA去甲基化動(dòng)態(tài)調(diào)控ROS1的表達(dá)。有研究顯示DNA修復(fù)因子——DNA損傷結(jié)合蛋白2(DNA damage-binding protein 2,DDB2)通過與RdDM途徑的調(diào)控因子AGO4相互作用來控制從頭合成的DNA甲基化[40],它刺激甲基化和抑制去甲基化,且能作為ROS1表達(dá)的轉(zhuǎn)錄抑制因子,從而調(diào)節(jié)其DNA甲基化水平。據(jù)報(bào)道,DNA甲基化變化引起的ROS1上調(diào)可以導(dǎo)致DDB2功能障礙[41]。DDB2還直接與2個(gè)下游DNA去甲基化因子ZDP和APE1L相互作用,并刺激它們的活性[42]?傊,DDB2通過對(duì)堿基切除修復(fù)途徑中上游ROS1和下游ZDP和APE1L的影響在一定程度上調(diào)控去甲基化酶ROS1的去甲基化水平。3 植物體中ROS1主動(dòng)去甲基化的生物學(xué)功能
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]A group of SUVH methyl-DNA binding proteins regulate expression of the DNA demethylase ROS1 in Arabidopsis[J]. Xinlong Xiao,Jieqiong Zhang,Tao Li,Xing Fu,Viswanathan Satheesh,Qingfeng Niu,Zhaobo Lang,Jian-Kang Zhu,Mingguang Lei. Journal of Integrative Plant Biology. 2019(02)
[2]A methylated-DNA-binding complex required for plant development mediates transcriptional activation of promoter methylated genes[J]. Qiang-Qiang Zhao,Rong-Nan Lin,Lin Li,She Chen,Xin-Jian He. Journal of Integrative Plant Biology. 2019(02)
本文編號(hào):3133770
【文章來源】:生物技術(shù)通報(bào). 2020,36(07)北大核心CSCD
【文章頁(yè)數(shù)】:10 頁(yè)
【部分圖文】:
植物ROS1同源蛋白系統(tǒng)進(jìn)化
ROS1介導(dǎo)的DNA主動(dòng)去甲基化過程中產(chǎn)生3"羥基后,下游的聚合酶和連接酶可以在這個(gè)缺口填充未甲基化的胞嘧啶。迄今為止,在擬南芥DNA主動(dòng)去甲基化的最后一步中起作用、產(chǎn)生磷酸二酯鍵并連接DNA鏈兩端的DNA連接酶是AtLIG1(圖2),而這個(gè)途徑中的DNA聚合酶作用尚不清楚。LIG1對(duì)于母體印跡基因的去甲基化和活化是必不可少的[22-23]。通過共免疫定位測(cè)定,發(fā)現(xiàn)AtLIG1與核質(zhì)灶中的ROS1共定位,與細(xì)胞核和核質(zhì)中的APE1L共定位,與核質(zhì)中ZDP共定位,表明AtLIG1與ROS1、APE1L、ZDP在DNA主動(dòng)去甲基化途徑中一起發(fā)揮作用[23]。雜合突變體atlig1-1(Col背景)和atlig1-3(C24背景)植株的生長(zhǎng)發(fā)育均出現(xiàn)異常,LIG1的RNAi系也表現(xiàn)出嚴(yán)重的矮化表型,通過亞硫酸氫鹽測(cè)序證實(shí)AtLIG1 RNAi系在CG背景下顯示該基因座處的DNA高甲基化,進(jìn)一步證明AtLIG1是去甲基化過程中的重要組成部分[23]。2 植物體中去甲基化酶ROS1的調(diào)節(jié)機(jī)制
DNA甲基化和DNA去甲基化動(dòng)態(tài)調(diào)控ROS1的表達(dá)。有研究顯示DNA修復(fù)因子——DNA損傷結(jié)合蛋白2(DNA damage-binding protein 2,DDB2)通過與RdDM途徑的調(diào)控因子AGO4相互作用來控制從頭合成的DNA甲基化[40],它刺激甲基化和抑制去甲基化,且能作為ROS1表達(dá)的轉(zhuǎn)錄抑制因子,從而調(diào)節(jié)其DNA甲基化水平。據(jù)報(bào)道,DNA甲基化變化引起的ROS1上調(diào)可以導(dǎo)致DDB2功能障礙[41]。DDB2還直接與2個(gè)下游DNA去甲基化因子ZDP和APE1L相互作用,并刺激它們的活性[42]?傊,DDB2通過對(duì)堿基切除修復(fù)途徑中上游ROS1和下游ZDP和APE1L的影響在一定程度上調(diào)控去甲基化酶ROS1的去甲基化水平。3 植物體中ROS1主動(dòng)去甲基化的生物學(xué)功能
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]A group of SUVH methyl-DNA binding proteins regulate expression of the DNA demethylase ROS1 in Arabidopsis[J]. Xinlong Xiao,Jieqiong Zhang,Tao Li,Xing Fu,Viswanathan Satheesh,Qingfeng Niu,Zhaobo Lang,Jian-Kang Zhu,Mingguang Lei. Journal of Integrative Plant Biology. 2019(02)
[2]A methylated-DNA-binding complex required for plant development mediates transcriptional activation of promoter methylated genes[J]. Qiang-Qiang Zhao,Rong-Nan Lin,Lin Li,She Chen,Xin-Jian He. Journal of Integrative Plant Biology. 2019(02)
本文編號(hào):3133770
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